QuantiNova LNA PCR lncRNA フォーカスパネルは、SYBR® Green ベースのqPCR により、疾病またはパスウェイ関連のlncRNA を迅速、正確かつ高感度に発現解析を行うことができます。LNA 技術により、至適Tm のプライマーを短く設計できるため、特異性の高い配列をターゲット上で柔軟に設定できます。徹底的な設計の検証により、高いパフォーマンスが保証されています。QuantiNova ケミストリーにより最適化されたシンプルワークフローは、わずか2時間で結果を提供し、室温での安定性によりセットアップの自動化や解析開始時間の自由度が広がります。また、フォーカスパネルのアッセイからカスタマイズ可能なフレキシブルパネルや、事前に設計されたアッセイやカスタムアッセイを選択できるカスタムパネルも用意しています。
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現在、マウスのフォーカスパネルのみが利用可能ですが、ヒトのフォーカスパネルも近日発売予定です。
QuantiNova LNA PCR lncRNA フォーカスパネルのアッセイは、厳しい設計基準とラボで検証されたアルゴリズムを使用して開発されました。LNA設計の20年の経験により、洗練されたLNA設計アルゴリズムを最適化できるようになりました。50を超えるさまざまなパラメーターを組み込んで、ターゲット検出の最適なアッセイを保証します。各プライマーセットは、信頼性が高く正確な結果を得るために、高い特異性と効率を提供します。LNA により、パネル全体としてTm の標準化も容易に可能になり、プライマーの結合親和性とアッセイの感度および特異性が劇的に向上しました。感度の向上により、1 RNA分子までの優れた増幅効率が保証され、微量のサンプルからlncRNAなどの少量のターゲットを簡単に検出できるようになります(図 QuantiNova LNA PCR Assays provide accurate, sensitive and linear quantification of targets over a wide dynamic range と QuantiNova LNA PCR Assays enable both high-expression and low-expression detection of mRNA 参照)。LNA の巧妙な配置による特異性の向上と高いS / N比が得られ、1塩基のみが異なる配列の識別と、非特異的な増幅やプライマーダイマーの形成が排除されます。
LNA 塩基の高い結合親和性により、転写物上でのプライマーの配置の柔軟性が高まるため、設計の自由度が向上し、他の方法では難しいターゲットのアッセイを構築できます。これにより、AU が豊富なターゲット、存在量の少ない転写産物、高い二次構造を持つターゲット、非常に複雑なサンプルであっても、ターゲットの識別と信頼性の高い定量が可能になります。
QuantiNova LNA PCR lncRNA フォーカスパネルは、SYBR® Green による検出を行い、優れた設計のプライマーと最適化された反応系のPCRシステムを用いれば、加水分解プローブによる検出系と比べていくつかの利点があります。1つ名はPCR 終了後に融解曲線解析ができるため、反応の特異性とプライマーダイマーや非特異的なPCR 産物の有無を確認することができます。また2本のプライマーとプローブを設計するのではなく、プライマーを2本だけ設計すればよいためアッセイデザインの自由度も向上します。さらにプライマーが特異的PCR 増幅を行い、蛍光色素の特性により、ターゲット固有の蛍光プローブを合成する必要が無く検出ができるためアッセイセットアップやランニングコストの低減もすることができます。
QuantiNova LNA PCR lncRNA フォーカスパネルには、関連するパスウェイまたは疾患に焦点を当てた長鎖ノンコーディングRNA が含まれています。事前に設計されたアッセイは、独自のアルゴリズムを使用して設計され、感度、制度そして解析効率に優れています。また近似した転写産物を見分けて検出する特異性も併せ持ちます。
QuantiNova LNA PCR lncRNA フォーカスパネルは、96ウェルプレート、384ウェルプレート、および100ウェルディスクのフォーマットで利用可能で、疾病またはパスウェイに関連する84遺伝子と複数のリファレンス遺伝子により遺伝子発現の定量的解析をします。各lncRNA フォーカスパネルには、次のコントロールが含まれています:
購入プレート数量 | ディスカウント(%) |
1~5 | 0 |
6~11 | 25 |
12~23 | 40 |
24+ | 55 |
GeneGlobe データ解析センター の無料のWebベースのデータ解析ツールは、使いやすいウィザードが含まれており、データの標準化と解析を指示に従って選択するだけで、論文や学会発表に対応した結果の図を作成できます。
フォーカスパネルは、定評のあるQuantiNova ケミストリーに最適化されています。そしてQuantiNova Reverse Transcription キットによる逆転写で最良の結果が得られるように設計されています。得られたcDNA は、パネルのアッセイとQuantiNova SYBR® Green PCR キットのマスターミックスで定量解析が行えます。
1ステップqRT-PCR の場合は、反応条件をさらに最適化する必要がないQuantiNova SYBR® Green RT-PCR キットがおすすめです。単純にRNAテンプレートを、RT-Mix マスターミックスとアッセイを混ぜるだけで、アッセイパネルでの解析を始められます。
速かつ簡単なワークフローは、作業時間を最小にしてわずか2時間で結果を手に入れられます。さらに作業の自動化をすればさらに時間と労力を最小化することが可能です。シンプルなプロトコールは、いずれのqPCR装置とも互換性があります(図 QuantiNova LNA PCR Assays deliver consistent performance across all thermal cycler instruments 参照)。さらに、RT ステップで生成されたcDNA はQuantiNova LNA PCR システム全体で使用できるため、研究ニーズに応じてアッセイからパネルへのシームレスな移行が可能になり、時間とサンプルを節約できます。
Reverse transcription:QuantiNova Reverse Transcription キット
qPCR mastermix:QuantiNova SYBR® Green PCR キット
One-Step qRT-PCR(オプション):QuantiNova SYBR® Green RT-PCR キット
アッセイまたはパネル:
QuantiNova LNA PCR lncRNA フォーカスパネルは、次のようなアプリケーションに非常に適しています: