two scientists in a laboratory working on computer screens
次世代シークエンシング

SARS-CoV-2のゲノムサーベイランスへのNGSソリューション

新しいウイルス変異株に対する競争には、時間が重要となる

COVID-19パンデミックにおける最近の思わぬ展開は、アルファ、ベータ、ガンマ、デルタ、ミュー、オミクロン系統などの、新型SARS-CoV-2の懸念される変異株(VOC)の出現です。新しい変異株の、免疫応答を回避して、ワクチンの効能を低下させる能力は、未だ脅威であり続けています。そのため、ラボは、集団内で出回っている既存のSARS-CoV-2変異株の目録を作成すると共に、新しい変異株の同定を行うために、できるだけ迅速にサンプルの遺伝子配列決定を迫られています。そのような研究者たちによるSARS-CoV-2ゲノムサーベイランスへの取り組みを加速するための助けとして、当社はウイルスの増幅およびNGSライブラリー調製のために2つのオーダーメイドのソリューションを開発しました。

NGS solutions for Omicron bubble

必要性に合った正しいゲノムサーベイランスのソリューションを手に入れる

サンプルの配列決定がより速くできれば、出回っている変異株の全体像をいっそう速く描くことができ、それにより一歩先を行くことが可能になります。ゲノムサーベイランスのソリューションがどのように貢献するか、ぜひお試しください。

Product Kitbox
QIAseq DIRECT SARS-CoV-2 Kitは、オミクロンを含むすべての既知の懸念される変異株に対応

50%高速のハイスループットNGSソリューションでSARS-CoV-2変異株シークエンシングを加速。QIAseq DIRECT SARS-CoV-2 Kitは、4時間にわたる自動化可能なワークフローを使用して、優れたウイルスゲノムカバレッジを提供し、プラスチック製品の使用量を50%削減し、1つのフローセルレーンで最大768のサンプルのマルチプレックス解析をサポートします。QIAseq DIRECT SARS-CoV-2 Kitの高密度アンプリコンタイリングは、プライマーの再設計戦略やプライマーブースターキットを必要とすることなく、オミクロンおよびデルタ変異株の検出をはじめとする、すべてのVOCに対して堅牢な性能を約束します。

新しいQIAseq DIRECT SARS-CoV-2 Enhancer Kit

QIAseq DIRECT SARS-CoV-2 Enhancer Kitは、QIAseq DIRECT SARS-CoV-2 Kitと組み合わせることで、ワークフローをシンプルにできる一方で、ゲノムのカバレッジを拡大する効果があります。

次のような利点があります:

  • 合理化されたワークフロー:ライブラリーの増幅に先立つ正規化/定量化の必要がありません
  • 向上したゲノムカバレッジと均一性:ウイルスゲノムのコピー数が極めて少ない場合でも、95%を超えるカバレッジ
  • 必要とされるリード数の低減:サンプルあたりの推奨されるクラスターを1/4に低減し、シークエンシングのコストを節約しながらマルチプレックス解析の拡大が可能

QIAseq DIRECT SARS-CoV-2 Kitをご購入いただければ、無償にてQIAseq DIRECT SARS-CoV-2 Enhancer Kitがもらえます。応募条件は次のとおりです。

 

Davida Dmyth working in lab
NGSを使用して、廃液からSARS-CoV-2変異株をフラッシュアウト

Davida Smyth博士が、蔓延しているSARS-CoV-2変異株を検出し、さらに廃水サンプルから新しい突然変異を検出するために、全ゲノムNGSがいかにして貢献したのかを説明します。

ホワイトペーパー:現実世界のCOVIDサンプルからVOCを特定する

カターニア大学(University of Catania)でNicolò Mussoと彼のチームが、QIAseq DIRECT SARS-CoV-2 Kitを使用して、いかにしてさまざまなRNA品質の250のCOVID陽性サンプルを分析し、アルファ、ガンマ、デルタ変異株などの当時地域集団の中で出回っていたVOCの多くを検出したかを知ってください。

Coronavirus poster
Corona virus, COVID-19, virus with antibodies
変異株、サーベイランス、ワクチンの効能:COVID-19パンデミックの中での思わぬ展開
オミクロン変異株の出現を伴ってCOVID-19パンデミックが進化を続ける一方、特に全ゲノムシークエンシングが、広がっている変異株の罹患率の測定用いられています。当社のブログポストでは、SARS-CoV-2変異株検出、廃水検査、ワクチン回避変異株、その他について深く掘り下げています。
なぜQIAseq DIRECT SARS-CoV-2 Kitを選ぶのでしょうか?

効率を最大化し、シークエンシング機能を強化し、優れたカバレッジを確保して変異検出を加速したいなら、当社の超高速、ハイスループット、シングルボックスNGSソリューションをご利用ください。QIAseq DIRECT SARS-CoV-2 Enhancer Kitをご利用いただけるようになりました。これは、 – QIAseq DIRECT SARS-CoV-2 Kitと組み合わせて使用すると – ワークフローをさらに合理化し、サンプルあたりのリード数を減らしながらカバレッジを向上させます。

QIAseq SARS -CoV-2 Primer Panel

ハイブリッドキャプチャーソリューションよりも高速で低インプット要件のスケーラブルな1日ワークフローで、SARS-CoV-2変異株検出とリアルタイムゲノムサーベイランスを迅速化します。QIAseq SARS-CoV-2 Primer Panelは、最適化された公表されているARTIC V3設計に基づき、完全なウイルスゲノムのターゲット濃縮を提供し、以下を可能にします:

  • プライマードロップアウトやプライマーダイマーの影響を低減し、低コピー数であっても、高いカバレッジを達成
  • ハイスループットのIlluminaプラットフォームで、1回のランで最大384のサンプルのマルチプレックス解析が可能
  • 統合されたバイオインフォマティクス解析パイプラインを用いて、系統的分岐を追跡および可視化
スケーラビリティを向上させる最適な組み合わせ

QIAseq SARS-CoV-2 Primer PanelとQIAseq FX DNA Library UDI Kitを組み合わせ、1回のランで最大384のサンプルのマルチプレックス解析が可能

トライアル用キットで始めましょう
ライブラリー調製の自動化および加速化
NGSライブラリー調製の自動化は、いかにしてラボに貢献しますか?
Genomics, QIAseq NGS Solutions, Dr. Mette Christiansen, Aarhus University hospital, COVID-1
種を飛び越えた後のCOVID-19変異のシークエンシング

2020年までに、デンマークでは200人以上がミンクからCOVID-19に感染したとされます。その一方で、ウイルスはそのときまでにそれらの動物の中で変異を続けてきた結果、いくつかの変異株が生まれました。オーフス大学病院(Aarhus University Hospital)のMolecular Medicine(MOMA、分子医学)、Diagnostic NGS Core Facility(診断用NGSコア施設)のMette Christiansen博士は、すべての陽性の症例をシークエンシングすることが、出回っている変異株の全容解明を達成するのにいかに役立ったのか説明しています。QIAGENのNGSテクノロジーがいかにしてこのような取り組みを促進させたのか知ってください。

出版物

進行中のサーベイランス、監視および検査の取り組みを補完するため、ウイルスのシークエンシングを増やすことを呼びかける
世界保健機関、事務局長

ウェビナーをご覧ください

SARS-CoV-2メタトランスクリプトミクスへの洞察を深める
当社の革新的なNGSソリューションがいかにして、SARS-CoV-2メタトランスクリプトミクス研究におけるRNAシークエンシングの感度を向上させることができるのか知ってください。

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写真はすべてCOVID-19が流行する前に撮影されたものです
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