DyeEx Kits

1~24 또는 1~96 염기서열 분석 반응에서 미삽입된 염료 종결자 제거에 사용합니다

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DyeEx 96 Kit (4)

Cat. No. / ID: 63181

DyeEx 96 플레이트 4개; Collection 플레이트 4개, 48-Well

Kit

DyeEx Kit

DyeEx 2.0 Kit

Preparations

4 x 96

24 x 96

Inquire

DyeEx Kits은/는 분자생물학 분야에 사용하기 위한 것입니다. 이 제품들은 질병의 진단, 예방, 또는 치료 목적으로 사용할 수 없습니다.

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특징

단 두 번의 짧은 원심분리 단계의 빠른 절차
바로 사용 가능한 사전 수화 겔 여과 재료
모든 염료 종결자를 효율적으로 제거

제품 세부 정보

DyeEx Kits는 스핀 컬럼 또는 96-well 플레이트 중 하나를 제공하며 겔 여과 기술을 사용하여 Sanger 염기서열 분석 반응을 포함한 염기서열 분석 반응에서 염료 종결자를 제거합니다. 염기서열 분석 반응물은 미리 수화된 겔 여과 재료에 로드됩니다. 짧은 원심분리 단계가 끝나면 반응물을 모세관 염기서열 분석기에 로드할 준비가 된 것입니다. 미삽입된 염료 종결자가 겔 매트릭스에 포획됩니다.

성능

DyeEx Kits는 10~20µl 염기서열 분석 반응에서 BigDye, dRhodamine 염료, Rhodamine, DYEnamic ET, WellRED 종결자를 포함한 모든 유형의 염료 종결자를 제거합니다. 클린업 후, 모든 모세관 염기서열 분석기에서 염기서열 분석 반응물을 분리할 수 있습니다. 최적화된 프로토콜을 사용하는 DyeEx 96 Kit를 추천합니다.

고품질 염기서열 분석

DyeEx Kits는 염료 종결자를 빠르고 편리하게 제거하여 고품질 염기서열 분석 결과를 얻을 수 있도록 최적화되어 있습니다. 반면, 에탄올 침전에 의한 염기서열 분석 반응 클린업은 시간이 오래 걸리고(표 "DyeEx 절차 및 에탄올 침전 비교" 참조) 비효율적입니다. 염료 종결자를 효율적으로 제거하지 못하면 염료 블롭(blob)이 염기서열 분석 데이터에 나타나 염기서열 일부를 읽을 수 없게 되는 경우가 종종 있습니다. 염기서열 분석 반응 클린업에 DyeEx Kits를 사용하면 염기서열 분석 장비에 로드될 반응물에서 염료 종결자를 확실히 제거할 수 있습니다. 염료 블롭이 없으면 염기서열을 전체적으로 쉽게 판독할 수 있습니다(그림 "우수한 염기서열 분석 결과" 참조). 신호 강도가 높기 때문에 판독 길이가 길어집니다(그림 "긴 판독 염기서열" 참조).

DyeEx 절차 및 에탄올 침전 비교

절차	DyeEx 2.0 Spin	DyeEx 96	에탄올 침전
소요 시간* (샘플 12개, 스핀 형식)	10분	N.A.	>45분
소요 시간*† (96개 샘플용 마이크로플레이트 형식)	N.A.	18분	>60분
취급	바로 사용 가능한 스핀 형식	바로 사용 가능	여러 번의 피펫팅 단계
염기서열 품질	++	++	+

N.A.: 해당 사항 없음

* 겔 로딩 전 샘플을 건조시키는 데 필요한 시간은 포함되지 않습니다(해당되는 경우).
† 표준 프로토콜 사용.

그림 참조

뛰어난 염기서열 분석 결과.

긴 판독 염기서열.

원리

DyeEx 절차는 겔 여과를 사용하여 염기서열 분석 반응에서 미삽입된 종결자를 빠르고 효율적으로 제거합니다. 미삽입 염료 종결자가 염기서열 분석 결과를 방해하는 것을 방지하기 위해 염료 종결자를 제거하는 것이 중요합니다. DyeEx 겔 여과 재료는 균일한 기공을 가진 구체로 구성되며 분자량에 따라 분자를 분리합니다. 염기서열 분석 반응 혼합물을 DyeEx 컬럼에 적용하면, 염료 종결자는 기공으로 확산되어 겔 여과 재료에 남아 있는 반면, 표지된 DNA 절편은 통과 과정에서 제외되어 회수됩니다(그림 "DyeEx 분리 원리" 참조).

그림 참조

DyeEx 분리 원리.

절차

절차가 매우 간단하기 때문에 DyeEx Kits를 사용한 염료 종결자를 빠르게 제거할 수 있습니다(순서도 "DyeEx 2.0 Spin 절차" 및 ”DyeEx 96 Kit 절차” 참조). 빠른 원심분리 단계를 통해 컬럼 또는 well에서 저장 완충액을 제거하고 염기서열 분석 샘플을 로드한 후 두 번째 원심분리 단계를 통해 미삽입 염료 종결자를 제거합니다. 그런 다음 샘플을 모세관 염기서열 분석기에 직접 로드하거나 건조, 재용해하여 염기서열 분석 겔에 로드할 수 있습니다.

그림 참조

DyeEx 2.0 Spin 절차.

DyeEx 96 절차.

응용 분야

DyeEx Kits는 10~20µl 염기서열 분석 반응에서 BigDye, dRhodamine 염료, Rhodamine, DYEnamic ET, WellRED 종결자를 포함한 모든 유형의 염료 종결자를 제거합니다. 클린업 후, 모든 모세관 염기서열 분석기에서 염기서열 분석 반응물을 분리할 수 있습니다. 신호 강도가 높기 때문에 판독 길이가 깁니다.

DyeEx 특징

특징	DyeEx 2.0 Spin Kit 및 DyeEx 96 Kit
결합력	10~20µl
용출량	10~20µl
DyeEx Kits용:	종결자 제거, ABI PRISM 377, 373, 310, 3100, 3700, MegaBACE 1000, CEQ 2000 염기서열 분석기
형식	튜브(DyeEx 2.0 Spin Kit), 96-well 플레이트(DyeEx 96 Kit)
처리	수동
<10mers 17~40mers 염료 종결자 단백질 제거	염료 종결자
샘플 유형	염기서열 분석 반응
기술	겔 여과

DyeEx Kits는 분자생물학 분야에 사용하기 위한 것입니다. 이 제품들은 질병의 진단, 예방 또는 치료 목적으로 사용할 수 없습니다.

지원되는 데이터 및 수치

뛰어난 염기서열 분석 결과.

ABI PRISM BigDye Terminator Cycle Sequencing Kit 및 ABI PRISM 377 DNA Sequencer를 사용하여 염기서열 분석한 QIAprep 정제 플라스미드의 [A] 겔 이미지 및 [B] 염기서열 프로파일입니다. 염기서열 분석 반응은 DyeEx 96 Kit를 사용하여 정제하거나 염기서열 분석 키트 공급업체에서 권장하는 대로 에탄올로 침전시켰습니다. 염기서열 분석된 플라스미드는 유전체 라이브러리(에탄올 침전, 겔 이미지)의 플라스미드이거나 pUC21(DyeEx 96 Kit 및 에탄올 침전, 염기서열 프로파일)이었습니다. 에탄올 침전 염기서열 분석 반응에 존재하는 염료 종결자는 염료 블롭(화살표 표시)을 유발하여 염기서열을 판독할 수 없게 합니다.

리소스

For DyeEx 2.0 Spin Kit and DyeEx 96 Kit

Publications

Transcriptional regulatory network analysis of developing human erythroid progenitors reveals patterns of coregulation and potential transcriptional regulators.

Keller MA; Addya S; Vadigepalli R; Banini B; Delgrosso K; Huang H; Surrey S;

Physiol Genomics; 2006; 28 (1):114-28 2006 Aug 29 PMID:16940433

Isolation and identification of Rickettsia massiliae from Rhipicephalus sanguineus ticks collected in Arizona.

Eremeeva ME; Bosserman EA; Demma LJ; Zambrano ML; Blau DM; Dasch GA;

Appl Environ Microbiol; 2006; 72 (8):5569-77 2006 Aug PMID:16885311

Mammalian monogamy is not controlled by a single gene.

Fink S; Excoffier L; Heckel G;

Proc Natl Acad Sci U S A; 2006; 103 (29):10956-60 2006 Jul 10 PMID:16832060

High throughput analysis of TCR-beta rearrangement and gene expression in single T cells.

Zhou D; Srivastava R; Grummel V; Cepok S; Hartung HP; Hemmer B;

Lab Invest; 2006; 86 (3):314-21 2006 Mar PMID:16446708

Prevalence, risk factor analysis, and follow-up of infections caused by three feline hemoplasma species in cats in Switzerland.

Willi B; Boretti FS; Baumgartner C; Tasker S; Wenger B; Cattori V; Meli ML; Reusch CE; Lutz H; Hofmann-Lehmann R;

J Clin Microbiol; 2006; 44 (3):961-9 2006 Mar PMID:16517884

FAQ

Yes, DyeEX 96 is also compatible with ABI 3730. When using DyeEx96 with ABI 3730, please follow the "Modified protocol" listed in the DyeEX Handbook. In addition, if using the waterloading protocol on ABI 3730 sequencer, the eluate can be loaded directly onto the sequencer without drying down the sample.

FAQ ID -3075

DyeEx Kits have been developed for cleanup of dye-terminator sequencing reactions. However, they can also be used for removal of unincorporated nucleotides from radioactively labeled DNA fragments using the protocols in the DyeEx Handbook. The removal of nucleotides depends on the sample volume. Typically, more than 99% of nucleotides are removed from sample volumes ≤50 µl. See Figure 9 in the DyeEx Handbook for the effect of sample volume on recovery.

(We have had feedback from researchers who have reported excellent results using DyeEx for clean up of probes used for in situ hybridization).

FAQ ID -137