QuantiNova Pathogen +IC Kit

Pour la détection ultrarapide et simultanée de l’ARN/ADN viral et de l’ADN bactérien, y compris le contrôle interne

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QuantiNova Pathogen +IC Kit (100)

Cat. No. / ID:   208652

Pour 100 x 20 µl de réactions : 1 x 500 µl de QuantiNova Pathogen Master Mix, 1 x 500 µl de Yellow Template Dilution Buffer, 1 x 250 µl de ROX Reference Dye, 1 x 1,9 µl RNase-Free Water, 1 x 1 500 µl de Nucleic Acid Dilution Buffer, 1 x 100 µl de Internal Control RNA, 1 x 100 µl de Internal Control RNA, 1 x 200 µl de IC Probe Assay
KitAssay
QuantiNova Pathogen +IC Kit
QuantiNova IC Assay
Reactions
100 x 20 µl
500 x 20 µl
Le QuantiNova Pathogen +IC Kit est destiné aux applications de biologie moléculaire. Ce produit n’est pas destiné au diagnostic, à la prévention ni au traitement d’une maladie, il n’a pas été validé pour un tel usage que ce soit seul ou associé à d’autres produits.
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Caractéristiques

  • Contrôles internes préoptimisés sans frais supplémentaires
  • (RT)-PCR 4-plex pour la détection des cibles pathogènes et contrôle interne
  • Procédure unique de hot start en deux phases pour une configuration pratique à température ambiante
  • RT stable incluse dans le mélange principal, offrant un protocole facile à utiliser
  • Contrôle visuel du pipetage pour minimiser les erreurs

Détails produit

Le QuantiNova Pathogen +IC Kit est conçu pour la détection sensible et rapide par PCR en temps réel (RT-) d’acides nucléiques de pathogènes à l’aide de sondes spécifiques à une séquence. Le kit contient des réactifs pour la détection 4-plex en temps réel de cibles pathogènes définies par l’utilisateur (par exemple, virus, bactéries, champignons, etc.) et du QuantiNova Internal Control (IC) RNA ou DNA Les IC et le dosage sont inclus pour être utilisés comme contrôles d’extraction ou d’amplification, ce qui permet une interprétation correcte des résultats de détection négatifs. En outre, le kit prêt à l’emploi ultrarapide offre une configuration pratique de la réaction à température ambiante pour une procédure rationalisée et automatisée, ainsi qu’un contrôle visuel du pipetage pour améliorer les normes de manipulation et de sécurité. Pour des raisons de commodité, le mélange principal peut être conservé entre 2 et 8 °C.

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Performances

Le QuantiNova Pathogen +IC Kit permet la détection simultanée des cibles ARN ou ADN virales et du QuantiNova Internal Control (IC) sur une large plage linéaire sans perte de sensibilité lors du multiplexage. Le protocole a été développé pour effectuer des expériences de thermocyclage ultrarapide avec une grande fiabilité sur la plupart des thermocycleurs. L’amplification combinée des cibles pathogènes et du contrôle interne ARN ou ADN accroît la sécurité des processus en garantissant l’interprétation correcte des résultats négatifs. L’IC inclus peut être utilisé pour enregistrer le processus de purification et/ou d’amplification de l’acide nucléique, tandis que le contrôle visuel du pipetage permet de vérifier visuellement le pipetage manuel ou robotisé (voir figure  Configuration précise de la réaction indiquée par le contrôle de pipetage intégré). Grâce à la procédure unique de hot start en deux phases, il est possible d’effectuer une configuration manuelle ou automatisée de la réaction à température ambiante sans compromettre les performances (voir figure  Principe du nouveau mécanisme hot start en deux phases QuantiNova). Le QuantiNova Pathogen +IC Kit est robuste même en présence d’inhibiteurs et permet l’utilisation d’amorces/sondes dégénérées. Le kit offre une qPCR multiplex ultrarapide et contrôlée en cours de processus ce qui augmente l’efficacité et la fiabilité de la procédure.

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Principe

Pour permettre une plus grande sécurité des processus grâce à l’interprétation correcte des résultats négatifs, chaque QuantiNova Pathogen +IC Kit contient des réactifs pour la détection multiplex en temps réel de cibles pathogènes définies par l’utilisateur avec des contrôles internes. L’amplification des gènes cibles et des gènes de contrôle dans la même réaction augmente la fiabilité en minimisant les erreurs de manipulation. Il est possible d’utiliser l’IC fourni pour tester la réussite de l’amplification (par exemple, exclusion des inhibiteurs de la PCR) ou de l’ajouter à l’échantillon avant la purification de l’acide nucléique pour contrôler à la fois l’efficacité du processus de purification et l’amplification de la PCR ou de la RT-PCR. La PCR en temps réel et la RT-PCR en une étape peuvent être réalisées simultanément à l’aide du même protocole. Le kit utilise également une procédure de hot start en deux phases (voir figure  Principe du nouveau mécanisme hot start en deux phases QuantiNova). Cela comprend l’activation par la chaleur de la transcriptase inverse HotStaRT-Script à 50 °C et de la polymérase PCR à 95 °C. À basse température, le script HotStaRT forme un complexe avec une molécule RT-Blocker ce qui entraîne son inactivation. À 50 °C, le complexe se dissocie et l’enzyme HotStaRT-Script active est libérée. La QuantiNova DNA Polymerase est conservée dans un état inactif par l’anticorps QuantiNova et un nouvel additif, le QuantiNova Guard, qui stabilise le complexe. Cela permet d’améliorer la rigueur de la procédure de hot start et d’éviter l’extension d’amorces et des dimères d’amorces non spécifiquement renaturées. Dans les 2 minutes qui suivent l’augmentation de la température à 95 °C, l’anticorps QuantiNova et le QuantiNova Guard sont dénaturés et la QuantiNova DNA Polymerase est activée permettant l’amplification par PCR. Ce hot start unique en deux phases permet à la réaction de rester stable pendant au moins 1 heure à température ambiante ce qui évite la création d’artefacts et facilite également la configuration automatisée de la réaction.
De manière complémentaire, le mélange principal fourni avec le kit contient un colorant bleu inerte qui n’interfère pas avec la transcription inverse ni avec la PCR en temps réel , mais augmente la visibilité dans le tube ou le puits. Le QuantiNova Yellow Template Dilution Buffer contient un colorant jaune inerte. Lorsque l’acide nucléique matrice, dilué avec le QuantiNova Yellow Template Dilution Buffer, est ajouté au mélange principal, la couleur de la solution se modifie du bleu au vert, fournissant une indication visuelle du pipetage correct et de la configuration de la réaction (voir figure  Accurate reaction setup indiquée par le contrôle de pipetage intégré). Le mélange principal comprend une combinaison équilibrée d’ions K+ et NH4+ ainsi que le Factor MP synthétique unique qui, ensemble, favorisent une renaturation stable et efficace des amorces et des sondes sur la matrice d’acide nucléique, ce qui permet une grande efficacité de la PCR, même dans les réactions multiplex (voir figure  Le tampon PCR multiplex unique favorise une renaturation stable et efficace). Le tampon PCR spécialement conçu contient du Q-Bond, qui réduit considérablement les temps de dénaturation, de renaturation et d’extension (voir figure  Mécanisme de thermocyclage rapide pendant la renaturation). Le QuantiTect Nucleic Acid Dilution Buffer, fourni avec le kit, stabilise les étalons d’ARN et d’ADN pendant la dilution et la configuration de la réaction et empêche la perte d’acides nucléiques sur les surfaces en plastique, telles que les tubes ou les pointes de pipette. Le mélange principal peut être conservé entre 2 et 8 °C jusqu’à 12 mois, et la réaction est stable à température ambiante pendant au moins une heure, ce qui est pratique pour les procédures automatisées.

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Procédure

Le QuantiNova Pathogen +IC Kit fournit une procédure simple pour la détection de cibles pathogènes définies par l’utilisateur et l’IC. Il contient un mélange principal prêt à l’emploi pour la détection simultanée en temps réel de l’ARN viral (RT-PCR en 1 étape) ou de l’ADN viral, bactérien et fongique (PCR). Il n’est pas nécessaire d’optimiser les conditions de réaction et de thermocyclage : il suffit de mélanger le master mix fourni avec le Pathogen Assay (amorces et sonde), le supplied Internal Control Assay et l’IC DNA ou RNA. L’IC peut également être ajouté à la procédure de purification de l’échantillon. Ajoutez ensuite votre échantillon d’ADN ou d’ARN et démarrez la réaction sur n’importe quel thermocycleur. Le manuel du kit contient des protocoles optimisés pour l’utilisation des sondes TaqMan sur un grand nombre de thermocycleurs. Le contrôle visuel du pipetage permet de limiter les erreurs humaines en autorisant des vérifications visuelles après un pipetage manuel ou robotisé. La procédure unique de hot start en deux phases permet une configuration manuelle ou automatisée de la réaction à température ambiante sans pour autant compromettre les performances. Chaque QuantiNova Pathogen +IC Kit se compose d'Internal Control Assay et d'IC DNA ou RNA à utiliser comme contrôle d’amplification en l’ajoutant directement au mélange réactionnel. Par ailleurs, l’IC peut être ajouté à la procédure de purification afin de contrôler à la fois le processus de purification et l’amplification. Le dosage de contrôle interne fourni dans le kit utilise MAX comme colorant de référence. Un Internal Control Assay marqué avec un analogue de Cy5 est également disponible en tant qu’accessoire.

Applications

Le QuantiNova Pathogen +IC Kit permet une PCR en temps réel sensible ou une RT-PCR en une étape à l’aide de sondes spécifiques à une séquence pour la détection simultanée de l’ADN et/ou de l’ARN d’un pathogène, y compris un contrôle interne. Le kit permet une configuration automatisée des réactions à température ambiante et est utilisable sur un grand nombre de thermocycleurs en temps réel.

Données et illustrations utiles

Ressources

Selection Guides (1)
Kit Handbooks (2)
QuantiNova LNA Probe PCR Handbook
Safety Data Sheets (1)
Quick-Start Protocols (2)
Certificates of Analysis (1)