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使用非酶法核糖体 RNA 去除试剂盒提高来自低投入量和 FFPE 样本的 RNA-seq 数据质量

关于网络研讨会

研究人员越来越多地转向利用 RNA 测序对具有挑战性的样本进行基因表达分析。这些样本通常包括穿刺活检、显微解剖的肿瘤或从含有 <1 ng 总 RNA 的 FFPE 切片中分离的高度片段化 RNA(即,低投入量样本)。研究人员遇到的最大瓶颈之一是如何能够在不捕获占样本 75% 以上的所有不必要核糖体 RNA (rRNA) 的情况下制备全转录组 RNA 文库。目前的 rRNA 去除方法通常仅设计用于全长 RNA,或者依赖于使用特异性富集探针捕获相应 RNA。这两种策略都非常耗时且涉及复杂的工作流程。

为了应对这些挑战,QIAGEN 开发了一种创新的 rRNA 去除技术——QIAseq FastSelect。QIAseq FastSelect 可与现有的 RNA 建库试剂盒配套使用,抑制特定核糖体转录物的 cDNA 合成,从而有效地将其从 RNA-seq 文库中去除。QIAseq FastSelect 在 RNA 片段化步骤之后使用,同时适用于高品质和低品质 RNA。在本次网络研讨会上,我们将重点介绍 QIAseq FastSelect 如何与各种 RNA 文库试剂盒及工作流程适配,以减少难处理样本中的 rRNA 量。了解这种强大的 rRNA 去除解决方案如何在不增加测序成本的情况下提高 RNA-seq 灵敏度。

概览

标题:使用非酶法核糖体 RNA 去除试剂盒提高来自低投入量和 FFPE 样本的 RNA-seq 数据质量

日期:2022 年 7 月 26 日,周二

时间:美国东部夏令时间上午 10:00

持续时间:1 小时

Samuel Rulli,博士,

QIAGEN NGS 检测技术 RNA-seq 表达谱分析全球产品管理总监

Samuel Rulli 博士因为在胃质子泵方面的研究于 2002 年获得杜兰大学分子与细胞生物学博士学位。在约翰霍普金斯大学和美国国家癌症研究所接受博士后培训后,他于 2009 年入职 QIAGEN。作为 NGS 技术的全球产品管理副总监,Samuel 在开发 qPCR 和 NGS 的基因表达分析解决方案方面发挥了重要作用。

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