QIAxcel DNA Kits

Zur automatisierten Analyse von DNA-Fragmenten mit QIAxcel Geräten

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✓ Automatische Verarbeitung von Online-Bestellungen 24/7

✓ Sachkundiger und professioneller technischer und Produkt-Support

✓ Schnelle und zuverlässige (Nach-)Bestellung

QIAxcel DNA High Resolution Kit (1200)

Cat. No. / ID:   929002

QIAxcel DNA High Resolution Gel Cartridge, Puffer, Mineralöl, QX Intensity Calibration Marker, 12-Röhrchen-Streifen
Cartridge type
High Resolution
Screening
Fast Analysis
High Sensitivity
QIAxcel DNA Kits sind für molekularbiologische Anwendungen vorgesehen. Diese Produkte sind nicht zur Diagnose, Prävention oder Behandlung einer Erkrankung vorgesehen.

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Eigenschaften

  • Sicherheit und Komfort durch gebrauchsfertige Gelkartuschen
  • Optimierter Workflow minimiert die Analysedauer
  • Robuste Ergebnisse für Nukleinsäurekonzentrationen schon ab 5 pg/µl
  • Präzise Analyse mit bis zu 3–5 bp Auflösung
  • Standardisierte Verarbeitung mit digitaler Datenerfassung

Angaben zum Produkt

QIAxcel Geräte ermöglichen in Verbindung mit QIAxcel DNA Kits eine vollautomatisierte Größenauftrennung und Quantifizierung von DNA-Fragmenten in bis zu 96 Proben je Lauf. Die QIAxcel Technologie basiert auf Kapillarelektrophorese mit Gelkartuschen und bietet unerreichte Auflösung, Geschwindigkeit und Durchsatz. Die QIAxcel Gelkartuschen sind wiederverwendbar und ermöglichen die Durchführung von bis zu 250 Läufe zu je 12 Proben. Für die meisten Applikationen geeignete Methoden sind vorinstalliert verfügbar. QIAGEN kann auch kundenspezifische Methoden für Anwenderinnen und Anwender erstellen.

Das QIAxcel DNA High Sensitivity Kit kann nur zusammen mit dem QIAxcel Connect verwendet werden. Alle anderen QIAxcel DNA Kits können entweder mit dem QIAxcel Connect oder QIAxcel Advanced Geräten verwendet werden. Die QIAxcel DNA Accessories sind mit allen QIAxcel DNA Kits kompatibel.

Leistung

Einfache hochauflösende Analyse

Genotypisierung von Organismen, PCR-basiertes cDNA-Bibliotheksscreening und viele andere Applikationen in der biomedizinischen Forschung und Molekularbiologie erfordern die Differenzierung von PCR-Fragmenten, die sich in der Größe nur um wenige Basenpaare unterscheiden. Das QIAxcel High Resolution Kit erlaubt in Kombination mit QIAxcel Geräten die Analyse von DNA-Fragmenten mit einer Größe zwischen 15 bp und 5 kb. Fragmente, die kleiner als 500 bp sind, können mit einer Auflösung von 3–5 bp aufgetrennt werden. Dies ermöglicht eine zuverlässigere Dateninterpretation als mit der herkömmlichen hochauflösenden Agarose-Gelelektrophorese (siehe  Sensitiver Nachweis eines mutierten krebsassoziierten Gens). Bei einer Nachweissensitivität von 0,1 ng/µl DNA in unverdünnten Amplifikationsreaktionen bieten QIAxcel Geräte robustere Ergebnisse bei kleineren Mengen an eingesetztem Probenmaterial.

Das QIAxcel DNA Screening Kit eignet sich optimal für die routinemäßige Evaluierung von Fragmenten für den Verdau mit Restriktionsendonukleasen, qualitative Singleplex- oder Multiplex-PCR und andere DNA-Applikationen (siehe  Hochauflösende Analyse von Multiplex-PCR-Proben). Die Verwendung von Kartuschen für das DNA-Screening optimiert den Labor-Workflow durch Minimierung der Analysezeit für Fragmente von 15 bp bis 5 kb Größe – 96 Proben werden in etwa 1 Stunde bearbeitet. Für Fragmente unter 1 kb kann eine Auflösung von 20–50 bp erreicht werden. Der Probenverbrauch liegt bei weniger als 0,1 µl, sodass nahezu Ihre gesamte wertvolle Probe für nachgelagerte Applikationen erhalten bleibt.

Das QIAxcel DNA Fast Analysis Kit eignet sich optimal für die routinemäßige Beurteilung von DNA-Fragmenten in qualitativen Single- oder Multiplex-PCR-Applikationen. Die Verwendung von Gelkartuschen für das DNA-Screening optimiert den Labor-Workflow durch Minimierung der Analysezeit für Fragmente von 15 bp bis 3 kb Größe – 12 Proben werden in nur 3 Minuten und 96 Proben in etwa 25 Minuten bearbeitet (siehe  Screenshot mit Daten aus PCR-Fragmentanalyse). Mit der QIAxcel DNA Fast Analysis Gelkartusche kann eine Auflösung von bis zu 50 bp erzielt werden, wobei der Probenverbrauch bei weniger als 0,1 μl liegt.

Mit dem QIAxcel DNA High Sensitivity Kit können Sie DNA in Konzentrationen schon ab 5 pg/μl analysieren. Die Analysezeit für Fragmente von 15 bp–3 kb Größe beträgt für 12 Proben etwa 9 Minuten. Mit der QIAxcel DNA High Sensitivity Gelkartusche kann eine Auflösung von 20–50 bp erzielt werden.

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Prinzip

QIAxcel Geräte nutzen Kapillargelelektrophorese, um eine schnelle, größenbasierte Auftrennung von Nukleinsäuren zu ermöglichen (siehe  Prozess der Probenauftrennung). Anders als bei der traditionellen Agarose-Gelelektrophorese wird die Auftrennung in einer Kapillare einer gebrauchsfertigen Gelkartusche durchgeführt. Die Proben werden automatisch in eine einzelne Kapillare geladen und dann eine Spannung angelegt. Die negativ geladenen Nukleinsäuremoleküle wandern durch die Kapillare zum positiv geladenen Ende. Wie bei der Agarose-Gelelektrophorese wandern Moleküle mit niedrigem Molekulargewicht schneller als Moleküle mit hohem Molekulargewicht. Während die Moleküle durch die Kapillare wandern, passieren sie einen Detektor, der das Fluoreszenzsignal erfasst und misst. Ein Photomultiplier konvertiert das Fluoreszenzsignal in elektronische Daten, die dann zur weiteren Verarbeitung mit der QIAxcel ScreenGel Software auf den Computer übertragen werden. Nach der Verarbeitung werden die Daten als Elektropherogramm oder Gel-Bild dargestellt.

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Verfahren

QIAxcel DNA Kits erleichtern die Auftrennung und Analyse von DNA-Fragmenten und sorgen für eine höhere Anwendersicherheit. Es sind nur wenige einfache Schritte erforderlich: Laden der Gelkartusche, Füllen und Laden des Pufferreservoirs, Laden der Proben in 96-Well-Platten oder PCR-Röhrchen oder -Streifen, Auswählen des gewünschten Prozessprofils und Starten. Aufwändige Gelvorbereitung und umfassende Anwenderschulung werden überflüssig, wodurch der Workflow optimiert und die Integration des Systems in die tägliche Laborroutine erleichtert wird. Schon Minuten nach Beginn des Laufs werden die ersten Ergebnisse in Echtzeit auf dem Computerbildschirm angezeigt (siehe  Reduzierte Laufzeiten).

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Anwendungen

Vorprogrammierte Methoden erlauben in Kombination mit den entsprechenden Gelkartuschen die Auftrennung und Analyse einer Vielzahl von Nukleinsäuren, einschließlich einzelner oder mehrerer PCR-Fragmente, mit Restriktionsendonukleasen verdauter DNA und synthetisierter Oligonukleotide.

  QIAxcel DNA High Resolution Kit QIAxcel DNA High Sensitivity Kit§ QIAxcel DNA Screening Kit QIAxcel DNA Fast Analysis Kit
Größenbereich 15 bp–20 kb; Anzeige von bis zu 50 kb 15 bp–3 kb 15 bp–5 kb 15 bp–3 kb
Auflösung* 3–5 bp 20–50 bp 20–50 bp 50 bp
Nachweisgrenze 0,1 ng/μl 5 pg/μl 0,1 ng/μl 0,1 ng/μl
Proben je Kartusche 1200 Proben 1200 Proben 2400 Proben 3000 Proben
Laufzeit 9–25 min ~9 min ~7 min ~3 min
Anwendungsbereich
  • Hochauflösende Genotypisierung
  • VNTR, STRs usw.
  • gDNA-Integritätsprüfung
  • NGS-Bibliotheksprüfung
  • Qualitätskontrolle von Flüssigbiopsieextrakten
  • NGS-Bibliotheksprüfung
  • Schnelles PCR-Screening (Single- und Multiplex)
  • Restriktionsverdau, Plasmid
  • gDNA-Integritätsprüfung
  • NGS-Bibliotheksprüfung
  • Schnelle Analyse einzelner Amplifikate, z. B. HLA-Typisierung

Ergänzende Daten und Abbildungen

Ressourcen

Brochures & Guides (5)
A protocol for evaluation of samples for next-generation sequencing on the QIAGEN GeneReader platform using the QIAxcel Advanced Instrument and ScreenGel software version 1.5 of higher

For analysis and typing of PCR products from different HLA loci using the QIAxcel Advanced and the Helmberg-SCORE software

Kit Handbooks (4)
For automated electrophoretic analysis of DNA using the QIAxcel Connect instrument

June 2022
For automated analysis of DNA fragments using the QIAxcel and QIAxcel Advanced instruments
Application Notes (22)
The QIAxcel System was successfully used to detect DNA derived from genetically modified organisms (GMOs) at a level suitable for GMO testing according to EU standards.
Safety Data Sheets (1)
Operating Software (2)
This release includes the first version of QIAxcel ScreenGel NGS Profiles. These profiles are intended to be used to run and analyze reactions of GeneRead QIAact AIT and BRCA 1/2 panels using the QIAxcel instrument and QIAxcel ScreenGel 1.5 Software. These profiles are composed of an Process Profile, Analysis Profile, Distribution Profile, and Report/Export Profile.
Technical Information and Important Notes (1)
Quick-Start Protocols (1)
For electrophoretic analysis of DNA samples using the QIAxcel Connect system

June 2022
Instrument User Manuals (2)
For use with QIAxcel ScreenGel Software v2.1
For use with QIAxcel Advanced instruments and QIAxcel ScreenGel Software version 1.6
Certificates of Analysis (1)

FAQ

Can customers use their own DNA size marker with the QIAxcel System and if yes, what concentration should be used?

The concentration of the DNA marker, pUC18/HaeIII, provided in the QIAxcel DNA Kits is 5ug/ml in 1XTE buffer solution. Customers can run their own DNA size marker sample with different concentration levels using the provided Methods (i.e. M500, H500, L500 and so on).

The recommended method for all basic applications with the QIAxcel System is the M500 method. The BioCalculator software also allows customers to choose their own Sample Injection Time in the Sequence table. The M500 method provides 5KV for 20 seconds for the electro-kinetic injection of lower concentrated DNA samples. If the Injection Time is doubled or tripled (40 or 60 sec), you can expect double or triple intensities (also peak heights).

FAQ ID -1841
What causes the calibration to fail?

Clogged capillaries and/or re-using the calibration marker are the most common causes of failed calibration. Perform “Removing gel from blocked capillaries”, as outlined in Appendix D in the QIAxcel DNA handbook. Use a new set of calibration marker for each new calibration procedure.

FAQ -9001
How do I perform the detector test?

When using the BioCalculator software, select Detector test under File in the Instrument control panel window. Perform the Detector test with and without a cartridge latched inside the QIAxcel. Feedback is not shown on the screen when you select the Detect test. Instead, the file named detector.asc is saved at C:\Program Files\QIAGEN\QIAxcel BioCalculator. Change the file name before performing another detector test.

Note: Older versions of BioCalculator software save the detector.asc at C:\Program Files\QIAxcel BioCalculator.

When using the ScreenGel software, log in to the ScreenGel with an account with basic or advanced privilege.  Select System Check under the Service environment. Select Detector Test and click Start. The file is saved at C:\Documents and Settings\All Users\Application Data\QIAGEN\QIAxcel\ScreenGel\Data\Troubleshooting\Troubleshooting_xxxxxxxx (current date in the format of YYYYMMDD) for a computer with Windows XP operating system or C:\ProgramData\QIAGEN\QIAxcel\ScreenGel\Data\Troubleshooting for a computer with Windows 7 operating system. Alternatively, you can perform a screen capture for the Detector test result.

Please send the Detector test results to QIAGEN Technical Services for further assistance.

FAQ -9006