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Cat. No. / ID: V16000023
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当社のシンプルなプレートベースのワークフローを使用して、ハンズオン操作時間が2時間足らずで最大96個のDNAサンプルについて、より包括的なDNAプロファイルを作成します。ForenSeq DNA Signature Prep Kitは、ケースワークのためのNational DNA Index System(NDIS)へのアップロードが承認された、最初の次世代シークエンシング(NGS)ベースのショートタンデムリピート(STR)シークエンシングケミストリーです。常染色体STR、X-STRおよびY-STR、身元情報性のあるSNP、表現型情報性のあるSNP、そして生物地理学的先祖情報性のあるSNPを含め、200個を超えるマーカーを単一の合理化されたワークフローに組み合わせることにより、キットは複数のSTR検査実行を不要とします。容易で一体化されたワークフローは、トレーニングプログラム、バリデーションの手順、技能検査、およびその他の、外部認証や認定プログラムに要求される品質保証/品質管理対策を簡易化することにより、研究室の効率を最大限に高めます。ソリューションは、現行のCEアレルコーリングに対して後方互換性があります。
ForenSeq DNA Signature Prep Kitは、法医学ゲノミクスアプリケーションでの使用向けに特別に設計された、完全なエンド・ツー・エンドの超並列シーケンスソリューションの一部です。ForenSeq DNA Signature Prep Kitにより、シンプルなプレートベースのワークフローでIlluminaの次世代シークエンシング(NGS)用に最大96個のDNAサンプルまで調製できます。
ForenSeq DNA Signature Prep Kitは、ケースワークおよび犯罪DNAデータベーシング用に世界中で現在使用されているすべての常染色体ショートタンデムリピート(STR)マーカーを、単一の合理化されたワークフロー内に統合し、複数のSTR検査を実行する必要性を取り除きます。常染色体STR、X-STRおよびY-STRに加えて、ForenSeq DNA Signature Prep Kitは、従来のキャピラリー電気泳動(CE)法では通常入手できないマーカーセットを提供します。これらには、出生源についての有益な情報を与える一塩基多型(iiSNP)、目の色(青色、中間色、茶色)および毛髪の色(茶色、赤色、黒色、ブロンド)を推定する表現型情報性のSNP(piSNP)、生物地理学的先祖について情報性のあるSNP(aiSNP)の高密度のセットが含まれます。これらは、“容疑者がおらず”、そのままではコールドケースになりかねないケースから捜査の手がかりを見いだすのに重要なものとなり得ます。
特徴 | マーカー数 | アンプリコンサイズ(bp) | DPMA | DPMB |
---|---|---|---|---|
包括的な常染色体STR | 27 | 61–467 | はい | はい |
Y-STR | 24 | 119–390 | はい | はい |
X-STR | 7 | 157–462 | はい | はい |
SNPの同定 | 94 | 63–261 | はい | はい |
表現型SNP | 22 | 73–227 | いいえ | はい |
生物地理学的アンセストリーSNP | 56 | 67–200 | いいえ | はい |
1つの反応で、プライマーミックスA(DPMA)は、すべての常染色体STR、X染色体STR、およびY染色体STRターゲットおよび完全なセットのiiSNPすべての検査を可能にします。プライマーミックスB(DPMB)には、aiSNPおよびpiSNPが含まれます。
ForenSeq DNA Signature Prep Kitには、次のものが含まれます。
ForenSeq DNA Signature Prep Kitに含まれる大部分のSNPは、アンプリコンサイズ≤ 125 bpを含み、分解したDNA抽出物の分析またはかなり阻害されているDNA抽出物の分析にさえも極めて適しています(図 “高分子量のgDNAと部分的に分解したgDNAの性能の比較”を参照)。また、ForenSeq DNA Signature Prep Kitでは、混合物内の、従来のSTRおよびCE分析では検出されないおそれのある低濃度のマイナーな構成要素を検出する能力が向上します。この向上した力は、キットに含まれる多数のマーカーによるもので、それらの多くは、高度に多型であり、Illumina MiSeq FGx機器の本来の感度と相まっています。
特徴 | 詳細 |
サンプルのタイプ | gDNA、口腔スワブ、FTAカード |
1サンプル当たりのヒトgDNAの推奨インプット | 1 ng |
1サンプル当たりのFTAカードパンチ用の推奨インプット | 1.2 mm |
1ラン当たりのマルチプレックスキャパシティ | 8–96サンプル |
短いアンプリコンの検出 | ≥ 65 bp |
遺伝子座のマルチプレックスキャパシティ | およそ200個の遺伝子マーカーの同時解析 |
ライブラリー調製時間合計 | 7時間15分 |
ハンズオン操作時間 | 1時間45分 |
シークエンシング時間合計 | MiSeq FGx Reagent Kitでおよそ28時間、MiSeq FGx Reagent Micro Kitでおよそ22時間 |
ForenSeq DNA Signature Prep Kitは、ライブラリー調製、DNAシークエンシングプラットフォーム、法医学ゲノミクス向けに特別に設計されたデータ解析ソフトウェアを含む、完全一体型のサンプルから答えへのソリューションの一部です。単一のワークフローでおよそ200個の遺伝子マーカーを使用して、MiSeq FGx Solutionは、STRおよびSNPの最も包括的なマルチプレックスおよび、ヒト個人識別への最もわかりやすい経路を提供します。
ForenSeq DNA Signature Prep Kitは、PCR試薬、インデックスアダプター、精製およびノーマライゼーション用ビーズなど、シークエンシング用のDNAライブラリーを調製するために必要なすべての試薬を含みます。1つの増幅で選択したマーカーを同時に調べます。複数の既存のキャピラリー電気泳動(CE)ベースのキットを統合するため、DNAプライマーSet A(DPMA)またはDNAプライマーSet B(DPMB)のいずれかから選択します。
ForenSeq DNA Signature Prep Kitは、Verogen MiSeq FGx Forensic Genomics Solution、法医学ゲノミクスのアプリケーション向けに特別に設計された完全にバリデーション済みのDNAからデータまでのワークフローの一部です。
ForenSeq DNA Signature Prep Kitは、MiSeq FGx Sequencing System上でライブラリーの配列決定をし、Universal Analysis Software(UAS)でデータを分析する一体化型ワークフローの一部です。高性能でエンド・ツー・エンドのソリューションとして設計、開発、製造され、ポートフォリオ全体が充実した技術的サポートによりバックアップされています。さらに、品質管理された製造により、オールインワンライブラリー調製キットの利便性と共に再現性が保証されます。
当社は、ライブラリー調製からシークエンシング、分析まで全ワークフローにわたって優れたサポートを提供します。当社の経験豊富なチームは、お使いの装置、ソフトウェア、バリデーションプラン、および実践のガイダンスのために包括的なサービスを提供し、ワークフローを容易に操作可能にします。