癌症研究

充分利用 FFPE 样本

聚焦 FFPE 系列

QIAGEN 科研人员分享专业知识

对于生物医学研究而言，储存在世界各地的福尔马林固定石蜡包埋（formalin-fixed, paraffin-embedded，FFPE）组织切片是一个宝贵且巨大的资源。FFPE 组织是一种宝贵但具有挑战性的材料，在核酸纯化及下游分子分析中，需要采用非常高效的可适用于 FFPE 样本性质的方法。注册后可获取我们的建议与技巧系列，从 QIAGEN 科研人员的专识中获益。

网络研讨会、视频及更多

核酸制备

分析前考虑事项

Martin Schlumpberger：FFPE 样本 – 基础知识

在网络研讨会的开头，Martin 将重点介绍从 FFPE 样本开始进行分子分析的各种影响因素、主要难点以及对这种宝贵但有难度的样本类型进行操作时的注意事项。

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Daniel Groelz：分析前注意事项 – 相关标准及如何在实验室中落实

Daniel 将为您剖析 FFPE 样本进行核酸分析前的影响因素，对分析前工作流程进行标准化的国际举措及要求，以及在您的实验室落实这些标准的方法。

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Martin Schlumpberger：核酸制备 – 从同一个 FFPE 样本中提取 DNA、RNA 和总核酸（两者同时提取）

Martin 将讨论从 FFPE 样本提取 DNA 和 RNA 时，为获得高产率并验证高品质 DNA 和 RNA 而需要考虑的事项，比如高效的脱蜡、交联及人为引入突变的去除，DNA/RNA 完整性控制及其对下游分析的影响。

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DNA 甲基化

Ioanna Andreou：对 FFPE 样本进行 NGS 甲基化标志物检测

Ioanna 将谈论如何对 FFPE 样本通过靶向甲基化测序进行 DNA 甲基化分析。她将讨论一种使用分子条形码（unique molecular index，UMI）和单端特异性引物延伸（single primer extension，SPE）技术的 single day to sequencer 工作流程。

Norbert Hochstein：焦磷酸测序甲基化分析 – 扩增子长度及 DNA 投入量的影响

Norbert 对一种适用于甲基化分析的焦磷酸测序工作流程进行了概述，接着介绍了他采用 FFPE 样本的焦磷酸测序研究的主要发现，以及扩增子长度和 DNA 投入量对结果的影响。

miRNA 表达

Francesca Di Pasquale：采用 PCR 技术对 miRNA 进行分析

Francesca 讨论的内容包括，利用 FFPE 样本进行 miRNA 相关工作时的挑战，以及在进行 qPCR miRNA 表达分析时，有关引物设计、质量控制和数据标准化的主要考虑事项。

Marie-Louise Lunn：miRNA FFPE ISH 在癌症生物标志物开发中的应用

Marie-Louise 讲述的主题是，使用锁核酸（locked nucleic acids，LNAs）对定位研究中的 miRNA 原位杂交进行优化。她将讨论一种经过优化的、无毒、单日操作方案，以及所需的对照，以实现 ISH 实验方案优化。

RNA 测序和多模式 NGS

Jonathan Shaffer：FFPE 样本全转录组 NGS

Jon 介绍了一种可在全转录组 RNA 测序期间从 FFPE 样本中高效去除 rRNA 的新技术，该技术可显著增加比对到基因的读长数及检测到的基因数，从而实现稳健的差异表达分析。

Jonathan Shaffer：对 FFPE 样本进行多模式 NGS 分析

Jon 介绍的是一种新的可用于对 DNA 突变和 RNA 融合同时进行表达谱分析的多分析物 NGS 工作流程。他将讨论（并举例说明）如何采用该解决方案从 FFPE 样本开始同时制备 DNA 和 RNA 靶向文库。

Leif Schauser：使用 QIAGEN CLC Genomics Workbench 进行 NGS 数据分析

Leif 介绍了用于 NGS 数据分析的 QIAGEN CLC Genomics Workbench 以及与 FFPE 相关的主要功能。在一个直播演示中，他将向您讲解 DNA 测序和 RNA 测序数据分析工作流程中的主要步骤。

技术指南

成功对 FFPE 样本进行生物标志物表达谱分析

FFPE 组织切片是一种宝贵但具有挑战性的样本类型，要求在分析物纯化及下游分子学分析中采用高效的方法。
了解 FFPE 样本制备的最新方法及重要考虑事项，以及分子学分析的事前工作流程步骤。

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产品

发现 FFPE 样本的真实潜力

从样本制备到数据分析，适用于 NGS 分子学分析、数字 PCR、PCR 或 qPCR——探索 QIAGEN 的 Sample to Insight 解决方案，成功实现对 FFPE 样本的分子学分析

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聚焦的产品：

QIAamp DNA FFPE Advanced Kit

使用这款新一代的试剂盒从 FFPE 组织样本中提取 DNA 可提高可扩增 DNA 的产率。这款无二甲苯、免洗脱蜡、双裂解实验方案还可以实现自动化操作。

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