QIAamp DNA FFPE Tissue Kit

포르말린 고정 파라핀 포매 조직에서 유전체 DNA를 정제하는 데 사용됩니다

특징

즉시 사용 가능한 고품질 DNA의 신속한 정제
일관되고 높은 수율
오염 물질 및 억제제 완전 제거

제품 세부 정보

QIAamp DNA FFPE Tissue Kit는 포르말린 고정 파라핀 포매 조직 절편에서 DNA를 정제하도록 특별히 설계되었습니다. 이 키트는 특수 용해 조건을 사용하여 조직 절편에서 DNA를 분리하고 핵산의 포르말린 가교 결합으로 발생하는 억제 효과를 처리합니다. 이 키트는 소량으로 고품질 DNA를 정제하기 위해 QIAamp MinElute Spin Columns를 사용합니다. QIAamp DNA FFPE Tissue Kit를 사용한 DNA 정제는 QIAcube Connect에서 자동화할 수 있습니다.

DNA로부터의 효율적인 회수 및 선택적인 인공물 제거를 위해 차세대 QIAamp DNA FFPE Advanced Kit를 사용해 보세요.

성능

QIAamp DNA FFPE Tissue Kit는 단일 뉴클레오티드 다형성(Single Nucleotide Polymorphism, SNP) 및 짧은 연쇄 반복(Short-Tandem Repeat, STR) 유전형 및 약물유전체학 연구와 같은 광범위한 다운스트림 응용 분야에 사용할 수 있는 DNA를 정제합니다. QIAamp DNA FFPE Tissue Kit로 정제된 DNA는 PCR에도 사용할 수 있습니다(그림 '' 참조).

그림 참조

FFPE 조직 샘플에서 정제된 DNA의 PCR 분석.

원리

QIAamp DNA FFPE Tissue Kit는 소량의 샘플양 또는 크기로부터 유전체 및 미토콘드리아 DNA를 정제하기 위해 잘 구축된 QIAamp MinElute 기술을 사용합니다. 이 키트는 실리카 기반 막의 선택적 결합 특성과 20-100µl 사이의 유연한 용출 용량이 조합되어 있습니다.

특별히 최적화된 용해 상태를 통해 밤새 배양할 필요 없이 유전체 DNA를 FFPE 조직 절편으로부터 효율적으로 정제할 수 있습니다. 단백분해효소 K 분해 후 고온 배양은 방출된 DNA의 포르말린 가교 결합을 부분적으로 제거하여 다운스트림 분석에서 수율 및 DNA 성능을 개선합니다. 참고로 FFPE 샘플에서 분리된 DNA는 신선 또는 냉동 상태 샘플의 DNA에 비해 분자량이 적은 경우가 일반적입니다. 단편화 정도는 샘플의 유형과 수명 및 고정에 사용된 조건에 따라 달라집니다.

절차

QIAamp DNA FFPE Tissue 절차는 파라핀 제거, 용해, 가열, 결합, 세척 및 용출의 6단계로 구성되어 있습니다(' 절차' 순서도 참조). 샘플 용해 후, 여러 샘플을 동시에 처리하는 데 매우 적합한 간단한 QIAamp DNA FFPE Tissue 절차를 통해 30분 이내에 순수 DNA를 얻을 수 있습니다.

그림 참조

QIAamp DNA FFPE Tissue Kit 절차.

응용 분야

QIAamp DNA FFPE Tissue Kit는 포르말린 고정 파라핀 포매 조직에서 DNA를 정제하도록 특별히 설계되었습니다.

지원되는 데이터 및 수치

FFPE 조직 샘플에서 정제된 DNA의 PCR 분석.

유전체 DNA는 QIAamp DNA FFPE Tissue Kit를 사용하여 다양한 FFPE 조직 샘플 정제했습니다. prnp 유전자의 산물(78bp, 464bp, 727bp)을 real-time 정량 PCR로 증폭했습니다.

Specifications

Features	Specifications
Applications	Real-time PCR, STR 분석, LMD-PCR
Processing	수동
Purification of total RNA, miRNA, poly A+ mRNA, DNA or protein	유전체 DNA, 미토콘드리아 DNA
Elution volume	20-100µl
Format	스핀 컬럼
Technology	실리카 기술
Main sample type	포르말린 고정 파라핀 포매 조직 샘플
Sample amount	절편 8개 이하(각 절편의 두께는 10µm 이하, 표면적은 250mm2 이하)

리소스

Publications

Gender-related survival differences associated with EGFR polymorphisms in metastatic colon cancer.

Press OA; Zhang W; Gordon MA; Yang D; Lurje G; Iqbal S; El-Khoueiry A; Lenz HJ;

Cancer Res; 2008; 68 (8):3037-42 2008 Apr 15 PMID:18413774

Discrepancy between CYP2D6 phenotype and genotype derived from post-mortem dextromethorphan blood level.

Bailey B; Daneman R; Daneman N; Mayer JM; Koren G;

Forensic Sci Int; 2000; 110 (1):61-70 2000 May 8 PMID:10802201

FAQ

The MinElute spin columns included in the following kits should be stored at 2–8°C upon arrival: AllPrep DNA/RNA Micro, EpiTect Fast DNA Bisulfite, EpiTect Fast FFPE Bisulfite, EpiTect Fast LyseAll Bisulfite, EpiTect Plus DNA Bisulfite, EpiTect Plus FFPE Bisulfite, EpiTect Plus LyseAll Bisulfite, exoRNeasy Serum/plasma Maxi, exoRNeasy Serum/Plasma Midi, GeneRead DNA FFPE, GeneRead rRNA Depletion, GeneRead Size Selection, MinElute Gel Extraction, MinElute PCR Purification, MinElute Reaction Cleanup, miRNeasy FFPE, miRNeasy Micro, miRNeasy Serum/Plasma, QIAamp DNA FFPE, QIAamp DNA Investigator, QIAamp DNA Micro, QIAamp MinElute Media, QIAamp MinElute Virus Spin, QIAamp MinElute Virus Vacuum, RNeasy FFPE, RNeasy Micro, RNeasy Plus Micro.

Short-term storage (up to 4 weeks) at room temperature (15–25°C) does not affect the performance. However, for optimal performance and quality, storage temperature should not exceed 25°C.

FAQ ID - 3560

Small amounts of RNA and DNA may be difficult to measure spectrophotometrically. Fluorometric measurements, or quantitative RT-PCR and PCR are more sensitive and accurate methods to quantify low amounts of RNA or DNA.

Fluorometric measurements are carried out using nucleic acid binding dyes, such as RiboGreen® RNA Quantitation Reagent for RNA, and PicoGreen® DNA Quantitation Reagent for DNA (Molecular Probes, Inc.).

FAQ ID -728