Session d’informations sur le cancer

Études multianalytes de biopsies liquides

Vous travaillez avec de l’ADN libre, des vésicules extracellulaires ou des cellules tumorales circulantes (CTC) ? Vous êtes-vous déjà posé la question suivante : Est-ce que l’on manque, voire gâche, des informations génomiques et transcriptomiques en ne s’intéressant qu’à un seul analyte ? Quels changements apporterait la possibilité d’étudier tous ces analytes à partir d’un même échantillon ?

Dans l’étude ELIMA (Evaluation of multiple Liquid biopsy analytes In Metastatic breast cancer patients All from one blood sample), Sabine Kasimir-Bauer et Corinna Keup (Hôpital universitaire d’Essen, Allemagne) se sont attelées au problème et ont développé des procédures puis comparé et analysé les profils d’ARN de cellules tumorales circulantes et de vésicules extracellulaires, elles ont ensuite effectué une analyse mutationnelle de l’ADN libre (ADNlc) à partir de plasma vierge ou appauvri en CTC, et plus encore.

Cette session d’informations sur le cancer inclut des présentations scientifiques de Sabine Kasimir-Bauer, Corinna Keup et une table ronde d’experts avec des scientifiques de QIAGEN. Vous pouvez télécharger votre poster qui vous guidera dans l’utilisation des biopsies liquides multianalytes et accéder à d’autres publications pour approfondir le sujet.

Écoutez la présentation scientifique avec Sabine Kasimir-Bauer, de l’Hôpital universitaire d’Essen, et la participation de Siegfried Hauch, Constanze Kindler et Markus Sprenger-Haussels

Analyse moléculaire des cellules tumorales circulantes, vésicules extracellulaires et acides nucléiques dans les biopsies liquides

L’utilisation de liquides biologiques tels que le sang comme source non invasive de biomarqueurs cellulaires et d’acides nucléiques biomarqueurs serait un « tissu de substitution » idéal pour identifier et suivre les facteurs pronostiques et prédictifs qui faciliteront la sélection de la stratégie thérapeutique optimale pour chaque patient. Sabine Kasimir-Bauer et son équipe se sont attelées au problème et ont comparé et analysé, dans un seul échantillon de sang, les profils d’ARN contenus dans les cellules tumorales circulantes ou les vésicules extracellulaires et effectué une analyse mutationnelle de l’ADN libre (ADNlc) dans des échantillons de plasma (séquençage à haut débit) dans le cadre du suivi de la maladie, afin d’en appréhender l’utilité pour la stratification thérapeutique et de prédire les options thérapeutiques.

Profilage des ARNm de CTC par rapport aux VE : un exemple de synergie

L’analyse des ARN contenus dans les cellules tumorales circulantes (CTC) ou les vésicules extracellulaires (VE) est peut-être suffisamment sensible pour détecter la progression de la maladie plus tôt que les méthodes de stadification visuelles actuelles. Corinna Keup décrit son étude de recherche, comparant les profils d’ARN des CTC et des vésicules extracellulaires (VE) chez les patientes avec cancer du sein métastatique (SCM) afin d’en appréhender l’utilité dans la stratification thérapeutique.

Corinna Keup, Hôpital universitaire d’Essen, avec la participation de Siegfried Hauch, Constanze Kindler et Martin Schlumpberger

Présentée par Corinna Keup, avec la participation de Siegfried Hauch et Markus Storbeck

Séquençage profond ciblé de l’ADNlc : une meilleure appréhension de la pertinence clinique des biopsies liquides

L’ADN libre (ADNlc) est considéré comme le reflet de l’hétérogénéité intratumorale et fournit des indications sur l’évolution clonale améliorant les décisions thérapeutiques. Corinna Keup décrit le séquençage profond ciblé de l’ADNlc d’une cohorte de cancer du sein métastatique (SCM) à récepteurs hormonaux positifs, HER2 négatif afin d’examiner la prévalence et la pertinence des variants et de la dynamique dans le cadre du traitement. Des identifiants moléculaires uniques permettent l’identification des mutations vraies positives dans l’ADNlc.

Profils de variants d’ADNccf et d’ARNm de CTC correspondants : peut-on les obtenir à partir d’un seul tube de sang ?

Les analytes de biopsie liquide tels que l’ADNlc et les CTC sont considérés comme une source d’informations additives, et les échantillons sanguins sont limités. Il est souhaitable de pouvoir isoler l’ADNlc et les CTC dans un format de tube « tout-en-un ». Corinna Keup a cherché à savoir si le séquençage de variants d’ADNlc à partir de sang appauvri en CTC a un impact sur les résultats par rapport au séquençage de variants d’ADNlc de sang total correspondant, et s’il constitue une procédure applicable pour l’évaluation des CTC et de l’ADNtc dans l’analyse d’expression et de mutation à partir d’un même échantillon sanguin.

Présentée par Corinna Keup, avec la participation de Siegfried Hauch, Sabine Kasimir-Bauer, Markus Storbeck et Constanze Kindler

Siegfried Hauch (président de séance), avec la participation d’Ioanna Andreou, Anna Babayan, Eric Lader, Jonathan Shaffer et Markus Storbeck

Présentation en ligne par des experts de QIAGEN

Intérêt des approches multianalytes dans l’analyse de biopsie liquide

Des scientifiques de QIAGEN examinent chacune des étapes de la procédure d’analyse de vésicules extracellulaires, des cellules tumorales circulantes et de l’ADNlc en parallèle, ainsi que les outils que nous pouvons utiliser pour une analyse plus approfondie des données. Cela comprend le séquençage d’ADN ciblé à l’aide d’UMI, les solutions de bio-informatique, le séquençage d’ADN méthylé ciblé, le séquençage de miARN et le profilage simultané de l’ADN et de l’ARN par NGS.

Nos intervenants

S’informer sur les études ELIMA

Keup C. et al. (2018) RNA profiles of circulating tumor cells and extracellular vesicles for therapy stratification of metastatic breast cancer patients. Clinical Chemistry
Keup C. et al. (2019) Targeted deep sequencing revealed variants in cell-free DNA of hormone receptor-positive metastatic breast cancer patients. Cellular and Molecular Life Sciences
Keup C. et al. (2019) Cell-free DNA variant sequencing using CTC-depleted blood for comprehensive liquid biopsy testing in metastatic breast cancer Cancers
Keup C. et al. (2020) Multimodal Targeted Deep Sequencing of Circulating Tumor Cells and Matched Cell-Free DNA Provides a More Comprehensive Tool to Identify Therapeutic Targets in Metastatic Breast Cancer Patients. Cancers

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