来自液体活检的cfDNA

从生物标志物研究到个体化医疗

 

QIAGEN 的首个癌症研究线上活动将于 11 月 5-6 日举行,聚焦液体活检的cfDNA,面向全世界对该领域感兴趣的研究者。您可以通过 My QIAGEN 加入 QIAGEN 癌症研究社区,观看演讲及讨论。您只需选择任一视频进行一次注册,即可访问所有视频。

cfDNA 分析 – 现状及展望

Ellen Heitzer 博士,澳大利亚格拉茨医科大学人类遗传学研究所液体活检研究室主任

在可操作靶标的检测及肿瘤监测方面,液体活检分子学分析,尤其是无细胞 DNA (cfDNA),是富有吸引力的组织活检替代方案。然而,随着基于下一代测序的检测变得日益复杂,体细胞基因组突变的临床解读已成为一项艰巨任务。市售的 NGS 试剂盒及决策支持平台的有效性以及 cfDNA 在癌症患者管理中的临床效用尚有待证实。本演讲中介绍了数个对不同 cfDNA 分析工作流程进行评估的研究。其中还讨论了阻碍临床实践的问题。

为治疗患者而进行液体活检——仍是一个争议不断的问题吗?
Michael Fleischhacker 博士,德国柏林米特 DRK 诊所

最新版的“S3 Guidelines for Prevention, Diagnostics, Therapy and Follow-up care of lung cancer patients”(《肺癌患者的预防、诊断、治疗和随访医疗 S3 指南》,2018 年 2 月)提议在不同的临床场景下应用液体活检。这一提议反映出了该方法的有效性。在另一方面,我们应该意识到,我们对细胞外核酸基础知识的了解仍然是有限的。我的讲座将围绕这两点展开。

标准化的分析前操作:可靠的诊断、研究及生物库构建的关键所在

Uwe Oelmueller 博士,副总裁,QIAGEN 样本技术欧洲 MDx 开发部主管

样本受损经常会使体外诊断和研究检测结果变得不可靠,甚至无法得出结果。为了解决这个问题,欧盟 Horizon2020 SPIDA4P 联盟正在针对应用在个体化医疗中的工作流程开发和实施 22 个泛欧洲分析前 CEN/技术规范和 ISO/国际标准。这些规范、工作流程和标准将被医学试验室及其客户、诊断开发商及生产商、监管机构、生物库及从事生物医学研究的研究所采用。旨在调查样本结果质量的配套外部质量保证(External Quality Assurance,EQA)计划也已开发出来。SPIDIA4P 致力于落实利益相关者的广泛参与、培训、教育、咨询等事宜,以支持标准的实施。

  • Ellen Heitzer
    Ellen Heitzer 于 2007 年获得了澳大利亚格拉茨医科大学分子生物学博士学位。在牛津大学 Wellcome Trust 人类遗传学中心从事了 6 个月的研究工作后,她获得了终身职位。在 2016 年,她被提拔为副教授。她发表了数篇期刊文章,这些文章反映出她对ccfDNA 和ctDNA 的兴趣。Ellen Heitzer 是澳大利亚液体活检领域的顶尖科研人员之一,她开发了一套可用于 ctDNA 分析的技术。她是拉茨医科大学癌症个体医疗液体活检研究组的领导人。在 2017 年,她被授予了克里斯蒂安•都卜勒实验室奖,以表彰其研究液体活检在早期癌症检测中的应用,其专业学识还受到了国际认可,经常受邀参加国际会议或在国际期刊上评阅书籍章节。
    Ellen Heitzer
  • Michael Fleischhacker
    Michael Fleischhacker 已退出学术界,现在德国柏林米特 DRK 诊所担任研究科研人员。该诊所专攻内科学,专门从事以肺病学和睡眠为主题的研究。他此前曾在位于德国哈勒的大学诊所领导肺病研究实验室。他曾在柏林洪堡大学就读,并获得了位于德国哈勒的马丁路德大学细菌遗传学博士。随后,进行了数年有关人内源性反转录病毒的工作。他于 1988 年开始从事癌症研究,尤其专注于多种不同实体瘤中的突变分析和检测。他在位于洛杉矶的加利福尼亚大学洛杉矶分校作过两年的访问科研人员,从事有关肺癌患者循环肿瘤细胞的研究。自 1996 年起,他一直在从事有关(尤其肺癌患者中的)无细胞核酸的工作。
    Michael Fleischhacker
  • Uwe Oelmueller
    Uwe Oelmueller 博士于 1995 年入职 QIAGEN。他是样本技术部分子诊断技术中心的主任。在 QIAGEN/BD 的合资公司 PreAnalytiX 担任 QIAGEN 管理委员会副主席。该公司致力于开发和出售样本采集、稳定化及从临床样本中纯化核酸的集成系统。Oelmueller 博士曾是欧盟 FP7 合作经费项目 SPIDIA (2008 – 2013) 的协调员,曾协调过欧盟 Horizon 2020 合作和支持行动 SPDIA4P (2017 – 2020)。这两个项目的关注点都是体外诊断分析前工作流程的标准化和改进。他是 ISO/TC 212(临床实验室检测和体外诊断检测系统)和 CEN/TC 140(体外诊断医疗器械)工作组的召集人。于 2017 年在斯德哥尔摩因其在医学实验室质量管理标准开发领域的国际参与而获得了“DIN Honorary Needle”奖。2020 年,在布鲁塞尔因成功将研究结果和创新纳入标准化而获得了 CENCENELEC“Standard and Innovation Technical Body Officers”奖项。
    Uwe Oelmueller
  • Ellen Heitzer
    Ellen Heitzer
  • Michael Fleischhacker
    Michael Fleischhacker
  • Uwe Oelmueller
    Uwe Oelmueller
您希望让自己的研究受到广泛关注吗?
在即将到来的 QIAGEN 癌症研究在线活动中发表演讲

cfDNA 采集/稳定化及样本制备 
主持人:Constanze Kindler

讨论组成员:Martin Schlumpberger 博士、Thorsten Voss 博士、Raphael Werding 博士 

从 QIAGEN 科研人员的专识中获益,他们将解答有关样本采集、稳定化及 cfDNA 提取准备的问题。

cfDNA NGS(SNV、CNV、甲基化标记物)和数据分析
主持人:Mary von Langsdorff

讨论组成员:Markus Storbeck 博士、Peter Hahn 博士、Ioanna Andreou 博士、Leif Schauser 博士、Raphael Werding 

从 QIAGEN 科研人员的专识中获益,他们将解答有关 cfDNA NGS 和数据分析的问题。

cfDNA 数字 PCR
主持人:Ina Scheuerpflug

讨论组成员:Andreas Missel 博士、Oezlem Karalay 博士、Michael Bussmann 博士、Gerald Schock 博士 

从 QIAGEN 科研人员的专识中获益,他们将解答有关采用数字 PCR 进行 cfDNA 分析的问题。
  • Ioanna Andreou
    Ioanna Andreou 博士于 2002 年在德国希尔登入职 QIAGEN。在她当前的 NGS 应用开发副总监职位上,她从事单细胞全基因组/转录组测序、全基因组及靶向甲基化测序 NGS 工作流程的开发工作。在为 QIAGEN 工作之前,Ioanna 曾在科隆大学医院第一内科医学科担任博士后,其工作涉及开发基于免疫毒素的肿瘤疗法。她在弗莱堡大学完成了博士学业,从事的是副肿瘤性神经系统疾病患者中早期肿瘤检测方法的开发工作。
    Ioanna Andreou
  • Michael Bussmann
    Michael Bussman 博士于 2009 年在于利希研究中心获得了博士学位。在 2015 年入职 QIAGEN 之前,他在 MACHEREY-NAGEL(一家化学和生物分子分析产品领域的创新型公司)担任过产品管理职位。在 QIAGEN,他担任过包括应用测试在内的assay 技术组合全球产品管理职位,之后负责过 PCR 系统及 Assay,最近则负责数字 PCR。
    Michael Bussman
  • Peter Hahn
    Peter Hahn 博士从萨尔兰大学获得了细胞和分子病毒学博士学位。他于 2002 年作为科研人员入职 QIAGEN R&D,从事与基因沉默试剂盒及应用相关的工作。2012 年,Peter 开始从事高通量测序试剂盒的开发工作。当前他正在率领一个团队负责全基因组及全外泌体测序应用开发试剂盒。
    Peter Hahn
  • Özlem Karalay
    Özlem Karalay 博士在土耳其中东技术大学就读过分子生物和遗传学专业,并在位于图宾根的马克斯·普朗克发展生物学研究所获得了神经科学硕士学位。她从位于苏黎世的瑞士联邦理工学院 (ETH) 获得了神经科学博士学位。在位于克隆的马克斯·普朗克研究所完成了她的有关老化生物学的博士后研究工作后,她加入了 QIAGEN,且在此以后一直从事有关数字 PCR assay 产品组合(包括突变检测和 CNV assay)的开发工作。
    Dr. Oezlem Karalay
  • Andreas Missel
    Andreas Missel 博士是 QIAGEN 研究与开发部的总监,负责核酸修饰及扩增技术及产品的持续创新,比如用于 QIAGEN 常规和 real-time PCR、RT-PCR、HRM 解决方案及最近的数字 PCR 的试剂和 assay。Missel 博士从慕尼黑大学基因中心获得了分子生物学和生物化学博士学位。他以各种身份在生物技术行业工作了 20 多年。
    Andreas Missel
  • Leif Schauser
    Leif Schauser 博士是 QIAGEN Digital Insights——QIAGEN 的生物信息事业部——生物医学基因组学全球产品管理总监。在 CLC bio 被 QIAGEN 收购之前,Leif 曾在 CLC bio 工作。在担任这些角色之前,他曾是丹麦奥胡斯大学的生物信息学教授,并在英国的诺维奇完成了他的博士后培训。他持有丹麦奥胡斯大学的植物分子遗传学博士学位。
    Leif Schausers
  • Martin Schlumpberger
    Martin Schlumpberger 博士是 QIAGEN 产品开发部总监,重点从事与外泌体和循环、无细胞核酸提取相关的工作。在前任职位上,他成功地在 QIAGEN 领导了不同 RNA 提取产品的开发,其中包括 RNeasy FFPE、RNeasy Plus、AllPrep DNA/RNA、miRNeasy 和 QIAsymphony RNA 试剂盒。在加入 QIAGEN 之前,Martin 在美国旧金山加利福尼亚大学神经退行性疾病研究所担任过博士后研究员。他持有德国斯图加特大学的化学博士学位,高度关注分子生物学和酵母遗传学。
    Martin Schlumpberger, Cancer, speaker, webinar
  • Gerald Schock
    Gerald Schock 博士就读过德国美因茨大学和英国威尔士亚伯大学学院的生物学和生物化学专业。他于 1996 年获得博士学位后加入了 QIAGEN,在负责生命科学检测产品组合之前,他在销售、地区市场营销和全球市场营销部门担任过多个职位,逐渐建立了包括焦磷酸测序仪在内的表观遗传学产品组合,他现在已转到数字 PCR 领域。
    Dr. Gerald Schock
  • Markus Storbeck
    Markus Storbeck 博士于 2017 年在德国希尔登入职 QIAGEN。在他当前的 NGS 技术开发科研人员职位上,他从事针对 Illumina 和 Ion Torrent 测序平台的 NGS 文库制备工作流程及靶标富集技术的开发工作。在就职于 QIAGEN 之前,Markus 曾作为博士后在科隆大学医院人类遗传学研究所从事发现导致罕见遗传疾病的突变的工作。Markus 在 2014 年完成了他的博士学业:神经肌肉及神经退行性疾病中的 mRNA 剪接因子。
    Martin Storbeck
  • Thorsten Voss
    Thorsten Voss 博士是 PreAnalytiX R&D 副总监,重点从事 PAXgene 采集和核酸提取产品的开发。在加入 QIAGEN 之前,Thorsten 作为科研人员在位于科隆的 Artemis Pharmaceuticals 公司工作,并在位于德国凯撒斯劳滕的 IBWF 完成了他的博士后培训。他在明斯特攻读了生物学,持有分子遗传学和微生物学博士学位。
    Thorsten Voss
  • Raphael Werding
    Raphael Werding 于 2004 年获得了(比利时)列日大学的生物科学硕士学位。于 2018 年入职 QIAGEN。在他当前的全球产品经理职位上,他负责与基因组服务产品组合相关的策略规划工作。在加入 QIAGEN 之前,他管理过一个由湿实验室和生物信息学科研人员组成的基因组服务群组。
    Raphael Werding
  • Ioanna Andreou
    Ioanna Andreou
  • Michael Bussman
    Michael Bussmann
  • Peter Hahn
    Peter Hahn
  • Dr. Oezlem Karalay
    Özlem Karalay
  • Andreas Missel
    Andreas Missel
  • Leif Schausers
    Leif Schauser
  • Martin Schlumpberger, Cancer, speaker, webinar
    Martin Schlumpberger
  • Dr. Gerald Schock
    Gerald Schock
  • Martin Storbeck
    Markus Storbeck
  • Thorsten Voss
    Thorsten Voss
  • Raphael Werding
    Raphael Werding