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利用IDH1/2 RGQ PCR Kit中的试剂可完成9个独立的扩增反应,检测12种突变:
基因 | 突变 | 碱基变化 | Cosmic ID |
---|---|---|---|
IDH1 | Arg132His | 395G>A | COSM28746 |
Arg132Cys | 394C>T | COSM28747 | |
Arg132Ser | 394C>A | COSM28748 | |
Arg132Gly | 394 C>G | COSM28749 | |
Arg132Leu | 395G>T | COSM28750 | |
Arg132Val | 394_395 CG>GT | COSM28751 | |
Arg100Gln | 299G>A | COSM88208 | |
IDH2 | Arg172Lys | 515G>A | COSM33733 |
Arg172Met | 515G>T | COSM33732 | |
Arg172Trp | 514A>T | COSM34039 | |
Arg172Ser | 516G>T | COSM34090 | |
Arg172Gly | 514A>G | COSM33731 |
Total Primers and Probe Mixes(PPM-Total)使用引物和探针扩增突变型和野生型目标序列。
突变检测引物和探针混合物将引物与探针相结合,同时扩增突变型和野生型目标序列,此为还有一个核苷酸,3'端添加了磷酸基团,以防止延伸(PCR发夹技术),它可以特异性地结合野生型目标序列。
当PCR模板包含野生型序列时,因具有更高的亲合力,3'-磷酸寡核苷酸相比PCR引物的结合更具优势。DNA聚合酶几乎无延伸,且几乎未观察到扩增。
当存在突变序列时,PCR引物结合相比3'-磷酸寡核苷酸结合更具优势,扩增将继续。
ARMS(Amplification Refractory Mutation System)利用DNA聚合酶鉴别PCR引物的3'端是否匹配,实现等位基因特异性的扩增。
当PCR引物完全匹配时,扩增效率最高。当3'碱基不匹配时,仅出现低水平的背景扩增。