SARS-CoV-2 메타 전사체학

코로나바이러스 메타 전사체 연구 진전을 위해 숙주-마이크로바이옴 상호작용을 풀다

숙주와 그 미생물군집 사이의 복잡한 상호작용을 해독하면 숙주, 미생물체, 바이러스 및 경로 반응에 대한 상세한 통찰력을 얻을 수 있습니다. SARS-CoV-2 메타 전사체학 연구를 위해 비인두, 폐 및 기타 조직에서 얻는 인간 및 박테리아 혼합 검체로 작업하는 경우, 함량이 높은 숙주 및 박테리아 rRNA가 문제가 될 수 있으며 판독이 낭비될 수 있습니다.

SARS-CoV-2 메타 전사체학에서 RNA-seq 민감도 향상

rRNA 제거 전략이 더 효과적일수록 RNA-seq에서 사용 가능한 판독을 달성하는 능력이 향상합니다. 고유한 유전자 발현 판독을 최대화하려면 QIAseq FastSelect –rRNA HMR 키트와 QIAseq FastSelect –5S/16S/23S 키트를 개별적으로 또는 함께 사용하여 바이러스 RNA를 유지하면서 단 1시간 만에 숙주 및 세균 rRNA를 >95% 제거하세요. 그런 다음 복잡성과 전사 범위가 증가된 저발현 RNA 분자의 고감도 검출을 위해 QIAseq Stranded Total RNA Lib Kit를 사용한 고품질, stranded 라이브러리 작성으로 이동합니다.

QIAseq 전체 워크플로우의 특이성과 효율성을 활용하여 SARS-CoV-2 메타 전사체 연구에 속도를 가하세요.

QIAseq FastSelect –rRNA/Globin Kit
QIAseq FastSelect –rRNA/Globin Kit

인간, 마우스, 래트 및 기타 포유류 샘플에서 RNA-seq 라이브러리 작성을 위한 신속한 rRNA 및/또는 글로빈 mRNA 제거

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QIAseq FastSelect –5S/16S/23S Kit
QIAseq FastSelect –5S/16S/23S Kit

박테리아 RNA 샘플에서 RNA-seq 라이브러리 작성을 위한 신속한 5S/16S/23S rRNA 제거

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QIAseq Stranded Total RNA Lib Kit
QIAseq Stranded Total RNA Lib Kit
Illumina 기기에서 NGS 애플리케이션을 위한 stranded 전장 전사체 RNA- Seq 라이브러리 작성
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QIAseq FastSelect –rRNA/Globin Kit

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SARS-CoV-2 메타 전사체학에서 사용 가능한 RNA-seq 판독치 최대화
당사의 빠르고 효율적인 rRNA 제거 솔루션이 연구를 어떻게 변화시킬 수 있는지 알아보세요.
QIAseq 기술로 SARS-CoV-2 돌연변이 판도 파악

이 SARS-CoV-2 계통 발생학 연구에서 QIAseq FastSelect 및 QIAseq FX 기술을 결합하여 인간 rRNA가 없는 NGS 라이브러리를 생성하는 것이 어떻게 더 깊은 통찰력을 얻게 하였는지 알아보세요.

참고 문헌: Hartley et al. (2020) Genomic surveillance of Nevada patients revealed prevalence of unique SARS-CoV-2 variants bearing mutations in the RdRp gene

SARS-CoV-2의 재감염이 가능한가요?

이 연구에서 rRNA 제거에 QIAseq FastSelect를 사용하고 바이러스 유전체 증폭 및 염기서열 분석에 QIAseq FX를 사용하여 SARS-CoV-2 isolates 사이의 유전적 불일치를 밝혀낸 방법을 알아보세요.

참고 문헌: Tillett et al. (2020) Genomic evidence for a case of reinfection with SARS-CoV-2

바이러스, 숙주 반응 및 메타 전사체를 포함한 RNA-seq 애플리케이션을 위한 rRNA 제거
바이러스, 숙주 반응 및 메타 전사체를 포함한 RNA-seq 애플리케이션을 위한 rRNA 제거
발표자: Samuel Rulli, 박사, 부디렉터, RNA-seq 프로파일링, NGS 분석 기술, QIAGEN
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SARS-CoV-2 식별 및 숙주 유전자 발현 연구를 위한 표적 RNA 패널
SARS-CoV-2 식별 및 숙주 유전자 발현 연구를 위한 표적 RNA 패널
발표자: Samuel Rulli, 박사, 부디렉터, RNA-seq 프로파일링, NGS 분석 기술, QIAGEN
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