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低インプットおよびFFPEサンプルからのRNA-seqデータの改善

ウェビナーについて

困難なサンプルから遺伝子発現解析を行うために、RNAシークエンシングに注目する研究者が増えています。このようなサンプルには、細針生検、顕微解剖した腫瘍、または1 ng未満のトータルRNAを含むFFPE薄片から分離された高度に断片化したRNA(すなわち、低インプットサンプル)が含まれることがよくあります。研究者が遭遇する最大のボトルネックのひとつは、サンプルの75%以上を占める不要なリボソームRNA(rRNA)をすべて捕捉することなく、完全なトランスクリプトームRNAライブラリーを調製する能力です。現在のrRNA除去法は多くの場合、完全長RNAでのみ使用できるように設計されているか、特異的濃縮プローブでコーディングRNAを捕捉することに依存しています。どちらの方法も時間がかかり、複雑なワークフローが必要な場合があります。

このような課題に対処するため、QIAGENは革新的なrRNA除去技術 – QIAseq FastSelectを開発しました。QIAseq FastSelectは既存のRNAライブラリーキットと連携して、特定のリボソーム転写産物のcDNA合成を阻害し、RNAシークエンスライブラリーから効果的に除去します。RNA断片化後に使用できるように設計されたQIAseq FastSelectは、高品質RNAにも低品質RNAにも適しています。このウェビナーでは、QIAseq FastSelectをさまざまなRNAライブラリーキットやワークフローと組み合わせて、困難なサンプル中のrRNA量を減少させる方法について紹介します。この強力なrRNA除去ソリューションが、シークエンシングコストを増加させることなくRNAシークエンスの感度をいかにして向上させるのかご覧ください。

概要

タイトル:  酵素フリーのリボソームRNA除去キットを使用する低インプットおよびFFPEサンプルからのRNAシークエンスデータ品質の向上

日付:  2022年7月26日、火曜日

時間:  10:00 AM 東部夏時間

期間:  1 時間

Samuel Rulli, Ph.D.

Director, Global Product Management, RNA-seq profiling, NGS assay technologies QIAGEN

Dr. Samuel Rulliは、胃のプロトンポンプについて研究し、2002年にTulane University(チューレーン大学)で分子細胞生物学の博士号を取得しました。Johns Hopkins University(ジョンズ・ホプキンス大学)とNational Cancer Institute(国立がん研究所)でポスドク研修を受けた後、2009年にQIAGENに入社しました。NGSテクノロジーのグローバル製品管理アソシエイトディレクターとして、qPCRとNGSの遺伝子発現解析ソリューションの開発に尽力しています。

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