Certal Residual DNA Detection Kits

Para la deteccion sensible basada en sondas de ADN residual de celulas huesped de ovario de hamster chino (CHO), incluido un control interno

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Certal CHO Detection Kit (100)

Cat. No. / ID:   211822

Para 100 reacciones de 25 µl: Certal Residual DNA PCR Master Mix 1,25 ml, Certal Internal Control DNA y Assay, CHO DNA Positive Control y CHO-Assay, uracilo N-glicosilasa 100 µl, High-ROX Dye Solution 210 µl, ROX Dye Solution 210 µl, Nucleic Acid Dilution Buffer, TE Buffer
Los Certal Residual DNA Detection Kits están previstos para aplicaciones de biología molecular en las pruebas de fármacos. Estos productos no están concebidos para el diagnóstico, la prevención ni el tratamiento de enfermedades.Ver las marcas comerciales.

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Características

  • Límite de cuantificación bajo con excelente reproducibilidad
  • Rango lineal elevado
  • Control interno fiable y preciso
  • Protocolos optimizados para una gran variedad de termocicladores en tiempo real
  • Kits completos, incluidos un control interno y un control positivo

Detalles del producto

Al trabajar con biofármacos, es fundamental evaluar el material terapéutico final para garantizar que no contenga sustancias contaminantes, como ADN residual de la célula huésped. Los Certal Residual DNA Detection Kits están diseñados para la cuantificación por real-time PCR sensible y rápida de ADN genómico residual de células huésped mediante sondas de hidrólisis de doble marcador (también denominadas TaqMan®). El Certal CHO Detection Kit contiene reactivos para la detección de ADN residual de células huésped de ovario de hámster chino (CHO) por real-time PCR doble más el Certal Internal Control. El kit también incluye el Certal Residual DNA Positive Control, que verifica la funcionalidad del ensayo PCR en ausencia de una señal de ADN de células huésped de ovario de hámster chino (CHO), y 2 formatos de colorante de referencia pasivo ROX en diferentes concentraciones, lo que permite su uso en casi cualquier instrumento en tiempo real.

Rendimiento

Los Certal Residual DNA Detection Kits permiten la detección sensible y fiable y la cuantificación de ADN genómico (ADNg) residual, lo que es fundamental para la producción de biofármacos seguros y fiables (consulte la figura “ Detección extremadamente sensible y fiable”). El Certal CHO Detection Kit detecta ADNg residual de células de ovario de hámster chino (CHO) con un límite de detección bajo y un rango lineal alto, lo que garantiza la detección fiable de incluso bajos niveles de ADNg (consulte la figura “ Detección de límite bajo”). Los Certal Residual DNA Detection Kits son compatibles con una gran variedad de termocicladores, para ofrecer datos sensibles y fiables (consulte las figuras “ Detección sensible y fiable en una amplia gama de termocicladores” y “ Detección sensible y fiable del ADN genómico de CHO en el Rotor-Gene Q”).

Para ofrecer un alto nivel de seguridad en los procesos, los Certal Residual DNA Detection Kits incluyen el QIAGEN Internal Control, que está diseñado específicamente para permitir la interpretación correcta de los resultados negativos y para no interferir en el ensayo diana. El QIAGEN Internal Control se detecta de manera fiable cuando se coamplifica con ADN genómico (consulte la figura “ Detección fiable del QIAGEN Internal Control”).

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Principio

Para garantizar que no haya en el material terapéutico final sustancias contaminantes provenientes de la línea celular del huésped utilizada para producir biofármacos, los Certal Residual DNA Detection Kits ofrecen un ensayo prediseñado para detectar específicamente ADN de células huésped de CHO. Cada Certal Residual DNA Assay consiste en un par de cebadores optimizados y una sonda de hidrólisis marcada como FAM para la detección fiable del ADN genómico residual de CHO. El ADN de fondo humano y el Certal Internal Control DNA no interferirán en el Certal Residual DNA Assay.

El Certal Internal Control Assay premezclado contiene un cebador directo e inverso y una sonda de hidrólisis con marcador MAX para la detección del Certal Internal Control DNA. Se ha optimizado específicamente para evitar la interferencia con los Certal Residual DNA Assays. El Certal Residual DNA Positive Control permite la interpretación correcta de los resultados negativos al comprobar la funcionalidad de la reacción de amplificación misma.

El Certal ResDNA PCR Buffer se ha optimizado para producir resultados sensibles y fiables de la real-time PCR cuantitativa doble. La mezcla maestra también contiene dUTP, lo que permite el pretratamiento con uracilo N-glicosilasa (UNG) antes de iniciar la PCR para garantizar que las reacciones de PCR posteriores no se vean afectadas por productos de PCR contaminantes.

Componentes del Certal Residual DNA Detection Kit
Componente Características Beneficios
Certal Residual DNA Assays y ADN de control
50x Certal Residual DNA Assay Juego de cebadores y sondas prediseñado, optimizado y validado (marcado como FAM) Detección fiable de ADN residual de célula huésped de CHO
Certal Residual DNA Positive Control ADN de control positivo que amplificará el Certal Residual DNA Assay Verificación de que el Certal Residual DNA Assay funciona correctamente en caso de que no se detecte ADN residual de célula huésped en la muestra
50x Certal Internal Control Assay Juego de cebadores y sondas prediseñado, optimizado y validado (marcado como MAX) para la detección de Certal Internal Control DNA Detección específica del Certal Internal Control DNA solamente. Optimizado para evitar la interferencia con los Certal Residual DNA Assays
Certal Internal Control DNA ADN de control interno que amplificará el Certal Internal Control Assay Excluye la presencia de inhibidores de PCR o puede utilizarse para controlar la purificación y la amplificación cuando se añade durante el paso de purificación
Certal ResDNA PCR Master Mix
HotStarTaq DNA Polymerase   Activación de 15 min a 95 °C Preparación de reacciones de qPCR a temperatura ambiente
Certal ResDNA PCR Buffer Una combinación equilibrada de iones de KCl y (NH4)2SO4 La hibridación de cebadores específicos garantiza la fiabilidad de los resultados de la PCR
Factor MP sintético Análisis múltiple fiable de hasta 4 genes en el mismo tubo
Mezcla dNTP Incluye dUTP, que sustituye parcialmente al dTTP y permite el tratamiento opcional con UNG Eliminación eficaz del arrastre de productos de PCR cuando la reacción se somete a pretratamiento con uracilo N-glicosilasa (UNG)
Componentes adicionales
50x ROX Dye Solution Tubo separado de colorante de referencia pasivo para la normalización de las señales fluorescentes en sistemas de real-time PCR Applied Biosystems 7500. Opcional: Se puede utilizar en instrumentos Stratagene de Agilent Cuantificación precisa en termocicladores que requieren colorante ROX. No interfiere en la PCR en cualquier termociclador en tiempo real
50x High-ROX Dye Solution Tubo separado de colorante de referencia pasiva para la normalización de las señales fluorescentes en sistemas de real-time PCR Applied Biosystems 7900 y StepOne.
Uracilo N-glicosilasa (UNG) Tubo separado de enzima recombinante pura y libre de nucleasas Eliminación eficaz del arrastre de productos de PCR
QuantiTect Nucleic Acid Dilution Buffer Formulación de tampón patentada para la dilución y el almacenamiento de patrones de ácido nucleico Estabiliza los patrones de ADN y ARN durante la preparación de la reacción y dilución y previene la pérdida de ácidos nucleicos en las superficies de plástico, como tubos o puntas de pipetas

Procedimiento

Los Certal Residual DNA Detection Kits ofrecen un procedimiento simple para la detección de ADN de célula huésped, el Certal Internal Control y el Certal Residual DNA Positive Control (consulte la figura  Procedimiento del Certal Residual DNA Detection Kit). Solo debe mezclar la mezcla maestra con el Certal Residual DNA Assay, el Certal Internal Control Assay y el Certal Internal Control DNA y, luego, añadir su ADN de muestra o Certal Residual DNA Positive Control. El manual de uso del kit contiene protocolos optimizados para el uso con una amplia gama de termocicladores. El ROX se suministra en 2 tubos de diferentes concentraciones, lo que permite el uso en cualquier instrumento en tiempo real (consulte la tabla “Elegir la concentración de ROX correcta”).

Elegir la concentración de ROX correcta
Instrumento Solución de colorante ROX
  No se necesita Solución de colorante ROX Solución de colorante ROX de alta concentración
Rotor-Gene Q X    
Rotor-Gene 6000 y Rotor-Gene 3000 X    
Applied Biosystems 7500, ABI ViiA7   X  
Applied Biosystems 7900HT, StepOne y StepOne Plus, ABI PRISM 7700, 7000 y 7300     X
Mx3000P, Mx3005P, Mx4000 X Opcional  
iCycler iQ System X    
LightCycler 480 X    
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Aplicaciones

Los Certal Residual DNA Detection Kits permiten la real-time PCR sensible utilizando sondas específicas de secuencia para la detección de ADN de célula huésped, incluido un control interno. Los kits pueden utilizarse en una gran variedad de termocicladores en tiempo real, incluidos los termocicladores de QIAGEN, Applied Biosystems, Bio-Rad, Roche y Agilent.

Datos y cifras de respaldo

Recursos

Quick-Start Protocols (1)
Safety Data Sheets (1)
Kit Handbooks (1)
For sensitive real-time PCR detection of residual host cell DNA and an internal control using sequence-specific probes
Certificates of Analysis (1)

FAQ

Can the Certal CHO Positive Control DNA be used to create a qPCR standard for relative quantification?
For quantification, it is recommended that a gDNA standard from your production cell be prepared using, for example, the QIAamp DNA Mini Kit. The positive control provided with Certal Residual DNA Detection Kits is not suitable for use as a qPCR standard for relative quantification.
FAQ ID -2979
How many freeze-thaw cycles can the Internal Control supplied with Certal Residual DNA Detection Kits tolerate?

The Internal Control supplied with Certal Residual DNA Detection Kits can be freeze-thawed up to 6 times without a decrease in performance. However, great care should be taken to avoid inadvertently introducing RNases or DNases into the Internal Control template solutions. In general, in order to avoid repeated freeze-thaw cycles, we recommend preparing aliquots of the Internal Control template.

Note:  The Internal Control supplied with Certal Residual DNA Detection Kits cannot be ordered separately

FAQ ID -2975
On which cyclers can Certal Residual Detection Kits be used?
Certal Residual Detection Kits can be used on virtually any real-time cycler. The master mix supplied with the Kits does not contain ROX. Instead, 2 different ROX concentrations are supplied in separate tubes. “High-ROX Dye Solution” is for use with all Applied Biosystems cyclers except the Applied Biosystems 7500 Real-Time PCR Systems and the ViiA7 System, and “ROX Dye Solution” is for use with the Applied Biosystems 7500 Real-Time PCR Systems, the ViiA7 System, and, optionally, instruments from Agilent. Recommendations are provided in the handbook (page 11).
FAQ ID -2973
What is the label of the probe that is used in the Internal Control Assay to detect the Internal Control supplied with Certal Residual DNA Detection Kits?
The probe is labeled with the MAX-NHS ester (MAX) reporter dye, which has a spectrum equivalent to HEX, JOE, or VIC dyes. IowaBlack is used as the quencher dye. IowaBlack is a non-fluorescent quencher (dark quencher).
FAQ ID -2976
If a cycler from Applied Biosystems is used in combination with the Certal Residual DNA Detection Kit, should dye calibration for MAX be performed?

No, calibration is required if the instrument is already calibrated for VIC (which is normally the case). Simply create a new detector, for example, “MAX/IowaBlack”, and assign VIC as the reporter dye and “none” as the quencher (Table 3, page 17 of the Certal Residual DNA Detection Kit handbook describes the procedure in the footnote). 

MAX spectrum is nearly identical to VIC and the requirement for calibration has been thoroughly tested. There is no risk of crosstalk from the VIC channel to the FAM channel. However, crosstalk may occur from the FAM channel to the VIC channel if the pathogen target is present in very high copy numbers. Although this may slightly change the signal for the Internal Control, if a positive signal is detected in the FAM channel, then the Internal Control signal is no longer required.

FAQ ID -2977
On what cyclers have Certal Residual DNA Detection Kits been validated?
Certal Residual DNA Detection Kits have been validated on the Rotor-Gene Q and the Applied Biosystems 7900HT Fast Real-Time System.
FAQ ID -2978
Is there a risk of crosstalk from the FAM channel to the VIC channel if the residual DNA target is present in very high copy numbers?
Usually the amount of gDNA in process samples is low, for example, in the ng range or even lower. Therefore, no crosstalk is expected.
FAQ ID -2980
What is the nature and target of the Internal Control supplied with Certal Residual DNA Detection Kits?

The Internal Control supplied with Certal Residual DNA Detection Kits is a non-linearized plasmid (naked nucleic acid).

The Internal Control supplied with Certal Residual DNA Detection Kits has an artificial sequence that is not present in biological sample material.

FAQ ID -2974