FlexiGene DNA Kit

Für die skalierbare Isolierung von genomischer DNA aus Vollblut, Buffy Coat und Kulturzellen in einem einzelnen Röhrchen

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FlexiGene DNA Kit (250)

Cat. No. / ID:   51206

Für die Isolierung von genomischer DNA aus Vollblut, Buffy Coat und Kulturzellen in einem einzelnen Röhrchen mit einem schnellen Präparations-Kit
FlexiGene DNA Kit ist für molekularbiologische Anwendungen vorgesehen. Dieses Produkt ist nicht für die Diagnose, Prävention oder Behandlung einer Krankheit bestimmt.

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Eigenschaften

  • Einfache Handhabung, kein Risiko einer Probenverwechslung
  • Skalierbare Aufreinigung aus 0,1–20 ml Vollblut
  • Direkte Aufreinigung aus Vollblut, Buffy Coat und Kulturzellen
  • Schnelles Verfahren
  • Keine organische Extraktion

Angaben zum Produkt

Das FlexiGene System nutzt eine einfache Zentrifugation, um hochreine DNA aus Vollblut, Buffy Coat und Kulturzellen zu isolieren. Das FlexiGene DNA Kit enthält Puffer und QIAGEN Protease für eine direkte, einfache Aufreinigung in nur einem Röhrchen. Für automatisierte Lösungen mit FlexiGene Reagenzien wenden Sie sich an Autogen, Inc.

Leistung

Die mit dem FlexiGene System aufgereinigte DNA hat eine Größe von bis zu 150 kb (siehe Abbildung „ Hochqualitative genomische DNA“). Sie liefert gute Ergebnisse in Amplifikations- und Southern-Blotting-Experimenten und eignet sich auch für die Archivierung (siehe Abbildung „ Effiziente nachgelagerte PCR-Analyse“).

DNA wird mittels Zentrifugation in einem einzelnen Röhrchen aus 0,1–20 ml (Blut), 0,1–2 ml (Buffy Coat) oder 1–2 x 106 Zellen (Kulturzellen) aufgereinigt. In 1 Stunde können zwölf Proben bearbeitet werden. Abhängig von der Probengröße beträgt das Rehydratisierungsvolumen 0,2–1 ml.

DNA-Ausbeute bei Aufreinigung aus verschiedenen Probentypen mit dem FlexiGene Verfahren
ProbeVolumenDNA-Ausbeute (µg)
Blut*0,3 ml11–14
Blut*2,0 ml75–90
Blut*10,0 ml380–460
Buffy Coat0,5 ml110–130
HeLa-Zellen106 Zellen25–35
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Prinzip

Das FlexiGene DNA System ermöglicht die Isolierung von genomischer DNA aus variablen Mengen an Vollblut, Buffy Coat und Kulturzellen. Das simple Aufreinigungsverfahren wird in einem einzigen Röhrchen durchgeführt, was Kosten senkt und die Handhabung vereinfachtt. Die aufgereinigte DNA liefert gute Ergebnisse in sensitiven nachgelagerten Applikationen.

Verfahren

Der erste Schritt ist die Zugabe von Lysepuffer zu den Proben (siehe Flussdiagramm „ FlexiGene DNA Verfahren“). Zellkerne und Mitochondrien werden durch Zentrifugation pelletiert und in Denaturierungspuffer mit QIAGEN Protease resuspendiert. Nach dem Proteinverdau wird die DNA durch Zugabe von Isopropanol ausgefällt, durch Zentrifugation abgetrennt, in 70 % Ethanol gewaschen und getrocknet. Die DNA wird in Hydratisierungspuffer resuspendiert und kann direkt in nachgelagerten Assays eingesetzt oder bei –20 °C gelagert werden. Aus Vollblut, Buffy Coat und Kulturzellen werden hohe Ausbeuten an DNA gewonnen (siehe Tabelle „DNA-Ausbeute bei Aufreinigung aus verschiedenen Probentypen mit dem FlexiGene Verfahren“).
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Anwendungen

Die mit dem FlexiGene DNA Kit aufgereinigte DNA liefert gute Ergebnisse in nachgelagerten Applikationen wie

  • PCR
  • Southern Blotting
  • Archivierung

Ergänzende Daten und Abbildungen

Specifications

FeaturesSpecifications
ApplicationsPCR-Techniken, Restriktionsverdau, Southern Blotting, Sequenzierung
Sample amount100 µl–20 ml
FormatSkalierbar
Time per run or per prep25–45 Minuten (+ DNA-Rehydratisierung)
Main sample typeVollblut, Buffy Coat, Kulturzellen
TechnologyEinzelröhrchen-Ausfällmethode
ProcessingManuell
Yield35 µg/ml Vollblut
Purification of total RNA, miRNA, poly A+ mRNA, DNA or proteinGenomische DNA
Elution volume200 µl–1000 µl

Ressourcen

Kit Handbooks (2)
For purification of DNA from human whole blood, buffy coat, cultured cells
Additional Resources (2)
Supplementary Protocols (1)
This protocol is designed for purification of DNA from up to 10 ml clotted blood using the FlexiGene DNA Kit.
Safety Data Sheets (1)
Certificates of Analysis (1)

Publications

The (TAAAA)n microsatellite polymorphism in the SHBG gene influences serum SHBG levels in women with polycystic ovary syndrome.
Ferk P; Teran N; Gersak K;
Hum Reprod; 2006; 22 (4):1031-6 2006 Dec 22 PMID:17189294
A functional SNP of interferon-gamma gene is important for interferon-alpha-induced and spontaneous recovery from hepatitis C virus infection.
Huang Y; Yang H; Borg BB; Su X; Rhodes SL; Yang K; Tong X; Tang G; Howell CD; Rosen HR; Thio CL; Thomas DL; Alter HJ; Sapp RK; Liang TJ;
Proc Natl Acad Sci U S A; 2007; 104 (3):985-90 2007 Jan 10 PMID:17215375
Lipopolysaccharide-activated CD4+CD25+ T regulatory cells inhibit neutrophil function and promote their apoptosis and death.
Lewkowicz P; Lewkowicz N; Sasiak A; Tchórzewski H;
J Immunol; 2006; 177 (10):7155-63 2006 Nov 15 PMID:17082633
Predictors of vitamin B6 and folate concentrations in older persons: the InCHIANTI study.
Gori AM; Sofi F; Corsi AM; Gazzini A; Sestini I; Lauretani F; Bandinelli S; Gensini GF; Ferrucci L; Abbate R;
Clin Chem; 2006; 52 (7):1318-24 2006 May 11 PMID:16690736
Past adult lead exposure is linked to neurodegeneration measured by brain MRI.
Stewart WF; Schwartz BS; Davatzikos C; Shen D; Liu D; Wu X; Todd AC; Shi W; Bassett S; Youssem D;
Neurology; 2006; 66 (10):1476-84 2006 May 23 PMID:16717205

FAQ

Do you have a protocol for purification of DNA from clotted blood using the FlexiGene DNA Kit?

Yes, please follow the User-Developed Protocol 'Purification of DNA from clotted blood using the FlexiGene DNA Kit' (FG01).

 

FAQ ID -973
Do you have stability data for genomic DNA isolated with the Flexigene DNA Kit?

Yes. We have shown that DNA purified with the Flexigene DNA Kit is stable for at least 7 years when being stored at either 2-8°C or -20°C.  However, the DNA stability is dependent upon storage conditions.  The data is available here under Additional Resources.

 

FAQ ID -1317
Do you have a protocol for the isolation of genomic DNA from frozen clotted blood?

Yes, we have the following protocols:

  • Isolation of genomic DNA from frozen clotted whole blood using the QIAGEN Genomic-tip 100/G (QG02). TEST

You will need to prepare the required buffers according to the recipes in Appendix A of the QIAGEN Genomic DNA Handbook, or you can purchase the Genomic DNA Buffer Set containing pre-made solutions. Alternatively, the QIAGEN Blood & Cell Culture Midi Kit, containing Genomic-tips 100/G and buffers, can be used.

  • Purification of archive-quality DNA from clotted whole blood using Clotspin Baskets and the Gentra Puregene Blood Kit (PG03).
  • Purification of archive-quality DNA from clotted whole blood using the Gentra Puregene Tissue Kit or Gentra Puregene Mouse Tail Kit (PG04).
  • Purification of DNA from clotted blood using the FlexiGene DNA Kit (FG01).
FAQ ID -900. Test
What is the composition of Buffer FG3?
Buffer FG3, the hydration buffer supplied in the FlexiGene DNA Kit, is a 10 mM Tris-Cl solution at pH 8.5.
FAQ ID -356
Does the Epitect Bisulfite Kit also work on DNA extracted from plants?

Bisulfite conversion of unmethylated cytosines into uracils with the EpiTect Bisulfite Kit works on DNA irrespective of the source organism. The DNA template needs to be of high purity for efficient conversion. We recommend to use genomic DNA extracted with our DNA isolation kits for clinical or animal and plant samples as a template for the EpiTect Bisulfite Kit.

FAQ ID -1209