QIAamp DNA FFPE Tissue Kit

パラフィン包埋組織からのゲノムDNA 精製

特徴

高品質で即使用可能なDNAの迅速精製
一定した高い収量
夾雑物および阻害物質を完全に除去

製品詳細

QIAamp DNA FFPE Tissue Kit はホルマリン固定パラフィン包埋組織切片からのDNA精製用に特別にデザインされています。本キットは組織切片からDNAを遊離させるための特別な溶解条件を用いて、ホルマリンによる核酸のクロスリンキングによって生じる阻害作用を克服します。本キットは、少量の高品質なDNA精製にQIAamp MinElute Spin Columnを使用しています。QIAamp DNA FFPE Tissue Kitを用いたDNA精製はQIAcube上で完全自動化ができます。

パフォーマンス

QIAamp DNA FFPE Tissue Kitで精製したDNAは、 single nucleotide polymorphism（SNP）およびshort-tandem repeat（STR）のジェノタイピング、薬理ゲノミクス研究など幅広いダウンストリームアプリケーションに使用可能です。QIAamp DNA FFPE Tissue Kitで精製したDNAは、PCRにも使用できます（図 ""）。

図参照

PCR analysis of DNA purified from FFPE tissue samples.

原理

QIAamp DNA FFPE Tissue Kit は少量のサンプルからゲノムおよびミトコンドリアDNAを精製するために実績のあるQIAamp MinElute テクノロジーを使用しています。本キットは、シリカメンブレンの選択的な結合能力および20～100 μl の幅広い溶出容量とを組み合わせています。

特別に至適化した溶解条件は、一晩インキュベーションなしにFFPE組織片からゲノムDNA精製を実現します。Proteinase K 分解後に温度を上げてインキュベートすることで、解離したDNAのホルマリンによるクロスリンキングを部分的に除去し、ダウンストリームアッセイでよい結果が得られるだけでなく、DNA収量も増大します。FFPE組織サンプルから分離したDNAは、新鮮サンプルあるいは凍結した組織サンプルから精製したDNAより通常分子量が小さいことに注意してください。フラグメント化の程度は組織サンプルの種類や保存期間、固定化に使用した条件により異なります。

操作手順

QIAamp DNA FFPE Tissueの操作手順は、6段階からなります（パラフィン除去、溶解、加熱、結合、洗浄、溶出。フローチャート " QIAamp DNA FFPE Tissueの操作手順"）。組織サンプルを溶解した後、QIAamp DNA FFPE Tissue 操作でわずか30 分以内に高純度なDNAが得られます。この方法は、同時に複数のサンプルを調製するのに最適です。

図参照

QIAamp DNA FFPE Tissue Kit procedure.

アプリケーション

QIAamp DNA FFPE Tissue Kitはホルマリン固定パラフィン包埋組織からDNAを精製するために特別にデザインされています。

裏付けデータと数値

PCR analysis of DNA purified from FFPE tissue samples.

Genomic DNA was purified from different FFPE tissue samples using the QIAamp DNA FFPE Tissue Kit. Products of the prnp gene (78 bp, 464 bp, and 727 bp) were amplified by real-time quantitative PCR.

Specifications

Features	Specifications
Applications	Real-time PCR, STR analysis, LMD-PCR
Processing	Manual
Purification of total RNA, miRNA, poly A+ mRNA, DNA or protein	Genomic DNA, mitochondrial DNA
Elution volume	20-100 µl
Format	Spin column
Technology	Silica technology
Main sample type	Formalin fixed paraffin embedded tissue samples
Sample amount	Up to 8 sections, each with a thickness of up to 10 µm and a surface area of up to 250 mm2

リソース

Publications

Gender-related survival differences associated with EGFR polymorphisms in metastatic colon cancer.

Press OA; Zhang W; Gordon MA; Yang D; Lurje G; Iqbal S; El-Khoueiry A; Lenz HJ;

Cancer Res; 2008; 68 (8):3037-42 2008 Apr 15 PMID:18413774

Discrepancy between CYP2D6 phenotype and genotype derived from post-mortem dextromethorphan blood level.

Bailey B; Daneman R; Daneman N; Mayer JM; Koren G;

Forensic Sci Int; 2000; 110 (1):61-70 2000 May 8 PMID:10802201

FAQ

The MinElute spin columns included in the following kits should be stored at 2–8°C upon arrival: AllPrep DNA/RNA Micro, EpiTect Fast DNA Bisulfite, EpiTect Fast FFPE Bisulfite, EpiTect Fast LyseAll Bisulfite, EpiTect Plus DNA Bisulfite, EpiTect Plus FFPE Bisulfite, EpiTect Plus LyseAll Bisulfite, exoRNeasy Serum/plasma Maxi, exoRNeasy Serum/Plasma Midi, GeneRead DNA FFPE, GeneRead rRNA Depletion, GeneRead Size Selection, MinElute Gel Extraction, MinElute PCR Purification, MinElute Reaction Cleanup, miRNeasy FFPE, miRNeasy Micro, miRNeasy Serum/Plasma, QIAamp DNA FFPE, QIAamp DNA Investigator, QIAamp DNA Micro, QIAamp MinElute Media, QIAamp MinElute Virus Spin, QIAamp MinElute Virus Vacuum, RNeasy FFPE, RNeasy Micro, RNeasy Plus Micro.

Short-term storage (up to 4 weeks) at room temperature (15–25°C) does not affect the performance. However, for optimal performance and quality, storage temperature should not exceed 25°C.

FAQ ID - 3560

Small amounts of RNA and DNA may be difficult to measure spectrophotometrically. Fluorometric measurements, or quantitative RT-PCR and PCR are more sensitive and accurate methods to quantify low amounts of RNA or DNA.

Fluorometric measurements are carried out using nucleic acid binding dyes, such as RiboGreen® RNA Quantitation Reagent for RNA, and PicoGreen® DNA Quantitation Reagent for DNA (Molecular Probes, Inc.).

FAQ ID -728