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Cat. No. / ID: 67563
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Le MagAttract HMW DNA Kit permet l’isolement reproductible d’un ADN génomique > 150 kb. L’ADN isolé avec le MagAttract HMW DNA Kit et d’autres procédures avec billes magnétiques a été comparé à l’aide de l’électrophorèse sur gel en champs pulsés. Le MagAttract HMW DNA Kit a démontré des performances supérieures pour l’isolement d’ADN de poids moléculaire élevé (voir l’illustration Isolement réussi d’ADN de poids moléculaire élevé)..
Rendements et pureté importants et homogènes
Le MagAttract HMW DNA Kit applique une procédure simple et pratique qui permet d’obtenir des rendements élevés d’ADN génomique pur de poids moléculaire élevé. Les conditions de lyse favorables limitent la fragmentation de l’ADN, tandis que les contaminants et les inhibiteurs de PCR sont efficacement éliminés, vous obtenez alors un ADN pur de poids moléculaire élevé. La chimie et la procédure optimisées du MagAttract HMW DNA Kit améliorent nettement le rendement et la pureté de l’ADN, comparé aux méthodes classiques à colonnes de centrifugation ou billes magnétiques d’autres fournisseurs (voir les illustrations Rendements et pureté optimaux et Rendements améliorés à partir de divers types d’échantillons).
Élimination efficace des inhibiteurs de PCR
Des applications particulièrement sensibles, comme la PCR en temps réel ou le NGS, nécessitent l’élimination des anticoagulants, des enzymes, des cations divalents et autres inhibiteurs de ce type. On procède à une amplification par PCR en temps réel de l’ADN isolé à partir d’échantillons de sang stabilisés à l’EDTA, à l’héparine et au citrate, à l’aide du MagAttract HMW DNA Kit. Aucune inhibition n’est observée dans les échantillons, prouvant ainsi une forte corrélation linéaire des valeurs de CT avec le volume d’échantillon initial (voir l’illustration Aucune inhibition dans les échantillons issus de sang avec anticoagulant).
ADN génomique prêt pour le séquençage à haut débit
Dans la mesure où les technologies de séquençage massivement parallèle (Massively parallel sequencing, MPS) utilisent de courtes longueurs de lecture, le séquençage peut être réalisé avec un ADN génomique intact > 10 kb. Néanmoins, l’assemblage de novo du génome et la découverte de variants structurels innés et acquis demeurent difficiles avec les produits de purification d’ADN standard. Les banques de paires conjuguées contenant des inserts plus importants peuvent avoir une incidence significative sur la réussite du séquençage, tout particulièrement pour les génomes complexes à multiples répétitions. L’ADN génomique de poids moléculaire élevé obtenu avec le MagAttract HMW DNA Kit est prêt à être utilisé dans des expériences de NGS.
Paramètre | Caractéristique |
---|---|
Nombre total de lectures cartographiées (longues) | 6521106 |
Taux d’erreur | 0,36 % |
Taux d’indel | 0,01 % |
Chimères | 0,14 % |
Pourcentage de duplication | 1,15 % |
Le protocole MagAttract adapté permet des résultats reproductibles en seulement 70 minutes.
Protocole rapide et optimisé
Des tampons et enzymes optimisés lysent délicatement les échantillons tout en limitant la fragmentation de l’ADN génomique. La procédure comprend 4 étapes simples : lyse, liaison, lavage et élution. Après la lyse de l’échantillon, l’ADN se lie à la surface des billes magnétiques. Au cours des étapes de lavage, les contaminants et inhibiteurs de PCR sont efficacement éliminés puis un ADN pur de poids moléculaire élevé est élué dans du Buffer AE (voir l’illustration Procédure du MagAttract HMW DNA Kit).
Répartition par taille type d’ADN extrait de cellules avec le MagAttract HMW DNA Kit. Les échantillons ont été analysés avec le système Femto Pulse et les signaux ont été normalisés par rapport au pic maximal.
Features | Specifications |
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Sample amount | 200 μl de sang ; jusqu’à 25 mg de tissus ; 2 × cellules bactériennes 10e9 |
Process time | ~ 70 minutes pour 12 échantillons |
Elution volume | 100 à 200 µl |