Circulating cell-free DNA
リキッドバイオプシー

循環セルフリーDNA

cfDNAから洞察を得ます

セルフリーDNA(cfDNA)は、細胞起源ではないバイオフルイド中に見られるDNAです。これは、簡単な血液検査でがんやその他の疾患のバイオマーカーの検出とモニターに使用できる、リアルタイムな情報を持っています。

cfDNAは、まれな突然変異を伴う低濃度で断片化した状態で見つかることが多く、検出したシグナルに確信を持てる高感度で信頼性の高いツールが必要となります。バイオマーカーの発見、移植、NIPT研究のいずれであっても、当社のcfDNA分離および解析用製品は、必要とされる信頼性の高い結果をもたらします。

End to endのNGSワークフローでcfDNAの超希少変異を検出
End to endのNGSワークフローでcfDNAの超希少変異を検出
リキッドバイオプシーサンプルから超希少変異を高感度で検出するためのend to endのワークフローを開発し、0.1% VAFまでの体細胞変異を90%以上の特異性で検出することに成功しました。サンプル処理の手動および自動オプションにより、がん研究、診断法の開発、治療反応性および微小残存病変モニタリング、早期耐性メカニズムのラボを強化することを目指しています。
アプリケーションノートを入手する
分析前の取り扱いからcfDNAの変異の高感度検出まで
分析前の取り扱いからcfDNAの変異の高感度検出まで
この2つのウェビナーシリーズを視聴して、cfDNAの自動分離とdPCRによる絶対変異定量がいかにしてラボの’研究を加速できるのか知りましょう。また、血漿を用いた“セルフリーバリアントシークエンシングと前立腺がん患者の循環腫瘍細胞のAR-V7検査について、Helge Taubert教授にお話をおうかがいします。”
ウェビナーを見る​
テクニカルガイド
テクニカルガイド
採取チューブ、輸送、遠心分離、cfDNAの分離から品質管理に至るまで、テクニカルガイドの助けを借りて各ステップを最適化することができます。分析プロセスががん研究の促進にいかにして貢献するのかご覧ください。
ガイドラインを無償でダウンロード
cfDNA解析の概要
cfDNA解析の概要
当社のcfDNA解析用製品の範囲は、お客様がラボで使用しているアプリケーションと同程度に幅広いものです。研究から診断に至るまで、お客様のアプリケーションに最適な一連の製品を見つけ出すために、製品の選択に役立つこの包括的な支援ツールをダウンロードしてください。
パンフレットをダウンロード
NGSを用いてcfDNAの超希少変異を発見する
NGSを用いてcfDNAの超希少変異を発見する
cfDNAから、超希少変異体をお探しですか? 当社のQIAseq Targeted cfDNA Ultra Panelsは合理化された8時間のワークフローを使って、cfDNAから変異アレル頻度(VAF)0.1%までの超希少変異を検出できます。
金鉱を掘り当てる
貴重なサンプル、とらえどころのないcfDNA

低濃度で検出されるcfDNAは、非進行性、非転移性がんでは、わずか1~2%の循環腫瘍DNA(ctDNA)しか含んでいません。高いバックグラウンドノイズから低濃度のcfDNAを分離するには、大量の開始量を取り扱う必要があります。高感度で信頼性の高い検出と分析を行うには、高い収量と純度が必要です。

高感度検出と絶対定量

cfDNA解析ワークフローの標準化を進めるステップには、最適な純度と収量を確保するための血液保存と自動cfDNA分離が含まれます。最適化されたバイオインフォマティクスパイプラインと酵素エラー率の低減により、cfDNAから変異アレル頻度が低い変異を確実に検出することで、強力な発見が可能になります。超低濃度のcfDNAバイオマーカーのバイオマーカーバリデーションと絶対定量は、dPCRによって2時間以内に再現性のある結果が得られることで達成できます。

cfDNA解析の詳細

採血と安定化から始まり、専用のcfDNA調製から次世代シークエンシングやデジタルPCRによるさまざまなアプリケーションのための統合データ分析ソリューションに至るまで、分子解析ワークフローに沿った包括的なワークフローソリューションは、サンプル量、スループット、アウトソーシングのニーズに合わせ拡張可能です。

ワークフローに沿った製品

サンプル採取と安定化
サンプル採取と安定化
事前解析処理を標準化するためのシングルチューブ採血、安定化、輸送、および保管
安定化のための製品を見る
セルフリーDNA調製
セルフリーDNA調製
ダウンストリームアプリケーションで高感度を達成するために最適化した、cfDNA調製用の手動およびロースループット、ミディアムスループット、ハイスループット自動化ソリューションを完全網羅したポートフォリオ
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NGS
NGS
さまざまなアプリケーション向けの次世代シークエンシングライブラリの調製またはデジタルPCR解析ソリューション:突然変異解析、全ゲノムシークエンシング、CNVおよびメチル化解析
研究用の製品を見る
デジタルPCR
デジタルPCR
突然変異解析、CNV、メチル化解析など、さまざまなアプリケーション向けのデジタルPCR解析ソリューション
デジタルPCR製品を見る
データ分析
データ分析
柔軟なアクセスが可能な完全なNGSおよび‘オミクスデータ解析ツール。ヒトのエクソーム、ゲノム、大規模コホートシークエンシングデータのための、迅速でエビデンスに基づいた変異アノテーション。
解析用の製品を見る
解釈
解釈
生物学的仮説の作成。フォローアップのための変異の同定と優先順位付け。
解釈用の製品を見る

サポートが必要ですか?当社のサービスにアクセスしてください

当社のGenomic Servicesを利用すると、下記が可能になります。
  • 社内リソースを迅速かつ便利に拡張
  • 当社の専門知識により、高品質なデータを保証
  • プロジェクトの時間のかかる部分だけ、あるいはSample to Insightの全行程をサポート
  • 専門家に相談し、目標達成に向けた最善の決定を行う
genomic services
Genomic Servicesにお問い合わせください
利用可能なオプションの詳細を確認し、当社の専門家にご相談ください。
さまざまな開始量、処理時間、スループットのニーズに合わせて、さまざまな手動または自動cfDNA分離システムを利用できます。アプリケーションに合わせてcfDNAを分離する最適な製品の組み合わせを選択するには、図を参照するか、dPCRや次世代シークエンシングによるcfDNA解析やデータ解釈システムに関する情報を含むパンフレットをダウンロードしてください。

研究アプリケーション用の製品を選ぶ

Select-products-for-research-applications

診断アプリケーション用の製品を選ぶ

Select-products-for-diagnostic-applications

大量の開始量からcfDNAを分離

血漿や尿などの体液中のcfDNAの濃度は通常低く、個人差が大きく、1~50 ng/mlというのが普通です。一般的には、血液採取チューブ1本の全血漿量に相当する4 mlのインプット量を使用します。ターゲットDNA、アプリケーション、ダウンストリームアッセイの感度によって、必要なサンプルインプット量は1~10 mlの範囲でさまざまです。当社は、ダウンストリームのNGSおよびPCR分析で高感度を実現できるように、高速ワークフローと、さまざまなサンプルインプットから比類ないcfDNA濃度を提供するさまざまなcfDNA精製キットをご用意しています。
QIAamp MinElute ccfDNA Midi Kit
QIAamp MinElute ccfDNA Midi Kit
最大10 mlのヒト血漿または血清からセルフリーDNAを分離
製品ページを表示
EZ1&2 ccfDNA Kit
EZ1&2 ccfDNA Kit
EZ1 Advanced XLまたはEZ2 Connectで、最大8 mlのヒト血漿または血清からセルフリーDNAを自動分離
製品ページを表示
EZ2 Connect
EZ2 Connect
  • 1–24のサンプルからcfDNAを完全自動精製
  • 充填済み試薬カートリッジで再現性と利便性を向上
  • 最大8 mlの完全自動大容量処理で高感度を実現
  • QIAsphere接続により、ラボの外でも生産性を維持
  • オンボードピペッティング、加熱、充填済みカートリッジの自動ピアシングにより、手動ステップを最小化
QIAsymphony SP
QIAsymphony SP
  • 1–96のサンプルの完全自動cfDNAサンプル調製
  • サンプルトラッキングのためのバーコード読み取りによる連続サンプルローディング
  • 精製に必要なすべての試薬を事前充填した、すぐにラン可能な試薬カートリッジ
  • 2 mlおよび4 ml用のバリデーション済みプロトコール、分子生物学アプリケーション用大容量(最大 10 ml)用のカスタムプロトコール
  • サンプルリストのインポートとサンプルシートのエクスポート
  • 一次チューブ取り扱いオプションにより、一次血液採取チューブの直接処理が可能
QIAcube Connect
QIAcube Connect
  •  DNA、RNA、タンパク質サンプル処理用の140以上の標準プロトコールを搭載した80以上のQIAGENキットの自動化
  • 最大10 mlのインプット量
  • 最小溶出量20μlによる高濃度
  • QIAsphere対応:QIAsphereアプリでランを遠隔モニターし、迅速な応答が可能

非常にまれな現象を含むcfDNA溶出液を分析すると想像してみてください。セルフリーDNA解析ワークフローに可能な限り多くの量をインプットしたいと思うかもしれません。EZ2 Connectでの最大8 mlの血漿サンプル処理とQIAcuityでの大量の溶出液ロードを組み合わせます。

2つによりもたらされる力について考えたことがありますか?

EZ2 ConnectとQIAcuityによるcfDNA解析

最大8 mlの血漿または血清からcfDNAを完全自動分離
最大8 mlの血漿または血清からcfDNAを完全自動分離
cfDNA溶出液
cfDNA溶出液
dPCR反応用に、QIAcuity Nanoplate 26Kに最大28 µlの溶出液をロード
dPCR反応用に、QIAcuity Nanoplate 26Kに最大28 µlの溶出液をロード

より多くの量の血清や血漿からcfDNAを分離し、デジタルPCRのような高感度検出法で大量の溶出液をロードすると、より多くロードし、より多く見ることができます。より多くの量を処理すると、より多くのテンプレートcfDNAが得られ、dPCRはより多くの突然変異を検出できます。EZ2 Connectによる簡単なサンプル処理とQIAcuity dPCRシステムを組み合わせることで、この目標を達成できます。

EZ2 Connectでの完全自動化された便利な大量サンプル処理と、QIAcuityでのデジタルPCRを用いた高速かつ高感度な超低量突然変異検出の組み合わせが可能になりました。

2つの力をダウンロード

EZ2 Connect
dna rna purification instruments equipment
EZ2 Connect
試薬セットアップから溶出まで、より多くの核酸抽出の工程を自動化
QIAcuityデジタルPCRシステム
instruments and automation pcr instruments
QIAcuityデジタルPCRシステム
ナノプレートを使用するデジタルPCRアプリケーション向け
自分の目で確認
2つの力を実感する最良の方法は、自分で試してみることです。ご自分のラボにデモをご希望の方は、フォームに必要事項をご記入ください。
dPCRとNGSによる高感度突然変異検出
dPCRとNGSによる高感度突然変異検出
EZ1&2 ccfDNAワークフローにより、最大8 mLの大容量血漿からの完全自動化されたcfDNA抽出が可能になります。
ポスターをダウンロード
リキッドバイオプシーバイオマーカー
リキッドバイオプシーバイオマーカー
PreAnalytiXとQIAGEN R&Dによる科学ポスターをお読みください:リキッドバイオプシーがんバイオマーカーアプリケーションのためのリキッドバイオプシー採血、ccfDNA安定化、精製システムの検証。
ポスターをダウンロード
大量のcfDNA分離
大量のcfDNA分離
cfDNA分離用のEZ2 Connect装置でのプロトコールを開発しました。大量のリキッドバイオプシーの処理:cfDNA分離およびCTC濃縮とその後のmRNA分離。
ポスターをダウンロード

 cfDNA専門家から学ぶ

ウェビナーを視聴すると、がん研究者やcfDNA解析技術専門家から洞察を得ることができます。ここでは、最も人気のあるcfDNA関連の講演とQ&Aセッションをご用意しました。

製品

PAXgene Blood ccfDNA Tube (CE-IVD)
dna rna purification dna purification
PAXgene Blood ccfDNA Tube (CE-IVD)
For collection of whole blood samples and stabilization of circulating cell-free DNA (ccfDNA) from plasma and genomic DNA (gDNA) from the nucleated cellular fraction

迅速な回答と洞察

初心者のための基本
cfDNAとは?

多くの研究は、ctDNAとしても知られるcfDNAのレベルの上昇が、さまざまな疾患、特にがんに苦しむ患者の血液で見られることを示しています。cfDNAは、体細胞変異が存在することから、通常のセルフリーDNAとは異なります。これは、治療効果を判定し、治療方針を決定するための遺伝子マーカーとして使用できます。変異cfDNAのレベルは、がん患者の追跡調査や微小残存病変の検出にも役立ちます。

サンプル採取と安定化
最小採血量はどのくらいですか?

市販の多くのキットでは、血漿とcfDNAをさらに処理するのに、1回の採血で8–10 mlの血液が必要です。同様に、PAXgene Blood ccfDNA Tubeでも、10 mlの採血が必要です。これは、真空チューブに正しく充填したときに、血液1 mlあたり添加する細胞安定化添加剤を0.15 mlに確保するための量です。

採血というと、全血、血清、血漿のどれを指すのでしょうか?

サンプル採取では、PAXgene Blood ccfDNA Tubeをヒト全血採取に使用します。続いて、チューブを用いるプロトコールを使用して血漿を処理できます。その後、 QIAamp Circulating Nucleic Acid Kit –を用いて手動でcfDNAを精製するか、あるいは QIAsymphony PAXgene Blood ccfDNA Kitを用いて自動でcfDNAを精製できます。

PAXgene Blood ccfDNA Tubeに採血用バタフライニードルを使用できますか?

はい。 PAXgene Blood ccfDNA Tubeは、標準的な採血器具で使用できます。サンプル採取手順の詳細については、PAXgene Blood ccfDNA Tubeのハンドブックもご参照ください。

DNAを抽出し、PCRで解析する場合、どのような血液安定剤を使用する必要がありますか?

架橋試薬によるDNAの修飾を防ぐことができれば望ましいです。PAXgene Blood ccfDNA Tubeは、安定化のための架橋結合を含まない独自の代替ソリューションを使用しています。このソリューションにより、gDNAの放出を抑え、溶血を最小限に抑えることができ、–効果的にサンプルの完全性を維持すると同時に– PCR結果を複雑にする可能性のあるDNAの修飾を防ぐことができます。

品質管理
cfDNAの品質を確保するには、どのパラメーターを考慮する必要がありますか?

セルフリーバイオフルイドから精製したcfDNAの品質を評価するとき、以下のパラメーターを考慮する必要があります。

  • cfDNAの精製効率と収量
  • 抽出したcfDNAのサイズパターン
  • PCRやNGSライブラリー調製のようなダウンストリームの酵素プロセスにおける阻害物質がないこと
  • ヌクレアーゼがないこと
  • 細胞汚染や溶血によるgDNAの存在の有無
QCはどのような場合に必要ですか?

精製できるcfDNAの量や、精製後に残る阻害物質の量は、サンプルによって異なる可能性があります。標準的なヒト血清または血漿サンプル由来のcfDNAを分析する場合、qPCRまたはNGS実験の前に、収量およびPCR阻害物質が存在しないことをモニターし、–サンプルセットの潜在的な問題を特定するために、すべてのサンプルの品質管理を推奨します。

非常に大量のサンプルを必要とする試験では、少なくともサンプルのサブセットの品質管理が必要です。

尿の採取と安定化を成功させて高品質を確実にするために、抽出したcfDNAプロファイルのサイズを分析します。cfDNAは、約200 bpのフラグメントサイズで表示します。