miRNA NGS Sequenzierungsservice

Analyse der differenziellen Genexpression und neue Entdeckungen mit NGS bringen Sie Ihren Zielen näher

Libraries werden mit dem QIAseq miRNA Library Kit unter Einsatz optimierter Reaktionschemie erstellt, um eine robuste, miRNA-spezifische Isolierung zu gewährleisten und proprietäre Methoden minimieren Reaktionsbias und eliminieren Adapter-Dimere. Unique Molecular Indices (UMIs) markieren jede miRNA in einer frühen Phase und eliminieren so PCR- und Sequenzierungsbias.

Eine Datenanalyse wird sowohl für die primäre miRNA-Kartierung und UMI-Analyse als auch die sekundäre Analyse der differenziellen Expression bereitgestellt.

• Eine Bead-basierte Methode zur Entfernung von Adapter-Dimeren und unerwünschten RNA-Spezies liefert höchste Zuverlässigkeit und die effizientesten Daten
• Integrierte UMIs ermöglichen die Quantifizierung individueller miRNA-Moleküle
• Primäre Read-Kartierung und differenzielle Expressionsanalyse über eine proprietäre Pipeline

Mit unserer einzigartigen NGS-Datenanalysepipeline wird eine umfassende Datenanalyse einschließlich statistischer Analyse bereitgestellt:

• Umfassende Qualitätskontrolle der Rohdaten
• Sequenzabgleich mit dem entsprechenden Referenzgenom
• Qualitätskontrolle der gemappten Daten
• Quantifizierung bekannter Transkripte (unterstützt werden sowohl ENSEMBL- als auch UCSC-Datenbanken)
• Normalisierung
• Analyse der differenziellen Genexpression zur Identifizierung bekannter und neuartiger Gene und Transkripte, bei denen zwischen Ihren Probengruppen eine differenzielle Expression vorliegt
• Statistische Analyse, sofern ausreichend Proben je Gruppe vorhanden sind
• Nicht überwachte Analyse, einschließlich Hauptkomponentenanalyse(PCA)-Plot und Heatmap
• Überwachte Analyse: Für jeden spezifischen Gruppenvergleich generieren wir einen Vulkan-Plot, der die zwischen den Gruppen differenziell exprimierten Gene aufzeigt; zudem listen wir die differenziell exprimierten Gene auf und identifizieren statistisch signifikante Signale