Verogen ForenSeq mtDNA Control Region Kit

用于进行方便的文库制备,以对线粒体基因组的控制区进行测序

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Verogen ForenSeq mtDNA Control Region Kit

Cat. No. / ID:  V16000085

包括用于制备完整的 mtDNA 控制区文库的 48 次反应所需的全部主要试剂
Verogen ForenSeq mtDNA Control Region Kit 旨在用于法医鉴定、人类身份识别、亲子鉴定等领域的分子生物学应用场景。该产品不能用于疾病诊断、预防和治疗。

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特点

  • 通过极小的 DNA 输入量实现最佳灵敏度
  • 利用最新数据库中的小扩增子增强变体检测能力
  • 对严重降解样本具有出色的分辨力
  • 多重能力进一步提高了工作效率

产品详情

ForenSeq mtDNA Control Region Kit 提供便捷、高效的文库制备,用于以极少的 DNA 输入量和最佳灵敏度检测线粒体基因组 (mtGenome) 的控制区。该试剂盒利用成熟可靠的 ForenSeq 化学试剂,从整个控制区生成简洁的数据集,以直接上传到 CODIS。在不增加成本或时间的情况下,多重能力能够提高工作效率。

绩效

ForenSeq mtDNA Control Region Kit 将功能强大的检测与业界领先的测序技术相结合,并与直观的软件无缝集成,以优化实验室效率。ForenSeq mtDNA 的控制区工作流程完全灵活、可扩展,可满足所有通量要求,实验室可在不到两个工作日内同时为多达 48 个样本快速生成完整的 mtDNA 控制区结果。如果通量要求低,试剂盒的 48 次反应可维持 12 个月的保质期;对于高要求的实验室,类似的文库制备例程可轻松实现自动化。

  • 平均扩增子尺寸短,可最大限度地检测变体
  • 针对抑制剂耐受性进行了优化
  • 灵活、可扩展的通量
  • 集成式工作流程,可实现最佳实验室效率

由于高密度的突变集中在 mtDNA 控制区以及用于 mtDNA 分析的大多数法医样本属于已降解性质,优化引物设计具有挑战性。ForenSeq mtDNA Control Region Kit 经过优化,即使输入量很低,也能产生完整、可操作的覆盖范围(见“ForenSeq mtDNA 控制区系统能在大范围的 DNA 输入量下提供大覆盖范围”图)。

为了提高对严重降解材料的性能,ForenSeq mtDNA Control Region Kit 使用了根据最近整理的 mtDNA 变异和频率数据设计的 120 多种引物,在 mtDNA 控制区产生 18 个主扩增子。所有主扩增子的长度都 < 150 bp,其中许多都 < 100 bp,在目前所有商用 mtDNA 检测系统中平均扩增子大小最小。所有扩增子至少有 3 bp 的重叠,以避免测序运行后生物信息学修剪造成的序列间隙。针对抑制剂进行了优化的缓冲液系统创造了稳健的扩增环境(见“改进的 ForenSeq 缓冲液系统可最大限度地提高性能”图)。

特点 详细信息
靶标大小 1200 bp mtDNA 控制区
推荐的 DNA 输入量 每个样本 100 pg gDNA 和 mtDNA
样本类型 从包括骨骼、牙齿和毛干等一系列已降解样本中提取的 DNA
推荐的复合扩增能力 每次测序运行处理 3 至 48 个文库
引物数量 >120
扩增子数量 18
平均扩增子大小 118 bp
扩增子重叠 ≥ 3 bp
文库制备总时间 7 小时 45 分钟
手动操作时间 1 小时 30 分钟

原理

这种基于 PCR 的检测利用来自最新 mtDNA 数据库的小扩增子来加强变异检测。平铺方法将扩增子重叠在一起,以防止序列间隙导致数据丢失,尤其是在已降解样本中。作为对这种平铺引物设计的补充,增强型缓冲液系统对钙、腐植酸和其他相关 PCR 抑制剂具有出色的抗性。

程序

这种易用、兼容自动化的解决方案为跨越多个应用领域的各种研究设计提供了通用的工作流程。该方案包括两种归一化方法,可针对从高品质基因组 DNA (gDNA) 直至低水平和复杂样本的多种投入样本进行定制的文库制备,而低输入量需求扩充了最具挑战性样本的可行解决方案。为了高效使用试剂盒和准确分配读数,文库制备试剂盒中提供的index接头允许在一次运行中对多达 48 个样本进行汇集和测序。

应用

当核 DNA 受损或缺失时,线粒体 DNA 是一种强大的替代信息来源。mtDNA 用于无根毛发、牙齿、骨骼和其他具有挑战性的来源,已成为失踪人员和灾难受害者身份鉴定工作的常规手段。以前,由于传统 Sanger 测序方法存在的质量和规模问题,mtDNA 只能在少数专业中心发挥有限的作用。Verogen mtDNA 工作流程提供了性能、效率和易用性的独特组合,因此任何规模的实验室都能将 mtDNA 分析从 Sanger 测序过渡到 NGS,或改进从其他 NGS 技术获得的结果。

软件

ForenSeq mtDNA Control Region Kit 与 UAS 中的 ForenSeq mtDNA 分析模块无缝衔接,便于使用 mtDNA 数据并对其进行快速审查。该软件可分析控制区的测序输出,并在运行完成后不到一小时内提供结果。实验室可在清晰的交互式用户界面上回顾汇总或详细结果,并对多达九个样本进行比较。报告与多个 DNA 数据库兼容。

服务

我们为从文库制备到测序再到分析的整个工作流程提供卓越支持。我们经验丰富的团队为您的设备和软件提供全面的服务覆盖、验证计划和实施指导,使您能快速轻松地将工作流程投入运行。

资源

耗材文档 (1)
ForenSeq mtDNA Control Region Kit Materials 
试剂盒操作手册 (1)
ForenSeq mtDNA Control Region Kit Reference Guide
产品介绍与指南 (2)
Seek answers, not profiles with the QIAGEN-Verogen partnership

The benefits of next-generation sequencing for human identification


快速启动实验方案 (1)
ForenSeq mtDNA Control Region Kit Checklist
分析软件 (1)
Universal Analysis Software v2.0 and above Reference Guide
Safety Data Sheets (1)
Certificates of Analysis (1)
Technical Information (1)

Analyze the mitochondrial DNA control region from high-quality or highly degraded samples