MinElute Reaction Cleanup Kit

Pour le nettoyage d’ADN de 5 µg maximum (70 pb à 4 kb) à partir de réactions enzymatiques

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MinElute Reaction Cleanup Kit (50)

Cat. No. / ID:   28204

50 MinElute Spin Columns, tampons, Collection Tubes (2 ml)
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Preparations
50
250
Le MinElute Reaction Cleanup Kit est destiné aux applications de biologie moléculaire. Ce produit n’est pas conçu pour le diagnostic, la prévention ou le traitement des maladies.

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Caractéristiques

  • Très faibles volumes d’élution
  • Procédure rapide et manipulation facile
  • Récupérations importantes et reproductibles
  • Colorant de chargement gélifié pour simplifier l’analyse d’échantillon

Détails produit

Le MinElute Reaction Cleanup Kit contient des colonnes de centrifugation, tampons et tubes de prélèvement pour la purification sur membrane de silice d’ADN de 70 pb à 4 kb à partir de réactions enzymatiques. Les colonnes de centrifugation sont conçues pour permettre l’élution dans de très faibles volumes (de l’ordre de 10 µl), ce qui donne des rendements élevés d’ADN hautement concentré. Un indicateur de pH intégré simplifie la détermination du pH optimal pour la liaison de l’ADN à la colonne de centrifugation. La procédure peut être entièrement automatisée sur le système QIAcube Connect. Les fragments d’ADN purifiés avec le système MinElute peuvent s’utiliser directement dans toutes les applications, y compris le séquençage, l’analyse de puce à ADN, la ligature et la transformation, la digestion par enzymes de restriction, le marquage, la micro-injection, la PCR et la transcription in vitro.

Pour des résultats optimaux, il est recommandé d’utiliser ce produit avec le QIAvac 24 Plus.

Performances

Le MinElute Reaction Cleanup Kit permet le nettoyage d’ADN allant jusqu’à 5 µg (70 pb à 4 kb) à partir de réactions enzymatiques, ce qui donne des rendements élevés d’ADN adapté à de nombreuses applications. Le kit contient des colonnes de centrifugation destinées au nettoyage de réactions enzymatiques. À l’aide d’une microcentrifugeuse ou d’une rampe à vide, vous obtenez rapidement une grande concentration de fragments d’ADN (70 pb à 4 kb). (Les fragments d’ADN supérieurs à 4 kb doivent être purifiés avec le système QIAquick.)

Exemples d’enzymes totalement éliminées par le MinElute Reaction Cleanup Kit
Protéine Poids moléculaire par sous-unité enzymatique (kDa)
ADN polymérase I 109
Fragment de Klenow 62
Phosphatase alcaline intestinale de veau 69
ADN ligase T4 55
Polynucléotide kinase T4 35
Transférase terminale 32
DNase I 31
Enzymes de restriction Variable

Principe

Les MinElute Kits contiennent une membrane de silice permettant la liaison de l’ADN dans un tampon de forte salinité et l’élution avec un tampon de faible salinité ou de l’eau. La procédure de purification permet d’éliminer les amorces, les nucléotides, les enzymes, l’huile minérale, les sels, l’agarose, le bromure d’éthidium et d’autres impuretés des échantillons d’ADN. La technologie à membrane de silice permet d’écarter les problèmes liés aux résines et aux bouillies non homogènes. Des tampons de liaison spéciaux sont optimisés pour des applications spécifiques et favorisent l’adsorption sélective de molécules d’ADN de tailles bien précises.

Colorant de chargement gélifié

Afin de faciliter un traitement et une analyse plus rapides et pratiques des échantillons, un colorant de chargement gélifié est fourni. Le colorant de chargement GelPilot contient trois colorants de suivi (xylène cyanol, bleu de bromophénol et orange G) pour faciliter l’optimisation du temps d’exécution du gel d’agarose et empêcher les petits fragments d’ADN de migrer trop loin (voir l’illustration «  Colorant de chargement GelPilot »).

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Procédure

Le système MinElute utilise une procédure simple de liaison-lavage-élution (voir le schéma «  Procédure MinElute »). Le tampon de liaison est ajouté directement à la réaction enzymatique puis le mélange est appliqué à la MinElute Spin Column. Le tampon de liaison contient un indicateur de pH, cela simplifie la détermination du pH optimal pour la liaison de l’ADN (voir l’illustration  « Colorant indicateur de pH »). Les acides nucléiques se fixent à la membrane de silice dans les conditions de forte salinité du tampon. Les impuretés sont éliminées et l’ADN pur est élué dans un petit volume de tampon de faible salinité ou d’eau, prêt à être utilisé dans d’autres applications.

Manipulation

Les MinElute Spin Columns offrent deux possibilités de manipulation pratiques (voir le schéma « Procédure MinElute »). Les colonnes de centrifugation peuvent être insérées dans une microcentrifugeuse de paillasse classique ou dans n’importe quelle rampe à vide dotée de connecteurs Luer, de type QIAvac 24 Plus ou QIAvac 6S avec QIAvac Luer Adapters. Le MinElute Reaction Cleanup Kit, tout comme d’autres kits QIAGEN avec colonnes de centrifugation, peut être entièrement automatisé sur le QIAcube Connect, cela permet d’accroître la productivité et de standardiser les résultats (voir les illustrations « Possibilités de manipulation des colonnes de centrifugation  A,  B,  C,  D et  E » et «  QIAcube Connect »).

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Applications

Les fragments d’ADN purifiés à l’aide du système MinElute peuvent s’utiliser directement dans toutes les applications, notamment :

  • Séquençage
  • Analyse de puce à ADN
  • Ligature et transformation
  • Digestion par enzymes de restriction
  • Marquage

Données et illustrations utiles

Specifications

FeaturesSpecifications
Binding capacity5 µg
Fragment size70 pb – 4 kb
ProcessingManual
Elution volume10 µl
Recovery: oligonucleotides dsDNARécupération : oligonucléotides, ADNdb
Removal <10mers 17–40mers dye terminator proteinsÉlimination < 40 mères
FormatTube
Sample type: applicationsADN, oligonucléotides : réactions enzymatiques
TechnologyTechnologie à base de silice

Ressources

Safety Data Sheets (1)
Kit Handbooks (1)
MinElute Handbook
PDF (611KB)
Quick-Start Protocols (1)
Certificates of Analysis (1)

Publications

Oncocytic change in pleomorphic adenoma: molecular evidence in support of an origin in neoplastic cells.
Di Palma S; Lambros MB; Savage K; Jones C; Mackay A; Dexter T; Iravani M; Fenwick K; Ashworth A; Reis-Filho JS;
J Clin Pathol; 2006; 60 (5):492-9 2006 Feb 7 PMID:16467165
Similarity and differences in the Lactobacillus acidophilus group identified by polyphasic analysis and comparative genomics.
Berger B; Pridmore RD; Barretto C; Delmas-Julien F; Schreiber K; Arigoni F; Brüssow H;
J Bacteriol; 2006; 189 (4):1311-21 2006 Dec 1 PMID:17142402
Chromosome Conformation Capture Carbon Copy (5C): a massively parallel solution for mapping interactions between genomic elements.
Dostie J; Richmond TA; Arnaout RA; Selzer RR; Lee WL; Honan TA; Rubio ED; Krumm A; Lamb J; Nusbaum C; Green RD; Dekker J;
Genome Res; 2006; 16 (10):1299-309 2006 Sep 5 PMID:16954542
Quantitative proteomics of the archaeon Methanococcus maripaludis validated by microarray analysis and real time PCR.
Xia Q; Hendrickson EL; Zhang Y; Wang T; Taub F; Moore BC; Porat I; Whitman WB; Hackett M; Leigh JA;
Mol Cell Proteomics; 2006; 5 (5):868-81 2006 Feb 17 PMID:16489187
RAISE: a simple and novel method of generating random insertion and deletion mutations.
Fujii R; Kitaoka M; Hayashi K;
Nucleic Acids Res; 2006; 34 (4):e30 2006 Feb 21 PMID:16493137

FAQ

Are Buffer PB of the QIAquick PCR Purification Kit and Buffer QG of the QIAquick Gel Extraction Kit interchangeable?

Buffer PB of the QIAquick PCR Purification Kit cannot be used to extract DNA from agarose gels. However, Buffer QG of the QIAquick Gel Extraction Kit can be used to remove salt and proteins from enzymatic reactions by adding 3 volumes of Buffer QG and 1 volume of isopropanol to the reaction and proceeding with step 6 of the Gel Extraction Spin Protocol in the QIAquick Spin Handbook. See the QIAquick Spin Handbook for a list of reactions which can be cleaned up with the various QIAquick kits.

FAQ ID -786
I received a kit containing the MinElute columns; however, they were left out for a while and not stored at 2–8°C upon receipt. Can I still use them?

The MinElute spin columns included in the following kits should be stored at 2–8°C upon arrival: AllPrep DNA/RNA Micro, EpiTect Fast DNA Bisulfite, EpiTect Fast FFPE Bisulfite, EpiTect Fast LyseAll Bisulfite, EpiTect Plus DNA Bisulfite, EpiTect Plus FFPE Bisulfite, EpiTect Plus LyseAll Bisulfite, exoRNeasy Serum/plasma Maxi, exoRNeasy Serum/Plasma Midi, GeneRead DNA FFPE, GeneRead rRNA Depletion, GeneRead Size Selection, MinElute Gel Extraction, MinElute PCR Purification, MinElute Reaction Cleanup, miRNeasy FFPE, miRNeasy Micro, miRNeasy Serum/Plasma, QIAamp DNA FFPE, QIAamp DNA Investigator, QIAamp DNA Micro, QIAamp MinElute Media, QIAamp MinElute Virus Spin, QIAamp MinElute Virus Vacuum, RNeasy FFPE, RNeasy Micro, RNeasy Plus Micro.

Short-term storage (up to 4 weeks) at room temperature (15–25°C) does not affect the performance. However, for optimal performance and quality, storage temperature should not exceed 25°C.

FAQ ID - 3560
Are the columns of the MinElute Reaction Cleanup-, Gel Extraction-, and PCR Purification Kit identical?
Yes, and therefore they are interchangeable.
FAQ ID -581
Why does my DNA sample float out of the slot when loading it onto an agarose gel?

DNA fragments purified with the QIAGEN DNA Cleanup Systems, i.e., the QIAquick PCR Purification Kit, the MinElute Reaction Cleanup Kit, the QIAEX II Gel Extraction Kit etc. may float out of the loading wells of agarose gels due to residual ethanol carried over from the wash step with Buffer PE (despite the addtition of glycerol-containing loading buffer).

Use either of the following options to remove residual ethanol from the eluate:

  • re-purify the sample using a QIAquick-, or MinElute column, or QIAEX II resin
  • incubate the eluate at 56°C for 10 min to evaporate the ethanol
  • dry down the sample in a vacuum centrifuge, and resuspend the pellet in a small volume of sterile water
FAQ ID -205
Do you have information about the cleanup of single-stranded DNA (ssDNA) with QIAquick columns?

As a rule of thumb, single-stranded DNA binds to silica with approximately half the affinity of a double-stranded DNA fragment of the same length under the buffer conditions used in the QIAquick and MinElute Kits. Even though no systematic experimental data exists, we expect that recovery of ssDNA fragments of approximately 200 nucleotides and below will not be very efficient after cleanup using the QIAquick PCR Purification Kit or MinElute PCR Purification Kit. By comparison, it should be possible to purify fragments longer than 140 nucleotides using the QIAquick Gel Extraction Kit.

Note that recovery of single strand DNA is influenced to some degree also by factors such as base composition and secondary structure. It has to be determined empirically by the researcher if cleanup of single-stranded DNA with QIAquick columns yields satisfactory results.

FAQ ID -759
What is the composition of Buffer EB?

The composition of Buffer EB is:

  • 10 mM Tris-Cl, pH 8.5

Buffer EB is the elution buffer used in the QIAquick PCR, Gel Extraction, Nucleotide Removal Kits, and MinElute Kits for DNA cleanup, and the QIAprep Miniprep Kits for small-scale plasmid purification. The purified DNA can also be eluted in TE (10 mM Tris-Cl, 1 mM EDTA, pH 8.0), but the EDTA may inhibit subsequent enzymatic reactions.

FAQ ID -199
What is the small band below my fragment of interest on an agarose gel after DNA cleanup using QIAquick?

Occasionally, DNA fragments eluted from the silica matrix of QIAquick, MinElute or QIAEX II Kits will contain denatured single-stranded DNA (ssDNA), appearing as a smaller band on an analytical gel. Under certain conditions, chaotropic agents (present in all silica-based DNA purification methods) can denature DNA fragments. This is a rare event that may be influenced by sequence characteristics such as the presence of inverted repeats or A–T-rich stretches.

Because salt and buffering agents promote renaturation of DNA strands, the following tips are recommended:

  • use the eluted DNA to prepare your downstream enzymatic reaction, but omit the enzyme. Incubate the reaction mix at 95°C for 2 minutes to reanneal the ssDNA, and allow the tube to cool slowly to room temperature before adding the enzyme and proceeding
  • alternatively, the DNA can be eluted from the silica-gel membrane or resin in 10 mM Tris buffer containing 10 mM NaCl. However, the salt concentration of the eluate must then be taken into consideration in downstream applications.
FAQ ID -148
Can I buy QIAquick and MinElute columns separately?

The QIAquick Spin Columns (100) (cat. no. 28115) in the QIAquick PCR Purification, Gel Extraction, Nucleotide Removal and PCR & Gel Cleanup kits are also sold separately from the kits.

The MinElute columns in the MinElute PCR Purification, Gel Extraction and Reaction Cleanup kits are not sold separately.

We always provide extra buffers in our kits so you can scale up reactions, add extra washes or allow for spillage.

FAQ ID -2460