Geeignete Biomarker sind entscheidend für die Verbesserung von Krebs-Screening, -Diagnose und -Überwachung. Welcher Biomarker wird sich als der Beste herausstellen?
Die Entdeckung von RNA-Biomarkern und ihre Weiterentwicklung für den klinischen Einsatz ist herausfordernd. Diese Herausforderungen müssen wir meistern, denn letztlich geht es um die Verbesserung der Früherkennung, der Prognose und der Unterstützung für Menschen, die an Krebs erkrankt sind. Gemeinsam können wir Ihnen den Weg zur Entdeckung von Krebs-Biomarkern und Erzielung relevanter Ergebnisse ebnen.
Wir bieten ein umfassendes Portfolio an „Sample to Insight“-Workflows für Krebs-miRNA sowie Studien von Genexpression, Transkriptom oder Funktionalität im Zusammenhang mit Krebs. Hier geben wir Ihnen einen Einblick in die einzelnen Schritte der häufigsten Workflows und erleichtern Ihnen die Suche nach den Informationen und Produkten, die Sie benötigen. Von formalinfixierten, in paraffineingebetteten (FFPE) und Flüssigbiopsieproben bis hin zur RNA-Seq und Entdeckung neuer Krebs-Stoffwechselwege bieten wir Ihnen die geeigneten Lösungen zur Steigerung Ihrer Effizienz und Beschleunigung Ihrer RNA-Biomarkerforschung. Wir haben ein gemeinsames Ziel. Lassen Sie uns den Krebs besiegen. Gemeinsam.
Probenvorbereitung
RNA-Stabilisierung und -Isolierung
Wenn Sie RNA aus Flüssigbiopsie- oder FFPE‑Proben isolieren, wissen Sie, dass das Verfahren viele Herausforderungen mit sich bringt. Spezifische Lagerbedingungen, die nötige Vorbehandlung und die Fragilität von RNA erfordern, dass wir genau planen und geeignete Vorbereitungen treffen, um bestmögliche Ergebnisse zu erzielen. Wir haben einige nützliche Ressourcen zusammengestellt, um Ihnen den Einstieg in die Arbeit mit RNA-Biomarkern zu erleichtern oder Sie in die Details einzuführen, die bei der Probenvorbereitung von entscheidender Bedeutung sind.
Leitfäden und Poster
Qualitätskontrolle
Leitfäden und Poster
Next Generation Sequencing
RNA- und miRNA-Sequenzierung
Next Generation Sequencing (NGS) ist eine leistungsstarke Methode für den Nachweis und die Charakterisierung von RNA-Biomarkern. Die Etablierung in Ihrem Labor kann jedoch kompliziert und anspruchsvoll sein. Wenn Sie einen hohen Probendurchsatz haben, können wir Ihnen helfen. Wir arbeiten daran, NGS so einfach wie möglich zu machen: Unser Ziel ist es, dass NGS genauso einfach wie eine PCR werden soll. Damit wäre NGS für alle verfügbar und könnte auch kleinere Krebsforschungslabore dabei unterstützen, hervorragenden Ergebnissen einen Schritt näher zu kommen. Wir helfen Ihnen, mit NGS-Lösungen die Entdeckung von RNA-Biomarkern zu beschleunigen – ganz gleich, ob Sie Genexpression oder Fusionsgene analysieren, und unabhängig von der Probenanzahl.
RNA-Seq-Datenanalyse
Jetzt, da Sie im Rahmen Ihres Projekts zur Entdeckung von Biomarkern mittels NGS erfolgreich ein Genexpressionsprofil erfasst haben, stellt sich die Frage, wie Sie im nächsten Schritt am besten die Rohdaten analysieren können. Eine Möglichkeit ist, ein Online-Datenanalyse-Tool zu verwenden
Digitale PCR
miRNA-Profiling
MicroRNAs (miRNAs) sind maßgeblich an der Krebsprogression und -unterdrückung beteiligt, da sie tausende krebsassoziierte Gene regulieren. Zirkulierende zellfreie miRNAs haben vor Kurzem neue Möglichkeiten für einen nichtinvasiven Test zur frühzeitigen Krebserkennung eröffnet.
Allerdings mangelt es bei der miRNA-Quantifizierung in Serum oder Plasma noch immer an Konsistenz und Standardisierung. Versuchen Sie es mit digitaler PCR, wenn Sie analytische Schwierigkeiten bei der miRNA-Quantifizierung überwinden möchten. Die digitale PCR (dPCR) ermöglicht eine absolute Quantifizierung ohne Standardkurven und mit höherer Präzision als die qPCR. Dies ist besonders wichtig beim Nachweis von in geringer Menge vorliegenden miRNAs im Vergleich zur qPCR. Durch die genaue Messung der Mengen an zirkulierenden miRNAs stellt die dPCR ein wertvolles Werkzeug auf dem Weg zur Entwicklung von Biomarkern zum Nachweis von Krebs dar.
Genexpressionsanalyse
Änderungen der Genexpression sind ein äußerst wertvoller Indikator, der unser Verständnis vieler biologischer Funktionen deutlich erweitert hat. Mit der dPCR können Sie diesen Ansatz auf die nächste Stufe heben und bisherige Grenzen überschreiten. Welche Bedeutung haben zum Beispiel in niedriger Menge vorliegende Targets oder sehr geringe Expressionsunterschiede von 2-fach oder weniger? Mit dPCR können Sie es jetzt herausfinden.
Die dPCR‑Methode liefert präzisere und reproduzierbarere Daten als die qPCR, da sie eine Endpunktmessung und absolute Quantifizierung ohne Standardkurven ermöglicht. Dies hat deutliche Auswirkungen, besonders bei der Quantifizierung von sehr selten vorkommenden Targets, die entweder aufgrund eines hohen Gehalts an Inhibitoren und Kontaminanten in der Probe verdünnt wurden oder sehr geringe Expressionslevel aufweisen.
Datenanalyse
QIAGEN Digital Insights bietet leistungsstarke Bioinformatik-Tools, die Ihnen helfen, die in Ihren Genexpressionsdaten verborgene biologische Bedeutung zu verstehen. Mit QIAGEN OmicSoft können Sie Genexpressionsmuster vergleichen und visuell Gene finden, die hoch- oder herunterreguliert sind, um potenzielle Biomarker zu identifizieren. Verwenden Sie QIAGEN OmicSoft , den web-basierten Land Explorer, für den Zugriff auf Hunderttausende kuratierter Datensätze, um den Expressions- oder Mutationsstatus eines Targets in Hunderten von Krankheitskategorien zu untersuchen.
Die QIAGEN Ingenuity Pathway Analysis (IPA) hilft Ihnen, Ursache und Wirkung von Genexpressionsänderungen zu verstehen und potenzielle Targets für die weitere Erforschung zu identifizieren. Prognostizieren Sie, welche Upstream-Regulatoren verantwortlich sind und ob sie aktiviert oder inhibiert werden. Visualisieren Sie nachgelagerte Effekte, um herauszufinden, welche Gene wahrscheinlich eine Verstärkung oder Abschwächung nachgelagerter biologischer Prozesse bewirken.
