Jeder Schritt Ihrer mRNA-Sequenzierung, -Qualitätskontrolle und -Analyse ist auf Erfolg ausgerichtet
Unser mRNA-NGS-Service reichert selektiv Poly-A-Transkripte an, um die Sequenzierungstiefe für codierende mRNAs zu vergrößern, was in der Folge die Sensitivität für nur schwach exprimierte mRNAs verbessert. Zudem bleiben bei der Library Erstellung Informationen darüber erhalten, welcher der beiden DNA-Stränge für die Transkription einer bestimmten RNA verwendet wurde. Diese Informationen machen eine zuverlässigere Transkript-Annotation und den Nachweis der Expression von Antisense-Transkripten möglich. Bei der Datenanalyse werden mitochondriale Transkripte mit Poly-A-Schwanz herausgefiltert, da es sich dabei um sehr häufige Sequenzen handelt.
Die mRNA-Sequenzierung wird für Entdeckungsarbeit und insbesondere die Analyse der differenziellen Genexpression empfohlen. Paired-End-Sequenzierung erhöht den Kartierungsanteil bei schlecht annotierten Genomen und ermöglicht eine deutlich zuverlässigere Identifizierung von Spleiß-Varianten. Wenn das Hauptziel Ihres Projekts jedoch die Untersuchung der differenziellen Genexpression ist, empfehlen wir trotzdem Single-End-Sequenzierung.
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