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EpiTect Plus Bisulfite Kits是一组整合的试剂盒体系,适用于各种起始材料,可高效的进行样本裂解,直接对从全血、培养细胞、组织样本和FFPE组织切片中提取的DNA进行亚硫酸氢盐转化。转化后的DNA可洗脱到10 µl的洗脱缓冲液中,因此DNA的浓度高。EpiTect Plus Bisulfite Kits还具有同样高的DNA转化效率,以及EpiTect Bisulfite Kits可靠的DNA保护技术。
EpiTect Plus Bisulfite Kits的主要特点包括:
使用亚硫酸氢钠进行DNA转化时,所有样本DNA中非甲基化的胞嘧啶都被完全转化,同时减少了由于温度和化学试剂因素导致的DNA降解。对于转化后DNA的保护十分重要,影响回收率和下游操作的灵敏度。EpiTect Plus Bisulfite Kits在防止DNA降解的同时,可高效的进行DNA亚硫酸氢盐转化,且无需单独的DNA纯化步骤。这个高效的工作流程覆盖了从样本裂解到最终洗脱转化后DNA的整个过程,可快速获得适合多种下游应用的高品质、即用型DNA。
3种EpiTect Plus Bisulfite Kits相互关联,是一个整体,这3种试剂盒可对多种起始材料的DNA进行直接的亚硫酸氢盐转化(参见"Interconnected protocols")。但每种试剂盒有自己独特的特点,适用于某一特定样本类型,含有进行特定转化所需的所有缓冲液和试剂。使用每个试剂盒所含的试剂可进行高效的样本裂解,裂解过程的DNA损失降到最小;完全的亚硫酸氢盐转化,转化过程中有效的保护DNA和彻底回收DNA。
EpiTect Plus Bisulfite Kits不能替代EpiTect Bisulfite Kits,但适用于更多样本类型,并可为下游应用制备亚硫酸氢盐转化DNA。两套试剂盒都有DNA保护技术,可确保高转化效率。EpiTect Bisulfite Kits提供便利的96孔板,适合高通量转化。下表"QIAGEN对DNA亚硫酸氢盐转化的解决方案"中列出了QIAGEN表观遗传学产品线中的5个亚硫酸氢盐转化试剂盒,以便您从中选择合适的试剂盒。
独特配方的DNA Protect Buffer,可预防在高温、低pH环境下对DNA进行亚硫酸氢盐处理时产生的DNA片段化。该缓冲液可促使DNA变性,生成胞嘧啶完全转化所需的单链DNA。DNA Protect Buffer含有pH指示染料,可确保胞嘧啶转化时pH准确(参见" DNA Protect Buffer")。
脱蜡过程可将DNA从FFPE样本中提取出来。在该过程中,石蜡先被溶解,然后去除;再用裂解缓冲液和蛋白酶K处理样本。Deparaffinization Solution是新型试剂,可减少去石蜡化过程所需的手动操作,并可确保高DNA回收率。在溶液中加入FFPE样本后,溶液作用于样本,同时蛋白酶K开始消化。之后无需离心沉淀FFPE样本,也无需去除含有石蜡的上清。因此避免了去石蜡化过程中的样本损失。
特点 | EpiTect Bisulfite Kit | EpiTect 96 Bisulfite Kit | EpiTect Plus DNA Bisulfite Kit | EpiTect Plus LyseAll Bisulfite Kit | EpiTect Plus FFPE Bisulfite Kit |
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规格 | EpiTect离心柱 | 96孔板 | MinElute DNA离心柱 | MinElute DNA离心柱 | MinElute DNA离心柱 |
起始材料 | gDNA | gDNA | gDNA | 全血、细胞、组织 | FFPE组织切片 |
起始材料用量 | 1 ng – 2 µg gDNA | 1 ng – 2 µg gDNA | 1 ng – 2 µg gDNA | 10–100,000个细胞,0.5–20 µl全血 | 1片FFPE组织切片(10 µm厚) |
是否包括样本裂解 | 否 | 否 | 否 | 是,含有可裂解细胞、血液和组织的Lysis Buffer FTB | 是,含有Deparaffinization Solution和Lysis Buffer FTB |
洗脱体积 | 20–40 µl | 40–50 µl | ≥10 µl | ≥10 µl | ≥10 µl |
转化效率 | >99% | >99% | >99% | >99% | >99% |
自动化 | QIAcube全自动核酸纯化仪 | 无 | QIAcube全自动核酸纯化仪 | QIAcube全自动核酸纯化仪 | QIAcube全自动核酸纯化仪 |
离心/真空 | 离心 | 离心/真空 | 离心 | 离心 | 离心 |
试剂盒组成 | EpiTect Bisulfite Kit | EpiTect 96 Bisulfite Kit | EpiTect Plus DNA Bisulfite Kit | EpiTect Plus LyseAll Lysis Kit和EpiTect Plus DNA Bisulfite Kit | EpiTect Plus FFPE Lysis Kit和EpiTect Plus DNA Bisulfite Kit |
EpiTect Plus DNA Bisulfite Kit含有特别配制的缓冲液和试剂,可对基因组DNA进行高效的亚硫酸氢盐转化和回收(参见" EpiTect Plus DNA flowchart")。该试剂盒具有独特的DNA保护技术和QIAGEN离心柱,可确保完全转化DNA、降解程度最低,且可洗脱到10 µl的缓冲液中,适合需要高浓度DNA的下游操作。该试剂盒可用于从20 µl溶液中转化1 ng–2 µg DNA或40 µl溶液中转化1–500 ng DNA。
EpiTect Plus FFPE Bisulfite Kit包括用于去除石蜡和裂解FFPE组织切片的EpiTect Plus FFPE Lysis Kit和用于对样本DNA进行高效亚硫酸氢盐转化的EpiTect Plus DNA Bisulfite Kit(参见" EpiTect Plus FFPE flowchart")。使用新型的Deparaffinization Solution和Lysis Buffer FTB,在优化的温度下,对FFPE组织切片进行去石蜡化、裂解和去交联操作。裂解和去交联后的DNA可直接用EpiTect Plus DNA Bisulfite Kit进行亚硫酸氢盐转化。该试剂盒的起始材料为厚度为10 µm的单片FFPE组织切片。
EpiTect Plus LyseAll Bisulfite Kit包括用于裂解全血细胞、培养细胞和新鲜组织的EpiTect Plus LyseAll Lysis Kit和用于对样本DNA进行高效亚硫酸氢盐转化的EpiTect Plus DNA Bisulftie Kit(参见" EpiTect Plus LyseAll flowchart")。特别配制的裂解缓冲液可更高效的进行组织裂解,得到的DNA可直接用于亚硫酸氢盐转化,无需单独的纯化步骤。该试剂盒适用于0.5–20 µl血液或10–105个细胞(至少60 pg DNA)。
使用EpiTect Plus Bisulfite Kit转化和纯化的DNA适用于多种下游应用,包括:
Depending on sample type, the bisulfite conversion of DNA calls for the use of a specific kit and protocol. Kits contain buffers optimized for DNA extraction and all reagents for the DNA bisulfite conversion.