NGS-seq
Next Generation Sequencing

Entschlüssen Sie die Komplexität des Genoms mit DNA-Seq-Lösungen

Ob Sie an der Entdeckung von DNA-Varianten oder der Identifizierung bekannter und neuartiger RNA-Fusionen interessiert sind – komplexe Workflows, lange Bearbeitungszeiten und begrenzte Probenmengen können den Fortschritt behindern, die Kosten steigern und die Gewinnung hilfreicher Daten verzögern. Unsere hochleistungsfähigen Technologien zur DNA-Sequenzierung (DNA-Seq) wurden speziell optimiert, um derartige Hürden zu überwinden, damit Sie GC-reiche Regionen zuverlässig sequenzieren, seltene Varianten präzise identifizieren und Proben von schlechter Qualität oder in geringer Menge bestmöglich nutzen können. Sollten Sie benutzerdefinierte Panels benötigen, helfen Ihnen unsere Experten gerne bei einem intelligenten Panel-Design.

Genom-Einblicke, ermöglicht durch QIAseq

Die QIAseq-Lösungen basieren auf den folgenden Innovationen, um systematische Messabweichungen zu minimieren und Genomabdeckung, Einheitlichkeit und Präzision zu maximieren.

QIAseq Tumor Mutational Burden Panels
Amplikon-Sequenzierung neu definiert: Finden Sie mit gezielter DNA-Seq die entscheidende Variante

PCR-Duplikate, falsch Positive und Library Bias können die Qualität der Daten Ihrer gezielten Sequenzierung beeinträchtigen. Machen Sie Ihren Workflow präziser und zuverlässiger, indem Sie die digitale DNA-Sequenzierung implementieren.

Unsere plattformunabhängigen, von Experten entworfenen, gezielten Panels zur DNA-Sequenzierung nutzen eindeutige molekulare Indizes für eine überragende Abdeckung von:

  • GC-reichen Genomregionen
  • Exon-Regionen von Genen
  • Hotspots
  • SNPs
  • Intron- und Promoter-Regionen
Fehler oder seltene Mutation?

Die gezielte DNA-Sequenzierung mit Panels ist ein leistungsstarker Ansatz für den Nachweis seltener Varianten. Ein wesentlicher Nachteil besteht darin, dass alle DNA-Fragmente vollkommen identisch aussehen, was es nahezu unmöglich macht, Sequenzierungsfehler von einzigartigen DNA-Molekülen zu unterscheiden. Dies schränkt Ihre Fähigkeit ein, seltene DNA-Varianten zuverlässig nachzuweisen. Nicht jedoch mit QIAseq – alle Katalog- und benutzerdefinierten Panels enthalten einmalige molekulare Indizes, die das Ursprungs-DNA-Molekül markieren und falsche Ergebnisse durch PCR-, Polymerase- und Gerätemessfehler eliminieren.

Next-generation sequencing
Next-generation sequencing
Erreichen Sie die schwierigsten Genomregionen

Zu den QIAseq Produkten zählen auch optimierte Puffer zur Amplifikat-Sequenzierung sowie Enzyme, die Ihnen Zugang zu selbst den schwierigsten Genomregionen verschaffen. Die Chemie, die bei den QIAseq Targeted DNA Panels und dem entsprechenden Workflow zum Einsatz kommt, ist sowohl mit gewöhnlichen als auch mit GC-reichen Genomregionen kompatibel. Erreichen Sie mithilfe von Tiling-Methoden eine Abdeckung von 100 % für GC-reiche Gene wie CEBPA und CCND1.

Herausragende Sequenzierungsmetriken

Einheitlichkeit: Standard-Panels erreichen in der Regel eine Einheitlichkeit von 99,5 % bei 0,2x der mittleren Abdeckung und 96 % bei 0,5x der mittleren Abdeckung.

Sensitivität: Profitieren Sie von einer zuverlässigeren Bestimmung seltener DNA-Varianten. Standard-Panels können eine Sensitivität von über 90 % für 1 % NA12878 SNP und Indel in einer typischen codierenden Region mit weniger als 15 falsch Positiven pro Megabase Region erreichen.

Mehr Multiplexing: Die Produkte anderer Anbieter bieten Multiplexing mit 96 Proben. QIAseq geht noch weiter: Unter Anwendung QIAseq-spezifischer Indizes können 384 Proben multiplexiert werden.

Vorgestellte Erfolgsgeschichte

Dr. Fergus J Couch
„Die QIAseq Panels erreichen auch schwierige Genomregionen, da sie mit einer Single Primer Extension Design Strategie arbeiten. Es können bis zu 1500 Proben gleichzeitig sequenziert werden.“

Dr. Fergus Couch, Mayo Clinic

 

Single Primer Extension vs. Zwei-Primer-Amplikon-Ansatz
Ein direkter Vergleich gezielter Sequenzierungsmethoden zeigt, warum die Single-Primer-Extension(SPE)-Methode überlegen ist.
QIAseq BioX
Eine einzige, kombinierte Lösung für NGS und Datenanalyse

Kombinieren Sie die Präzision unserer QIAseq DNA Panels mit intuitiven bioinformatischen Tools. Die QIAseq DNA Panels umfassen jetzt auch Abonnement-Lizenzen für die CLC Genomics Workbench und QIAGEN Clinical Insight (QCI)-Interpret für die QIAseq Software, damit Sie noch leichter und schneller von der Datengenerierung zur Gewinnung von Erkenntnissen gelangen.

Weniger Probenverwechslungen und maximaler Durchsatz bei der Sequenzierung

Unique Dual Indices (UDI) bieten den höchstmöglichen Grad an Prozesssicherheit und gewährleisten zuverlässige Sequenzdaten, indem sie “Index Hopping” und die Fehlzuweisung von Reads vermindern. UDIs ermöglichen Ihnen, den Durchsatz bei der Sequenzierung zu maximieren – und das bei niedrigeren Sequenzierungskosten pro Probe. Durch Kombination aus UMIs und UDIs erreichen die QIAseq Targeted Panels einen beispiellosen Grad an Genauigkeit.
In Rekordzeit von der Probe zu Krankheitserkenntnissen

Eine optimierte Pipeline zur Exom-Sequenzierung mit reduzierter Bearbeitungszeit bringt Sie von der Probe zur standardisierten Variantenklassifizierung und -interpretation.

Automatisierbare und skalierbare Exomsequenzierung mit einem an einem Tag durchführbaren Workflow

Sie untersuchen das Exom auf krankheitsverursachende Varianten, sorgen sich aber wegen der GC-Zusammensetzung um die Einheitlichkeit der Abdeckung?

Mit unserem skalierbaren, automatisierungsfähigen und an einem Tag durchführbaren Workflow weisen Sie pathogene Varianten zuverlässig, einfach und effizient nach. Die auf der Hybrid-Capture-Technologie basierenden QIAseq Human Exome Kits gewährleisten:

  • Variantenbestimmung von Zielen > 500 Gene mit hoher Sensitivität
  • Reduzierung der Sequenzierungskosten um 50 % je Probe
  • Senkung der Gesamtbearbeitungszeit von Probe bis Daten um 40 %

Die nahtlose Integration mit der QIAGEN CLC Genomics Workbench ermöglicht eine schnelle Variantenbestimmung und QCI Translational sorgt für eine genaue Varianteninterpretation und krankheitsspezifische Erkenntnisse – ohne dass eine manuelle Kuration erforderlich ist.

Machen Sie sich ein umfassendes Bild vom Genom

Gesamtgenom- und Hybrid-Capture-Sequenzierung bieten einen ganzheitlichen Blick auf das gesamte Genom und einzigartige Einblicke, aber sie können mit zeit- und kostenintensiven Herangehensweisen verbunden sein. Die QIAseq-Lösungen machen diese Methodologien durch Maximierung der Datenqualität je Probe zugänglicher.

Profitieren Sie von:

  • Fortgeschrittene Chemien für Probeneingabemengen im Picogrammbereich und schnelle, automatisierbare Protokolle
  • Enzymatische DNA-Fragmentierung – macht kostspielige mechanische Scherprodukte überflüssig
  • Gesteigerte Ligationseffizienzen für hohe Konversionsraten und Ausbeuten – ohne Adapter-Dimere
  • Einheitliche G/C-Repräsentation für jeden Organismus
  • Praktischen Kit-Formaten mit integrierten, doppelt barcodierten Adaptern
QIAseq FX Library
Vorgestellte Erfolgsgeschichte

Dr. Egbert Schulze aus der Gemeinschaftspraxis für Endokrinologie und Nuklearmedizin, Heidelberg, diskutiert, wie der vollständig enzymbasierte QIAseq FX Workflow eine einheitliche Abdeckung ermöglicht und ihm beim Erzielen zuverlässiger Sequenzierungsergebnisse in seiner Forschung geholfen hat.

Entschlüsselung der mikrobiellen Vielfalt

Metagenomische Daten werden verwendet, um die in natürlichen oder gesunden Mikrobiomen vorhandenen Arten zu untersuchen, die Häufigkeit von Virulenz- oder Antibiotikaresistenzgenen zu ermitteln oder die Ursachen, Folgen und zukünftigen Therapien für eine Vielzahl von Erkrankungen zu beleuchten. Die QIAseq NGS-Lösungen wurden entwickelt, um die genomische Komplexität Ihrer Probe zu entschlüsseln – von der PCR-Amplifikat-Sequenzierung bis hin zur Gesamtmetagenomanalyse einer DNA-Probe.

Water Microbiome

Webinar-Highlights aus 2020

Kombinieren Sie beispiellose Expertise und Unterstützung mit unseren leistungsstarken QIAseq Technologien

Seien Sie Teil der genomischen Revolution! Arbeiten Sie mit QIAGEN zusammen und profitieren Sie von > 20 Jahren Erfahrung mit „Sample to Insight“ Lösungen . Unsere Genomik-Lösungen für Unternehmen erleichtern die Biomarker-Entdeckung von Panel-Design zu -Analyse und darüber hinaus – und treiben Ihre Forschung so weiter voran.

Alle Fotos wurden vor COVID-19 aufgenommen