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Cat. No. / ID: 210220
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Das Q-Solution Kit wurde entwickelt, um die Bedingungen in anspruchsvollen qPCR- und dPCR-Reaktionen zu optimieren. Die Kitschachtel enthält 5x Q-Solution und 25 mM MgCl2, die einzeln oder gemeinsam verwendet werden können. Gegebenenfalls können Sie den Konzentrationsbereich beider Lösungen titrieren.
Minimierung der Auswirkungen von PCR-Inhibitoren
Q-Solution ist ein innovatives und vielseitiges PCR-Additiv, das mit jedem der QIAcuity Mastermixe verwendet werden kann. Die besonderen Eigenschaften von Q-Solution (Abbildung 1) verringern die Verschleppung von Inhibitoren wie Resten von Alkohol, Heparin, Huminsäuren oder anderen kritischen Substanzen, die die PCR-Reaktion beeinträchtigen können.
Primer-Bindungsaffinität erhöhen
Wenn Sie vermuten, dass eine schwache Primer- oder Sondenbindung die PCR-Leistung beeinträchtigt, versuchen Sie, Ihrer PCR-Reaktion MgCl2 zuzusetzen.
Kompatibel mit unterschiedlichen dPCR- und qPCR-Mastermixen
In jeder dPCR-, Endpunkt-PCR- oder qPCR-Reaktion können schwierige PCR-Bedingungen herrschen, die sich auf Durchsatz, Reproduzierbarkeit und Sensitivität auswirken. Unabhängig von Ihrer Anwendung zeigen die Daten, dass das Q-Solution Kit dPCR-, Endpunkt-PCR- und qPCR-Reaktionen verbessern kann, in manchen Fällen bereits nach einer einfachen Titration beider Komponenten.
Durch die Senkung der DNA-Schmelztemperatur kann Q-Solution die Schwierigkeiten bewältigen, die durch DNA mit hohem GC-Gehalt oder mit komplexen Sekundärstrukturen verursacht werden, wie sie in Genomen von Adeno-assoziierten Viren (AAV) vorkommen. Das Kit verbessert auch die PCR-Effizienz in Gegenwart von Inhibitoren. Die Zugabe von MgCl2 ist fakultativ und verhindert PCR-Fehler, die durch Chelatbildner wie EDTA verursacht werden. Als wesentlicher Cofaktor der DNA-Polymerase kann MgCl2 doppelsträngige DNA-Strukturen stabilisieren, auch solche, die zwischen Primern und Template gebildet werden. Das Prinzip der dPCR-Reaktion in den Nanoplatten finden Sie hier beschrieben.
Das Protokoll ist einfach und kann in jedem Labor mit dem QIAcuity Digital PCR System durchgeführt werden. Gemäß den Vorgaben im Benutzerhandbuch können Sie die Reaktionsmischung wie üblich vorbereiten und Q-Solution und MgCl2 wie im Schnellstartprotokoll beschrieben zusetzen. Die Mischung wird in die Nanoplatte pipettiert. Wir empfehlen, Q-Solution und MgCl2 vor der ersten Verwendung zu titrieren, um die optimale Konzentration für den jeweiligen Reaktionsaufbau zu ermitteln.
Das Q-Solution Kit eignet sich hervorragend für verschiedene dPCR-Reaktionen auf QIAcuity-Geräten sowie für Endpunkt-PCR und qPCR-Reaktionen. Weitere Anwendungsbeispiele finden Sie in unserem Anwendungshinweis im Abschnitt “Ressourcen”.
Wie aus den U-Formen in den 1D-Streudiagrammen und der Quantifizierung im Vergleich zu den Kontrollreaktionen ohne Ethanol hervorgeht, wurden Reaktionen mit dem QIAacuity Probe PCR Kit, die den Wildtyp-BRAF-Locus mit dem dPCR-Mutationsassay BRAF 476 Human quantifizieren, gehemmt, wenn 3,5 % oder 5 % Ethanol in der Reaktion vorlag.