Enzymes, NGS, Black male scientist looking at test-tube filled with substance in a laboratory setting
分子生物学のための酵素

PCRとDNAの増幅

Taqsは好熱性ですが、最初から熱いのが得意なTaqもあります

ほとんどのin vitro増幅アプリケーションでは、ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)に熱安定酵素を使用します。最もよく使われているPCR酵素はTaq DNAポリメラーゼです。Taq DNAポリメラーゼ( Taq)は70℃以上の温度で生育する好熱性の真正細菌であるThermus aquaticusに由来します。そのため、Taq DNAポリメラーゼ( Taq)の最適な酵素活性が約72℃で得られるのです。 

通常のTaqポリメラーゼの至適温度は72℃で、この酵素は37℃付近から活性を示します。この低温での活性はかなり高く、PCRの最初の低温段階で非特異的増幅やミスプライミングを起こしやすいという欠点があります。PCRの自動化も必要な場合は、hot-start Taqポリメラーゼの使用を検討してください。

Hot-startポリメラーゼは通常のTaqとは異なり、室温では反応しません。Hot-start PCR技術は、従来のPCRと同じ原理ですが、最初の変性ステップが完了するまで酵素活性は抑制されています。これにより、非特異的結合やミスプライミングは最小限に抑えられ、特異性が向上します。さらに、この技術は室温で反応をセットアップできるため非常に便利であり、PCRの自動化が可能になります。特異的な標的の増幅に必要な反応成分が非特異的増幅によって枯渇するのを妨げるので、感度が改善されることもあります。

すべてのTaqポリメラーゼは、以下の用途に適しています。

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反応セットアップ、DNAやRNAの質量モル数換算、溶液量の計算に役立つツールがあります。
通常のPCR、または自動化やハイスループットPCRアプリケーションに適したhot-start酵素を酵素の特性から選択してください。
*StoffelフラグメントTaq DNAポリメラーゼ( Taq)は、遺伝子型決定やプライマー伸長にお勧めです。Stoffel欠失(5’→3’エキソヌクレアーゼ)により酵素の熱安定性がやや向上し、完全長Taqよりもフィデリティがやや高くなります。GC含有率が高く、二次構造を持つテンプレートに非常にお勧めです。定量real-time PCRアッセイでは、シグナルを得るためにTaqManタイプの加水分解プローブをTaq DNAポリメラーゼ( Taq)の5'-ヌクレアーゼ活性によって加水分解する必要があります。一方、Light-Cyclerアッセイのハイブリダイゼーションプローブは加水分解させてはならないため、5’ヌクレアーゼ活性を持たないStoffelフラグメントを使用して定量測定の精度を向上させることができます。

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