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Cat. No. / ID: 63181
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DyeEx キットはスピンカラムまたは 96 ウェルプレートを提供し、ゲルろ過技術を使用して、サンガーシークエンシングを含むシークダイエンシング反応液からダイターミネーターを除去します。 反応液は、事前に水和されたゲルろ過材にロードされます。 短い遠心分離ステップの後、反応液をキャピラリーシーケンサーにロードする準備が整います。 取り込まれなかったダイターミネーターはゲルマトリックスに保持されます。
DyeEx Kitsは、10–20 µlのシークエンシング反応液からBigDye、dRhodamine dye、Rhodamine、DYEnamic ET、WellREDターミネーターなど、あらゆる種類のダイターミネーターを除去します。クリーンアップの後、シークエンシング反応液は、キャピラリーシークエンサーで分離できます。最適化されたプロトコールを使用したDyeEx 96 Kitをお勧めします。
高品質のシークエンシング
DyeExキットは、迅速かつ簡便に色素ターミネーターを除去し、高品質のシーケンス結果につながるように最適化されています。対照的に、エタノール沈殿によるシークエンシング反応クリーンアップは非常に時間がかかり、非効率的です(「DyeEx操作手順とエタノール沈殿の比較」の表を参照)。ダイターミネーターを効率的に除去できないと、シーケンス データにダイの凝集によって、シークエンスの一部が読み取れなくなることがよくあります。シークエンシング反応のクリーンアップにDyeEx Kitsを使用することで、シークエンシング装置にロードされた反応液は確実にダイターミネーターが含まれなくなります。ダイの凝集がなく、シークエンス全体を容易に読み取れます( 「優れたシークエンシング成果物」の図を参照)。シグナル強度は強く、ロングリードの長さが得られます( 「ロングリードシークエンス」の図を参照)。
DyeExの操作手順とエタノール沈殿の比較
操作手順 | DyeEx 2.0 Spin | DyeEx 96 | エタノール 沈殿 |
---|---|---|---|
所要時間* (12サンプル、スピン形式) | 10分 | N.A. | >45分 |
所要時間*† (96サンプル用のマイクロプレート形式) | N.A. | 18分 | >60分 |
取り扱い | すぐ使える スピンフォーマット | すぐ使える | マルチプル ピペッティングステップ |
シークエンスの品質 | ++ | ++ | + |
N.A:該当せず
* ゲルローディング前のサンプルの乾燥に必要な時間は含まない(該当する場合)。
†標準のプロトールを使用。
DyeExの操作手順では、ゲル濾過を使用して、シークエンシング反応液から組み込まれなかったターミネーターを迅速かつ効率的に除去します。ダイターミネーターの除去は、組み込まれなかったダイターミネーターがシークエンシング成果物の分析を妨害するのを防ぐために重要です。DyeExゲル濾過材料は、均一な細孔を持つ球体で構成され、分子量に応じて分子を分離します。シークエンシング反応液をDyeExカラムにアプライすると、ダイターミネーターは細孔内に拡散し、ゲル濾過材内に保持されます。その一方で、ラベルされたDNAフラグメントは溶出され、フロースルーに回収されます( 「DyeEx分離の原理」の図を参照)。
DyeEx キットによる色素ターミネーターの除去は、手順が非常にシンプルなため、短時間で完了します( 「DyeEx 2.0 Spinの操作手順」と ”DyeEx 96 Kitの操作手順”のフローチャートを参照)。素早い遠心分離ステップで、カラムまたはウェルから保存用バッファーを除去し、シークエンシングサンプルをロードし、二番目の遠心分離ステップで組み込まれなかったダイターミネーターを除去します。サンプルはその後、キャピラリーシーケンサーに直接ロードするか、乾燥、再溶解してシーケンシングゲルにロードすることができます。
DyeEx Kitsは、10–20 µlのシークエンシング反応液からBigDye、dRhodamine dye、Rhodamine、DYEnamic ET、WellREDターミネーターなど、あらゆる種類のダイターミネーターを除去します。クリーンアップの後、シークエンシング反応液は、キャピラリーシークエンサー上で分離できます。シグナル強度は強く、読み取り長が長くなります。
DyeExの特徴
特徴 | DyeEx 2.0 Spin KitとDyeEx 96 Kit |
---|---|
結合容量 | 10–20 µl |
溶出量 | 10–20 µl |
DyeEx Kitsについて: | ターミネーターの除去、ABI PRISM 377、373、310、3100または3700、MegaBACE 1000またはCEQ 2000シークエンサー |
フォーマット | チューブ(DyeEx 2.0 Spin Kit)、96-ウェルプレート(DyeEx 96 Kit) |
処理 | 手動 |
除去<10mers 17–40mersダイターミネータータンパク質 | ダイターミネーター |
サンプルタイプ | シークエンシング反応 |
技術 | ゲル濾過 |
DyeEx Kitsは分子生物学的アプリケーション用であり、疾病の診断、予防、あるいは治療に使用することはできません。