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Cat. No. / ID: 873011
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Le kit therascreen IDH1/2 RGQ PCR fournit les réactifs nécessaires à la réalisation de 9 réactions distinctes d’amplification pour la détection de 12 mutations (1) :
Gène | Mutation | Changement de base | ID Cosmic |
---|---|---|---|
IDH1 | Arg132His (R132H) | 395G>A | COSM28746 |
Arg132Cys (R132C) | 394C>T | COSM28747 | |
Arg132Ser (R132S) | 394C>A | COSM28748 | |
Arg132Gly (R132G) | 394 C>G | COSM28749 | |
Arg132Leu (R132L) | 395G>T | COSM28750 | |
Arg132Val (R132V) | 394_395 CG>GT | COSM28751 | |
Arg100Gln (R100Q) | 299G>A | COSM88208 | |
IDH2 | Arg172Lys (R172K) | 515G>A | COSM33733 |
Arg172Met (R172M) | 515G>T | COSM33732 | |
Arg172Trp (R172W) | 514A>T | COSM34039 | |
Arg172Ser (R172S) | 516G>T | COSM34090 | |
Arg172Gly (R172G) | 514A>G | COSM33731 |
Les mélanges sonde et amorces totaux (PPM-Total) utilisent des sondes et des amorces pour amplifier à la fois les séquences cibles mutées et de type sauvage. (1)
Les mélanges sonde et amorces de détection des mutations combinent sondes et amorces pour amplifier à la fois les séquences cibles mutées et de type sauvage, plus un oligonucléotide bloqué à l’extrémité 3' avec l’ajout d’un groupe de phosphates pour inhiber l’extension (clampage par PCR), spécifique à la séquence cible de type sauvage. (1)
Lorsque la matrice destinée à la PCR contient la séquence de type sauvage, l’oligonucléotide 3'-phosphate domine la liaison avec les amorces de PCR en raison d’une plus grande affinité. L’extension et l’amplification dans le cas de l’ADN polymérase sont faibles voire inexistantes. (1)
En présence d’une séquence mutée, la liaison d’amorce domine la liaison d’oligonucléotide 3'-phosphate et l’amplification se poursuit. (1)
L’amplification spécifique d’allèle s’effectue par le biais du système ARMS (système de mutation réfractaire par amplification), qui exploite la capacité de l’ADN polymérase à établir une distinction entre un appariement et un mésappariement à l’extrémité 3' d’une amorce de PCR. (1)
Lorsque l’amorce de PCR est entièrement appariée, l’efficacité de l’amplification est maximale. Lorsque la base 3' est mésappariée, seule une amplification de faible bruit de fond se produit. (1)