RNAシークエンス最適化におけるrRNA除去の重要性

RNAシークエンスワークフローに欠けている成分を発見する

QIAseq FastSelectが、ヒトと細菌の混合サンプルから高品質のRNAシークエンスを可能にする

Van Andel InstituteのゲノミクスコアディレクターのDr. Marie Adams博士が、同じRNAサンプルからヒトと細菌の共発現研究のために、質の高いRNAシークエンスデータを作成する課題を克服するのに、いかにQIAseq FastSelect技術が役立ったのかについて説明します。

QIAseq FastSelectは、より確実ながん治療への道を開くのに役立ちます

「QIAseq FastSelectは、私のプロジェクトにおけるRNAシークエンシングで目を見張る成果を上げました。RNAは劣化していてほとんど使用できませんでしたが、QIAseq FastSelectはこのような劣化したサンプル中のリボソームRNAを実際に除去し、シークエンシングライブラリーを改善してくれました。」

Brandon Mistrella、University of Houston's Department of Biology and Biochemistry

ヒューストン大学のがん研究者たちは、FFPEサンプルを扱う際、RNA分解に関連した課題に日常的に直面していました。低収量のRNAサンプル中にリボソームRNAやグロビンmRNAなどの不要なRNA種が存在すると、RNAシークエンシングがさらに複雑になります。QIAseq FastSelectがいかにして研究に変革をもたらし、FFPE RNAから有用なRNAシークエンスデータを取得できるようにしたのかをお読みください。

QIAseq FastSelectにより、低品質のFFPE RNAからRNAシークエンスライブラリーが構築可能に

“ワークフローは非常にシンプルで高速です。サンプルの品質が悪く、量が限られていたため、このような結果が得られるとは期待していませんでした。”　

Dr. Fabienne Desmots-Loyer, Hematology researcher, CHU – Hospital Pontchaillou, Rennes, France

分解レベルが高く、収量が低いため、FFPEサンプル由来のRNAを扱うのは困難なことがあります。レンヌ病院のDr. Fabienne Desmots-Loyerのストーリーを読み、RNAの分解レベルが高く、低収量であるという理由で2カ所の民間ラボから処理を断られていたFFPEがんサンプルから、QIAseq FastSelectがいかにして高品質のライブラリーをもたらし、困難を克服したのかをご覧ください。

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劇的に速く、簡単なrRNA除去

他のrRNA除去メソッドでは数時間かかったり、複数のステップが必要だったり、断片化されていないRNAしか使用できなかったり、あるいは単に十分にrRNAが除去されなかったりしますが、FastSelectメソッドでは、ワークフローが劇的に速く便利になり、FFPEや断片化されたRNAサンプルでも優れた結果が得られます。