Sample to Insight 工作流程

微生物样本通常含有复杂的微生物混合物、坚固细胞壁和代谢产物以及其他生物和非生物分子。所有这些组分可以是各种细胞外聚合物，因此具有高度多样化。此等复杂性和稳定性导致微生物样本裂解相当具有挑战性。

为了确保有效的样本破碎，机械均质化至关重要，并且需要避免在分析工作流程中引入偏差

96 孔板中的微生物样本

如何裂解 96 孔板中的困难样本？您该如何去除多余研磨珠并密封孔板以避免泄露和交叉污染？观看视频来找到答案。

PowerBead Pro 板是 QIAGEN 新推出 Pro 试剂盒技术的一部分。采用改进后的 TissueLyser II 珠磨研磨工艺，可实现高通量、高效细菌和真菌裂解。使用包含这些板的 DNeasy 96 PowerSoil Pro Kit，可实现所有土壤和粪便类型的微生物基因组 DNA 提取。

不同来源的样本因其独特的物理、化学和微生物成分及其物质而面临独特的挑战。因此，我们的人类生物医学研究用样本制备试剂盒针对特定样本类型（如肠道、粪便、拭子及更多类型）进行过专门优化。

此外，受专利保护的 Inhibitor Removal Technology® (IRT) 可在纯化过程中去除抑制物。从而可让您获得高产率的纯化核酸，以供用于甚至是严苛的下游应用。

来自环境的样本通常含有复杂的无机和有机材料混合物，如植物材料、昆虫、动物粪便或微生物。这使得环境微生物样本极难裂解和处理。

为了获得可靠的见解，我们的环境和农业研究用样本制备试剂盒针对特定样本类型（如土壤、生物被膜、（废）水、植物及更多类型）进行过专门优化。

此外，受专利保护的 Inhibitor Removal Technology® (IRT) 可在纯化过程中去除抑制物。从而可让您获得高产率的纯化核酸，以供用于甚至是严苛的下游应用。

采用下一代测序（next generation sequencing，NGS）方法，我们可以对微生物群落中的数千种物种同时进行分析。因此，NGS 彻底改变了我们研究人类和环境微生物组的方式。

在创建指定（偏差最小、读取深度最大）的 NGS 文库方面，试剂和引物的选择非常重要。我们不同的试剂盒与各种扩增和测序需求相吻合，以实现均衡的覆盖，获取高品质的读取质量。

用数字 PCR 检测和量化微生物

在具有挑战性的样本中，低水平微生物靶标的存在阻碍了其特异性的检测和监测。这就是数字 PCR 的用武之地：
它不仅具有高度的精确度和灵敏度，可以从各种不同的样本中识别广泛的微生物靶标，包括细菌、真菌、寄生虫、病毒、抗生素耐药性和毒力因子基因。而且，dPCR 能够在不需要标准曲线的情况下对靶标进行绝对定量。

新的 dPCR Microbial DNA Detection Assay 产品组合：

• 可鉴定 > 680 个靶标基因
• 在一个反应中可实现微生物 DNA 和病毒 RNA的共同检测
• 每次反应最多可检测 5 个靶标基因
• 遵循简单且快速的 dPCR 工作流程，约两小时即可完成

使用 real time PCR 进行特异性和灵敏性微生物检测

使用 real time PCR 进行微生物鉴定和分析时，两个要素至关重要：灵敏度和特异性。这些均依赖均匀的 PCR 效率和扩增条件。借助我们已经通过实验验证的微生物 DNA qPCR assay，您通过简单的 qPCR 工作流程即可检测微生物物种、毒力基因或抗生素耐药基因。此外，可以设计定制阵列来评估相关的特定靶标。

理解复杂的微生物基因组数据

只有结构良好且清晰的数据才能帮助您了解正在发生的情况，并使您能够采取行动。然而，
数据的数量和复杂性可能会让人难以承受。

这就是为什么 QIAGEN CLC Genomics Workbench Premium 是一个简单直观的生物信息学平台。它提供了各种工具和可定制的工作流程，以实现从大数据到相关微生物表征的飞跃。