SARS-CoV-2メタトランスクリプトミクス

コロナウイルスのメタトランスクリプトミクス研究の発展のために、宿主と微生物叢の相互作用の謎を解き明かす

宿主と微生物叢の間の複雑な相互作用を読み解くことで、宿主、微生物叢、ウイルス、およびパスウェイの反応の詳細な洞察を解き明かすことができます。’SARS-CoV-2メタトランスクリプトミクス研究で鼻咽頭組織や肺組織などからのヒトや細菌の混合サンプルで作業する場合、多量の宿主と細菌のrRNAは問題となり、不必要なリードを生む結果となる可能性があります。

SARS-CoV-2メタトランスクリプトミクスでRNA-seqの感度を向上させる

rRNA除去戦略がより効果的になればなるほど、RNA-seqで有効なリードを得る可能性が大きくなります。ユニークな遺伝子発現のリードを最大化するには、QIAseq FastSelect –rRNA HMR KitsとQIAseq FastSelect –5S/16S/23S Kitsを別々に、または組み合わせて使用することにより、ウイルスRNAを保持しつつ、宿主と細菌のrRNAをほんの1時間で95％超除去します。それから、より複雑化した状態と転写産物のカバレッジで、低レベル発現のRNA分子の高感度検出を行うために、QIAseq Stranded Total RNA Lib Kitを使用して質の高いストランド化ライブラリー調製へと進みます。

SARS-CoV-2メタトランスクリプトミクス研究を促進するために、完全なQIAseqワークフローの特異性と効率性の恩恵にあやかりましょう。