MagAttract HMW DNA Kit

Für die Isolierung von genomischer DNA mit hohem Molekulargewicht

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MagAttract HMW DNA Kit (48)

Cat. No. / ID:   67563

Für 48 DNA-Präparationen: MagAttract Suspension G, Buffer ATL, Buffer AL, Buffer MB, Buffer MW1, Buffer PE, Proteinase K, RNase A, Buffer AE, Nuklease-freies Wasser
2.945,00 NOK
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MagAttract HMW DNA Kit ist für molekularbiologische Anwendungen vorgesehen. Dieses Produkt ist nicht für die Diagnose, Prävention oder Behandlung einer Krankheit bestimmt.

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Eigenschaften

  • Reproduzierbare Isolierung von DNA mit hohem Molekulargewicht
  • Hohe Ausbeuten und Reinheit aus einer Vielzahl an Probenmaterialien
  • Schnelle und praktische Protokolle
  • Vollständige Entfernung von Inhibitoren

Angaben zum Produkt

Das MagAttract HMW DNA Kit ermöglicht die Aufreinigung von DNA mit hohem Molekulargewicht (100–200 kb) mit einem einfachen Protokoll auf Basis von Magnetpartikeln. Bei dem Aufreinigungsverfahren werden Verunreinigungen und Inhibitoren schonend entfernt, während gleichzeitig eine sehr hohe Ausbeute und Reinheit erzielt wird. Die extrahierte genomische DNA eignet sich für zahlreiche Applikationen wie z. B. Archivierung und Next Generation Sequencing (NGS).

Leistung

Das MagAttract HMW DNA Kit gewährleistet die reproduzierbare Isolierung von genomischer DNA > 150 kb. Die mit dem MagAttract HMW DNA Kit isolierte DNA wurde mit Hilfe von Pulsed-Field-Gelelektrophorese mit der mit anderen Magnetpartikel-basierten Verfahren isolierten DNA verglichen. Das MagAttract HMW DNA Kit zeigte überlegene Ergebnisse bei der Isolierung von DNA mit hohem Molekulargewicht (siehe Abbildung  Erfolgreiche Isolierung von DNA mit hohem Molekulargewicht).


Konsistent hohe Ausbeute und Reinheit
Das MagAttract HMW DNA Kit nutzt ein bequemes, unkompliziertes Verfahren zur Gewinnung hoher Ausbeuten an reiner DNA mit hohem Molekulargewicht. Schonende Lysebedingungen minimieren die DNA-Fragmentierung, während Verunreinigungen und PCR-Inhibitoren effizient entfernt werden, sodass reine DNA mit hohem Molekulargewicht erhalten wird. Die optimierte Chemie und das optimierte Verfahren des MagAttract HMW DNA Kit erhöhen die DNA-Ausbeute und -Reinheit verglichen mit klassischen Spin-Säulen- oder Magnetpartikel-basierten Methoden anderer Anbieter deutlich (siehe Abbildung  Höchste Ausbeute und Reinheit und  Verbesserte Ausbeute aus verschiedenen Probentypen).


Effektive Entfernung von PCR-Inhibitoren
Hochsensitive Applikationen wie Real-time PCR oder NGS erfordern die Entfernung von Antikoagulanzien, Enzymen, divalenten Kationen und anderen ähnlichen Inhibitoren. Es wurde eine Real-time PCR-Amplifikation von DNA durchgeführt, die aus EDTA-, Heparin- und Citrat-stabilisierten Blutproben mit dem MagAttract HMW DNA Kit isoliert wurde. In keiner der Proben wurde eine Inhibition beobachtet; alle zeigten eine hochlineare Korrelation der CT-Werte mit dem eingesetzten Probenvolumen (siehe Abbildung  Keine Inhibition in aus antikoaguliertem Blut gewonnenen Proben).


Genomische DNA gebrauchsfertig für das Next Generation Sequencing
Da Technologien zur massiven parallelen Sequenzierung (MPS) mit kurzen Read-Längen arbeiten, kann eine Sequenzierung mit intakter genomischer DNA > 10 kb durchgeführt werden. De-novo-Genom-Assemblierung sowie die Entdeckung angeborener oder erworbener Strukturvarianten stellen jedoch mit Standardprodukten zur DNA-Aufreinigung noch immer eine Herausforderung dar. Mate-Pair-Bibliotheken mit größeren Inserts können einen signifikanten Einfluss auf den Sequenzierungserfolg haben, besonders bei komplexen Genomen mit vielen Repeats. Die mit dem MagAttract HMW DNA Kit gewonnene genomische DNA mit hohem Molekulargewicht kann direkt für NGS-Experimente eingesetzt werden.

Repräsentative Ergebnisse eines Next Generation Sequencing-Experiments (Mate-Pair)
Parameter Spezifikation
Gesamtzahl (langer) gemappter Reads 6521106
Fehlerrate 0,36 %
Indel-Rate 0,01 %
Chimären 0,14 %
Duplikation in Prozent 1,15 %
Abbildungen ansehen

Prinzip

Die Isolierung genomischer DNA ist ein zentraler Schritt jeder DNA-Analysemethode. Die Schlüsselparameter sind im Allgemeinen Ausbeute, Reinheit und Integrität der isolierten DNA. Während für Standardmethoden wie PCR-, Sequenzierungs- oder Hybridisierungstechniken ein Molekulargewicht im Bereich von 10–30 kb ausreichend sein kann, erfordern einige sensitive Methoden wie die Generierung von BAC- oder Fosmid-Bibliotheken oder die Archivierung von DNA eine höhere Integrität der genomischen DNA.
Das MagAttract HMW DNA Kit ist spezifisch darauf ausgelegt, DNA mit hohem Molekulargewicht aus einem breiten Spektrum an Proben wie Human- oder Tiergewebe, Blut und Bakterien zu gewinnen. Das Kit nutzt eine effiziente Kombination aus leistungsstarken Magnetpartikeln und einer innovativen silikabasierten Chemie. Die leistungsstarken Magnetpartikel stellen sicher, dass die isolierte DNA in hoher Ausbeute und hoher Reinheit vorliegt.

Verfahren

Das praktische MagAttract Protokoll ermöglicht reproduzierbare Ergebnisse in nur 70 Minuten.


Schnelles und optimiertes Protokoll
Optimierte Puffer und Enzyme lysieren Proben schonend, sodass die Fragmentierung der genomischen DNA minimiert wird. Das Verfahren besteht aus 4 einfachen Schritten: Lyse, Binden, Waschen und Eluieren. Nach der Probenlyse bindet die DNA an die Oberfläche der Magnetpartikel. Während der Waschschritte werden Verunreinigungen und PCR-Inhibitoren effektiv entfernt, und reine DNA mit hohem Molekulargewicht wird in Buffer AE eluiert (siehe Abbildung  MagAttract HMW DNA Kit Verfahren).

Abbildungen ansehen

Anwendungen

Die mit dem MagAttract HMW DNA Kit gewonnene genomische DNA mit hohem Molekulargewicht kann direkt für NGS-Experimente eingesetzt werden. Sie kann zur Generierung von Bibliotheken mit sowohl kleinen als auch großen Inserts verwendet werden und eignet sich damit für alle Sequenzierungsapplikationen.

Ergänzende Daten und Abbildungen

Specifications

FeaturesSpecifications
Sample amount200 μl Blut; bis zu 25 mg Gewebe; 2 x 10e9 Bakterienzellen
Process time~70 Minuten für 12 Proben
Elution volume100–200 µl

Ressourcen

Brochures & Guides (1)
Introducing QIAseq
PDF (450KB)
Accelerate your NGS performance through Sample to Insight solutions
Kit Handbooks (1)
For isolation of high-molecular-weight DNA from blood, tissue, and bacteria for next-generation sequencing applications
Quick-Start Protocols (1)
Safety Data Sheets (1)
Certificates of Analysis (1)

FAQ

Can I scale up reagents if I want to use more sample with the MagAttract HMW DNA Kit (cat. no. 67563)?

Technically yes, however you would need to use different containers like 15 ml tubes and suitable magnets. You cannot use 2 ml tubes as the protocol states as higher amounts of beads also require more buffer for the protocol to work.

FAQ ID - 3448