QIAsymphony DSP Virus/Pathogen Kit

Pour la purification automatisée des acides nucléiques viraux ou de l’ADN bactérien/pathogène de 1 à 96 échantillons

Products

Les kits QIAsymphony DSP Virus/Pathogen sont destinés à une utilisation dans le cadre du diagnostic in vitro. 1. Manuel du kit QIAsymphony DSP Virus/Pathogen © QIAGEN France S.A.S. 2013 Les informations relatives aux dispositifs médicaux in vivo et in vitro contenues dans ce site sont à destination des professionnels de santé. Pour plus d'informations, nous vous invitons à consulter le manuel d'utilisation de l'équipement et/ou la notice d'utilisation du réactif.

Caractéristiques

Reproductibilité élevée grâce à un traitement standardisé (1)
Codes-barres permettant le suivi des échantillons et des réactifs (1)
Protocoles optimisés offrant des rendements élevés d’acides nucléiques purifiés (1)
Cartouches de réactifs préremplies pour une utilisation simple (1)

Détails produit

Les kits QIAsymphony DSP Virus/Pathogen combinés avec le système QIAsymphony SP permettent la purification automatisée des acides nucléiques viraux et de l’ADN bactérien/pathogène à partir d’une grande variété d’échantillons dans le cadre du diagnostic in vitro. Les kits sont disponibles en format mini et midi pour des volumes d’échantillons de 200 µl à 1000 µl maximum. Des protocoles optimisés offrent des rendements élevés d’acides nucléiques purs, et des volumes d’élution flexibles permettent d’optimiser facilement la concentration d’acides nucléiques pour chaque application en aval. Des cartouches de réactifs préremplies innovantes permettent de réduire la durée de configuration et la manipulation manuelle. La lecture du code-barres offre un suivi complet des réactifs.

Principe

Les kits QIAsymphony DSP Virus/Pathogen peuvent être utilisés pour purifier les acides nucléiques viraux à partir de sérum, de plasma ou de LCR, et les acides nucléiques viraux et l’ADN bactérien peuvent être purifiés à partir d’échantillons respiratoires, tels que les écouvillons, l’aspirat, le crachat, le lavage broncho-alvéolaire (LBA) ainsi que l’urine et les écouvillons urogénitaux (cervicaux et urétraux). Les kits peuvent être utilisés pour purifier les acides nucléiques à partir d’un vaste panel de virus de l’ADN et de l’ARN ainsi qu’à partir de l’ADN bactérien de bactéries à Gram négatif et à Gram positif.

Les kits QIAsymphony DSP Virus/Pathogen combinent la vitesse et l’efficacité de la purification sur silice des acides nucléiques viraux et bactériens avec la manipulation pratique des particules magnétiques (voir « Schéma du QIAsymphony SP »). Des cartouches de réactifs prêtes à l’emploi innovantes sont préremplies avec l’ensemble des réactifs requis pour la procédure de purification et automatiquement ouvertes par le système QIAsymphony SP, ce qui aide à réduire le risque de contamination environnementale (voir figure « Cartouches de réactifs préremplies et scellées »). Des protocoles optimisés fournissent des acides nucléiques de haute qualité qui ne contiennent pas de protéines, de nucléases ni d’autres impuretés. Les acides nucléiques purifiés avec les kits QIAsymphony DSP Virus/Pathogen sont prêts pour une utilisation directe dans les applications en aval (par exemple la PCR). L’utilisateur a le choix entre plusieurs volumes d’élution.

Procédure

La procédure de purification est conçue pour garantir le traitement sans risques et reproductible d’échantillons potentiellement infectieux. Elle comprend 4 étapes : lyse, liaison, lavage et élution (voir « Procédure QIAsymphony DSP Virus/Pathogen »). L’organisation de la table de travail est rapide, ce qui permet de gagner un temps précieux. Il suffit de placer jusqu’à 2 cartouches de réactifs dans le tiroir des consommables. Les cartouches de réactifs peuvent provenir du même kit ou de kits différents, ce qui permet d’effectuer différentes procédures de purification pour un même cycle de 96 échantillons. Les volumes de réactifs utilisés correspondent au nombre d’échantillons sélectionnés, vous apportant ainsi un contrôle total des coûts.

Protocoles à utiliser avec le kit QIAsymphony DSP Virus/Pathogen
Protocole	Kit	Échantillons	Volume traité
Cellfree 200	QIAsymphony DSP Virus/Pathogen Mini Kit	Plasma, sérum et LCR	200 µl
Cellfree 500	QIAsymphony DSP Virus/Pathogen Midi Kit	Plasma, sérum et LCR	500 µl
Cellfree 1000	QIAsymphony DSP Virus/Pathogen Midi Kit	Plasma, sérum et LCR	1 000 µl
Complex 200	QIAsymphony DSP Virus/Pathogen Mini Kit	Échantillons respiratoires (LBA, écouvillons séchés, milieux de transport, aspirat, crachat) et échantillons urogénitaux (urine, milieux de transport)	200 µl
Complex 400	QIAsymphony DSP Virus/Pathogen Midi Kit	Échantillons respiratoires (LBA, écouvillons séchés, milieux de transport, aspirat, crachat) et échantillons urogénitaux (urine, milieux de transport)	400 µl
Complex 800	QIAsymphony DSP Virus/Pathogen Midi Kit	Échantillons respiratoires (LBA, écouvillons séchés, milieux de transport, aspirat, crachat) et échantillons urogénitaux (urine, milieux de transport)	800 µl

Applications

Les kits QIAsymphony DSP Virus/Pathogen permettent la détection sensible d’une grande variété de virus d'ADN et d'ARN ainsi que des pathogènes bactériens. Les rendements sont linéaires, ce qui permet une analyse quantitative précise pour les titres viraux ou bactériens faibles et élevés. Les acides nucléiques de grande qualité sont prêts à être utilisés directement dans toutes les applications en aval, notamment les analyses de détection sensible à l’aide de la PCR quantitative en temps réel ou RT-PCR.

Données et illustrations utiles

QIAsymphony DSP Virus/Pathogen procedure

Schematic of the QIAsymphony SP principle

Ressources

FAQ

Tube carriers for up to 24 tubes (primary or secondary tubes or tubes containing internal controls) can be used. A list of compatible labware formats for sample input can be found at www.qiagen.com/goto/dsphandbooks. Slots 1–4 are used for samples to be processed. The internal control-carrier RNA-Buffer AVE mixture is loaded into Slot 5.

FAQ ID -2936

The ACS specifies the combination of a protocol and a predefined carrier RNA–internal control mixture. The user can define an internal control mixture using the QIAsymphony Management Console. A predefined internal control-carrier RNA-Buffer AVE mixture can be automatically identified by the instrument using a bar code label or it can be chosen manually.

FAQ ID -2933

Tissue: If no information about the expected yield is available, we recommend starting with 25 mg sample material. Depending on the yield obtained, the sample size can be increased in subsequent preparations to a maximum of 50 mg.

FFPE: Up to 4 sections, each with a thickness of up to 10 µm, or 8 sections with a thickness of up to 5 µm and a surface area of up to 250 mm2, can be combined in one preparation.

FAQ ID -2927

We recommend using racked Elution Microtubes CL (cat. no. 19588) for elution. Alternatively, 2 ml Sarstedt tubes (with screw caps, Sarstedt cat. no. 72.693) can be used. A list of compatible labware formats for eluates can be found at www.qiagen.com/goto/dsphandbooks.

FAQ ID -2937

The QIAsymphony DSP Virus/Pathogen Mini Kit is used with the Cellfree200, Complex200 and Complex200_OBL protocols.

The QIAsymphony DSP Virus/Pathogen Midi Kit is used with the Cellfree500, Cellfree1000, Complex400, Complex400_OBL, Complex800, and Complex800_OBL protocols.

All complex protocols require Buffer ATL, which is not included in the QIAsymphony DSP Virus/Pathogen Kits. Buffer ATL can be ordered separately (Buffer ATL (4 x 50 ml), cat. no. 939016).

FAQ ID -2930

Yes. The QIAsymphony DSP Virus/Pathogen Kits are designated “For In Vitro Diagnostic Use”. It is the user’s responsibility to validate system performance for any procedures used in their laboratory that are not covered by the QIAGEN performance evaluation studies. The system performance has been established in performance evaluation studies purifying viral DNA and RNA from human serum, plasma, or cerebrospinal fluid (CSF), and purifying viral DNA and RNA, as well as bacterial DNA, from respiratory and urogenital samples. To minimize the risk of a negative impact on the diagnostic results, adequate controls for downstream applications should be used. For further validation, the guidelines of the International Conference on Harmonisation of Technical Requirements (ICH) in ICH Q2 R(1) Validation of Analytical Procedures: Text and Methodology are recommended. Any diagnostic results that are generated must be interpreted in conjunction with other clinical or laboratory findings.

FAQ ID -2939

Plasma, serum, and CSF samples can be processed using the QIAsymphony DSP Virus/Pathogen cellfree protocols. Respiratory samples (sputum, BAL, aspirates, dried swabs, transport media), and urogenital samples (urine, urogenital swabs, transport media) can be processed using the pathogen complex protocols.

FAQ ID -2928

For all cellfree and complex protocols, an eluate volume of 60 µl, 85 µl, or 110 µl can be selected. These are the minimum accessible volumes of eluate in the final elution tube. The initial elution volumes, which have to be used for the internal control, as well as titer calculations, are 90 µl, 115 µl, and 140 µl.

FAQ ID -2938

Pretreatment can improve the nucleic acid extraction for some sample types. Viscous samples (e.g., sputum, respiratory aspirates) might require liquefaction to enable pipetting. Performance may be improved for Gram positive bacteria by pretreatment with lysozyme. Pretreatment protocols are provided in the QIAsymphony DSP Virus/Pathogen Handbook.

FAQ ID -2931

The QIAsymphony DSP Virus/Pathogen Mini kit can be used to process 192 samples (96 per reagent cartridge). The Midi kit can be used to process 96 samples (48 per reagent cartridge) using the Cellfree1000, Complex800, and the Complex800_OBL protocols. The Midi Kit can also be used to process 144 samples (72 per reagent cartridge) using the Cellfree500, Complex400, and the Complex400_OBL protocols.

FAQ ID -2935

The sample volume depends on the QIAsymphony DSP Virus/Pathogen protocols:

Cellfree200 — 200 µl
Cellfree500 — 500 µl
Cellfree1000 — 1000 µl
Complex200 and Complex200_OBL — 200 µl
Complex400 and Complex400_OBL — 400 µl
Complex800 and Complex800_OBL — 800 µl

FAQ ID -2929

Sample material can be stored at 2–8°C for up to 6 h. For longer storage, samples should be kept at –20°C or –70°C.

FAQ ID -2934

No. The use of internal controls is not mandatory, but is strongly recommended. When using internal controls, they are added to the carrier RNA mixture (total volume of the mixture must be 120 µl).

FAQ ID -2932