dPCR 与 qPCR 的比较选择 – 探索相关优势,并确认其是否适合您的研究目标
在对 dPCR 和 qPCR 这两种技术进行比较时,关键差异在于精确度。国家计量实验室首席科学家 Jim Huggett 表示,虽然两者都可进行高度灵敏且可靠的核酸检测和定量,这两种技术间的主要区别可以用模拟和数字收音机来类比。“对于模拟收音机,首先必须先对调节器进行精确的调节,才能以最低的干扰接收想要的频道。尽管如此,信号的质量还是取决于接收情况,而且会受到静电的干扰。这就像 qPCR 一样。它是可靠的,但需要进行优化,才能获得良好的结果,即便如此,还是会有背景噪音。对于数字收音机,你只需拨到相应的频道,频道上或者有清晰的信号,或者没有信号。后者类似于 dPCR,提供精确的二进制结果。它直接计数 DNA 分子的存在或不存在。清晰的结果与低出错率的结合造就了极高的精确度。数字 PCR 非常适合检测及定量较小的差异。”
比较与对比:qPCR 与 dPCR
Real-time PCR/qPCR | 数字 PCR |
---|---|
定量,绝对或相对, 但需要标准曲线或参照品 | 定量,绝对且无需标准品或 参照品 |
主体 PCR
| 样本微分化
|
每个循环均检测 PCR 的扩增情况 | PCR 循环结束后进行检测 |
可检测 >1% 的突变率 | 可检测 ≥ 0.1% 的突变率(高 信噪比) |
方案成熟 | 更高的精确度带来更高的 实验室间可重复性 |
微滴式数字 PCR (ddPCR) 是数字 PCR 最早的形式之一,在上述大多数应用中已经展现出优于 qPCR 的优势。在 ddPCR 与 qPCR 的对比中,qPCR 适用于需要宽动态范围的应用,而 ddPCR 适用于需要更高精确度或丰度分析的应用。
从 ddPCR 到纳米微孔板 dPCR 的发展,拓宽了这项技术的应用范围。得益于同时读取所有样本反应分区、前端自动化以及类似于 qPCR 的简单微孔板设置,纳米微孔板 dPCR 的工作流程显著加快。这种加快的速度使其适用于筛选和高通量应用,而不会影响其精确度、准确度和灵敏度。
查看 dPCR 可为您做些什么
在当前,数字 PCR - 特别是QIAGEN的纳米微孔板技术正在从根本上改变你今天可以回答的问题,使广泛的应用成为可能。
QIAcuity 纳米微孔板 dPCR 工作流程:与 qPCR 很相似…但更胜一筹
就像 qPCR 实验那样,样本制备包括将预混液、探针和引物转移到一个 96 孔或 24 孔纳米微孔板中,随后添加样本。该系统将微分化、热循环和成像集成到单一全自动化的仪器上,用户可在 2 小时内从样本获得结果。您可在 Software Suite 上执行远程分析,该软件可针对您的靶序列及质量控制品(例如阳性样本或无模板对照)给出以拷贝数/微升为单位的浓度。
qPCR 到 dPCR 之间的转换非常容易,您甚至不会注意到它的发生
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有关从 qPCR 转移到 dPCR 的常见问答
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